Table II. Averaged TMT protein abundances (from at least three biological replicates) of the substrate mycelium (MII30h) and sporulating aerial mycelium (MII65h) compared to the MI stage (16 h). The MII/MI ratio is shown in logarithm (log 2) and linear forms. Cl, clusters of proteins with similar abundance profiles. N.S. Not significant (q-value higher than 0.01). (-) The significant value that did not pass the 2-fold threshold. The proteins discussed in the text are indicated. Only changes of more than 2-fold up or down-regulated are shown, except for cell division proteins.
| Category | SCO n° | Cl | Function | Log 2 (MII30h/MI) | Log 2 (MII65h/MI) | Fold-change (MII30h/MI) | Fold-change (MII65h/MI) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Secondary metabolism | SCO6286 | 4 | CPK repressor | 1 | 1.8 | 1.9 | 3.5 |
| SCO6276 | 3 | CPK biosynthesis | 2 | n.s. | 4 | n.s. | |
| SCO6277 | 3 | 1.9 | - | 3.8 | - | ||
| SCO6278 | 3 | 1.4 | n.s. | 2.7 | n.s. | ||
| SCO6279 | n.s. | 2.6 | 1.6 | 6 | 3 | ||
| SCO6282 | 3 | 2.7 | - | 6.5 | - | ||
| SCO6283 | 3 | 2.6 | - | 5,9 | - | ||
| SCO0489 | Coelichelin biosynthesis | 1 | −1.5 | 2 | 0.3 | ||
| SCO0492 | 3 | 1.1 | n.s. | 2.1 | n.s. | ||
| SCO0498 | 3 | 1.6 | - | 3 | - | ||
| SCO0499 | 3 | 1.2 | n.s. | 2.3 | n.s. | ||
| SCO5072 | 5 | ACT biosynthesis | n.s. | 3.6 | n.s. | 12.1 | |
| SCO5073 | 5 | n.s. | 2.7 | n.s. | 6.5 | ||
| SCO5074 | 5 | n.s. | 4.6 | n.s. | 24.2 | ||
| SCO5075 | 5 | n.s. | 2.2 | n.s. | 4.6 | ||
| SCO5077 | n.s. | - | 2.1 | - | 4.3 | ||
| SCO5078 | 5 | n.s. | 3 | n.s. | 8 | ||
| SCO5079 | 5 | - | 3.4 | - | 10.5 | ||
| SCO5080 | 5 | n.s. | 3 | n.s. | 8 | ||
| SCO5083 | 5 | n.s. | 1.9 | n.s. | 3.7 | ||
| SCO5084 | 5 | n.s. | 3 | n.s. | 8 | ||
| SCO5086 | n.s. | n.s. | 1.6 | n.s. | 3 | ||
| SCO5087 | 5 | n.s. | 1.9 | n.s. | 3.7 | ||
| SCO5088 | 5 | n.s. | 1.6 | n.s. | 3 | ||
| SCO5089 | n.s. | - | 2.1 | - | 4.3 | ||
| SCO5090 | 5 | n.s. | 2.4 | n.s. | 5.3 | ||
| SCO5091 | 4 | - | 1.6 | - | 3 | ||
| SCO0381 | 5 | Deoxysugar synthases | n.s. | 2.5 | n.s. | 5.8 | |
| SCO0382 | n.s. | - | 2.5 | - | 5.8 | ||
| SCO0383 | 5 | - | 2.7 | - | 6.3 | ||
| SCO0384 | 5 | n.s. | 2.4 | n.s. | 5.4 | ||
| SCO0385 | 5 | n.s. | 2.1 | n.s. | 4.3 | ||
| SCO0386 | 5 | - | 2.6 | - | 5.9 | ||
| SCO0387 | n.s. | - | 2.3 | - | 5 | ||
| SCO0388 | 5 | - | 2.8 | - | 7 | ||
