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. 2018 Aug 2;11:546. doi: 10.1186/s13104-018-3647-4

Table 1.

Primer sequence for amplification of all coding regions of SLC26A4 gene for HRM mutations analysis

Exon Amplicon Primer sequence Amplicon size (bp)
1 Ex 1 5′-GGGTGGCCCCTGCGTGG-′3 257
5′-CTCACCTGTCTCTGCTCGC-′3
2 Ex 2-1 5′-CGTGTCCTCCCTCCTCGCT-′3 113
5′-GCGCCGCGACACCATGTAG-′3
Ex 2-2 5′-GCCGCAGCTCCCCGAGTA-′3 166
5′-TTCTCTCTACGCAGGCCCGC-′3
3 Ex 3 5′-GCTTTTTGACAGTTGT-′3 221
5′-CTATGGTAGCTGGGG-′3
4 Ex 4-1 5′-TGTAATCACTTTGCATG-′3 99
5′-GTCAGGATAGGGAAAA-′3
Ex 4-2 5′-ATGGTCTCTACTCTGC-′3 93
5′-GTAAAATATACTTATAATTACC-′3
5 Ex 5 5′-CTGATTAATTGTTAGAGACTT-′3 218
5′-CCTGTATAATTCCAACCAG-′3
6 Ex 6 5′-CGTAGTTGATATTTGGTGGC-′3 248
5′-GGCCCAGACTCAGAGAATG-′3
7 Ex 7 5′-GTGCTCGTGTGCGTGTAGC-′3 212
5′-CTTACCACAATTACTTCTATAGGAA-′3
8 Ex 8 5′-CATCTTTTGTTTTATTTCAG-′3 125
5′-CTAAGAGGAACACCACAC-′3
9 Ex 9 5′-CTAGGTTTTTGCCTCCTGAA-′3 185
5′-TATAAAACCAGTTCAGCAAAAGG-′3
10 Ex 10-1 5′-TTGGACCACCACGCAGAG-′3 208
5′-GACGGCCGTGCGGGAA-′3
Ex 10-2 5′-TTCTCTTGTTTTGTGGC-′3 161
5′-TTGTCCTGCTAAGCTC-′3
11 Ex 11 5′-CCTTTTCATAGGAGGTGTGTGTC-′3 133
5′-CGGTATGCAGAGAAGCAGG-′3
12 Ex 12 5′-CACAGCCTTCTCTGTCT-′3 146
5′-AATATAGGTGGTAGGTGACT-′3
13 Ex 13 5′-ATTTTTTTCCCTAGGT-′3 178
5′-AGGAAGCTCAGAGTGT-′3
14 Ex 14 5′-TTCCAAAATACGGCTGTTC-′3 154
5′-AGTCCAGCAAATGTCTCACA-′3
15 Ex 15 5′-TTGAAATTATTTAATCCCAGACAA-′3 179
5′-TCTCAAAAGAGGTTAGAAAACAAAT-′3
16 Ex 16 5′-TTGACATTTATTTCCAA-′3 141
5′-GGGGGAAAAGAAAGATGTC-′3
17 Ex 17-1 5′-GACAATTAAGTTGACAGTGTT-′3 182
5′-GGAACGTTCACTTTGACT-′3
17 Ex 17-2 5′-GTGGATTGGAACTCTGAGC-′3 150
5′-GTATAATTCAGAAAACCAGAACC-′3
18 Ex 18 5′-GAATTATGGGCAGATAAGG-′3 159
5′-GGCTTACGGGAAAGTCTT-′3
19 Ex 19-1 5′-TGAGCAATGATGCCAC-′3 247
5′-AACCTTGACCCTCTTGAG-′3
Ex 19-2 5′-GGTTCTTTGACGACAACA-′3 150
5′-AAAAGATACATCTGTAGAAAG-′3
20 Ex 20 5′-TGCTATTCTATTTCTACC-′3 142
5′-TTCAGAAGAAAATGATCAT-′3
21 Ex 21 5′-ATCAACACTTTGTTTTCC-′3 91
5′-TATTCCTTGCTCATAGAG-′3

Pb size on base pairs