| SCO0389 | 5 | - | 2.8 | - | 7 | ||
| SCO0391 | 5 | n.s. | 2.1 | n.s. | 4.2 | ||
| SCO0392 | 4 | - | 1.9 | - | 3.7 | ||
| SCO0393 | n.s. | 1 | 3.1 | 2 | 8.2 | ||
| SCO0394 | 5 | - | 3.3 | - | 9.6 | ||
| SCO0395 | n.s. | 1 | 3.1 | 2 | 8.7 | ||
| SCO0396 | 5 | - | 3.3 | - | 9.9 | ||
| SCO0398 | 5 | - | 2.7 | - | 6.4 | ||
| SCO0399 | 4 | 1.2 | 2.8 | 2.3 | 7 | ||
| SCO0400 | n.s. | - | 2.6 | - | 6.7 | ||
| SCO0401 | n.s. | - | 2 | - | 4 | ||
| Bald/whi Sap | SCO0409 | 5 | SapA | - | 1.7 | - | 3.2 |
| SCO1489 | n.s. | BldD | - | -1.5 | - | 0.3 | |
| SCO3323 | n.s. | BldN | 1.5 | 1.9 | 2.8 | 3.7 | |
| SCO3424 | 1 | BldB homologue | −1.8 | −1.8 | 0.3 | 0.3 | |
| SCO3579 | n.s. | WblA | 1.1 | 1.6 | 2.1 | 3 | |
| SCO4091 | n.s. | BldC | - | −1.8 | - | 0.3 | |
| SCO5112 | n.s. | BldKA | −1.1 | n.s. | 0.5 | n.s. | |
| SCO5240 | n.s. | WblE | - | −2.6 | - | 0.2 | |
| SCO5315 | 5 | WhiE ORFVI | n.s. | 1.6 | n.s. | 3 | |
| SCO5321 | 5 | WhiE ORFVIII | n.s. | 1.8 | n.s. | 3.5 | |
| SCO5723 | n.s. | BldB | - | 1.5 | - | 2.8 | |
| SCO5819 | n.s. | WhiH | - | 1.9 | - | 3.7 | |
| SCO3897 | 1 | Possible targets for bldA regulation | −1.4 | −2.7 | 0.4 | 0.2 | |
| SCO4301 | 4 | - | 1.5 | - | 2.8 | ||
| SCO6476 | n.s. | - | 1.4 | - | 2.6 | ||
| SCO6638 | n.s. | 1 | 1.3 | 2 | 2.5 | ||
| SCO6717 | n.s. | - | −1.4 | - | 0.4 | ||
| Cell divisiona | SCO1416 | 5 | SffA | n.s. | 0.8 | n.s. | 1.7 |
| SCO1662 | n.s. | ParJ | 0.33 | 0.55 | 1.3 | 1.5 | |
| SCO2077 | n.s. | DivIVA | n.s. | −0.9 | n.s. | 0.5 | |
| SCO2082 | 2 | FtsZ | −0.2 | −0.8 | 0.9 | 0.57 | |
| SCO2610 | 2 | MreC | n.s. | −0.7 | n.s. | 0.6 | |
| SCO3854 | 5 | CrgA | n.s. | 1.4 | n.s. | 2.6 | |
| SCO3886 | n.s. | ParA | −0.3 | −0.6 | 0.8 | 0.7 | |
| SCO3887 | 2 | ParB | n.s. | −0.3 | n.s. | 0.8 | |
| SCO3904 | 4 | FemX | n.s. | 0.57 | n.s. | 1.48 | |
| SCO4114 | n.s. | Sporulation associated protein | 0.4 | 0.2 | 1.3 | 1.1 | |
| SCO4439 | n.s. | DD-CPase | −0.4 | −0.7 | 0.8 | 0.6 | |
| SCO5556 | 1 | HupS | −2 | −1.7 | 0.25 | 0.3 | |
| SCO5577 | n.s. | SmC | n.s. | 0.6 | n.s. | 1.5 | |
| Regulatory | SCO1468 | 5 | Putative Serine/Threonine protein kinase | n.s. | 1.9 | n.s | 3.8 |
| SCO1596 | n.s. | OhkA | - | 1.5 | - | 2.8 | |
| SCO1628 | 4 | RarC | 1.6 | 3.1 | 3 | 8.6 | |
| SCO1629 | n.s. | RarB | - | 2.6 | - | 6.1 | |
| SCO1630 | 5 | RarA | - | 3 | - | 8 | |
| SCO2666 | n.s. | Putative Serine/Threonine protein kinase | n.s. | 1.3 | n.s. | 2.5 | |
| SCO3102 | 5 | PkaE | n.s. | 1.5 | n.s. | 2.8 | |
| SCO3360 | n.s. | Putative Serine/Threonine protein kinase | −1.1 | n.s. | 0.4 | n.s. | |
| SCO3621 | 5 | Putative Serine/Threonine protein kinase | n.s. | 1.1 | n.s. | 2.1 | |
| SCO3821 | n.s. | Putative Serine/Threonine protein kinase | −1.2 | −0.9 | 0.4 | 0.5 | |
| SCO4776 | n.s. | Putative Serine/Threonine protein kinase | 0.4 | 1.5 | 1.3 | 2.9 | |
| SCO4778 | n.s. | PkaI | 0.9 | 1.5 | 1.9 | 2.8 | |
| SCO4069 | n.s. | SarA | - | 1.5 | - | 2.8 | |
| SCO4118 | 4 | AtrA | - | 1.1 | - | 2.1 | |
| SCO4190 | 5 | DevA | n.s. | 1.3 | n.s. | 2.5 | |
| SCO4325 | n.s. | CspB | - | −2.2 | - | 0.2 | |
| SCO4647 | n.s. | NusG | - | -1.9 | - | 0.3 | |
| SCO5582 | 4 | NsdA | - | 1.1 | - | 2.1 | |
| SCO6265 | n.s. | ScbR | 1.6 | 1.5 | 3 | 2.8 | |
| Unknown | SCO5191 | 1 | Hypothetical protein | −3.4 | −3 | 0.09 | 0.12 |
| SCO6650 | 5 | Hypothetical protein | n.s. | 4.8 | n.s. | 27.8 | |
| Translation/protein folding | SCO1491 | n.s. | Elongation factor | - | −2.3 | - | 0.2 |
| SCO1804 | 5 | tRNA ribosyltransferase-isomerase | n.s. | 2.9 | n.s. | 7.4 | |
| SCO2620 | 2 | Trigger factor chaperone | - | −1.8 | - | 0.8 | |
| SCO4648 | 1 | Ribosomal protein | −1.3 | −2.2 | 0.4 | 0.2 | |
| SCO4725 | 2 | Translation initiation | - | −1.9 | - | 0.3 | |
| SCO4734 | 1 | Ribosomal protein | −1.2 | −2.2 | 0.4 | 0.2 | |
| Energy production | SCO0922 | 3 | Succinate deshydrogenase | 2.1 | n.s. | 4.2 | n.s. |
| SCO0923 | 3 | Succinate deshydrogenase | 2.5 | n.s. | 5.5 | n.s. | |
| SCO4563 | 5 | NADH dehydrogenase | n.s. | 2.4 | n.s. | 5.1 | |
| SCO4564 | 5 | NADH dehydrogenase | n.s. | 3.2 | n.s. | 9.4 | |
| SCO4566 | 5 | NADH dehydrogenase | n.s. | 2.6 | n.s. | 6.1 | |
| SCO5107 | 5 | Succinate deshydrogenase | n.s. | 2.6 | n.s. | 6.2 | |
| Catabolism | SCO1640 | 4 | Proteasome protein | 1.2 | 2.8 | 2.6 | 7 |
| SCO1643 | 4 | Proteasome protein | - | 1.9 | - | 3.7 | |
| SCO1646 | n.s. | Proteasome protein | - | 2.2 | - | 4.7 | |
| SCO5443 | 5 | Alpha-amylase | n.s. | 2.2 | n.s. | 4.7 | |
| SCO6411 | 5 | Hydrolase | - | 2 | - | 4 | |
| SCO6414 | 4 | Hydrolase | 1.2 | 2.3 | 2.3 | 4.9 |
aFor cell division proteins, variations inside the ±1 interval showing significant variations (q-value < 0.01), are shown.