Table 2. Classification of wheat AOX proteins using Arabidopsis AOX1a as reference.
Protein Name | Type 1 or Type 2 Residues | Type 1 (a-c/e) or Type 2(d) Residues | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
112 | 124 | 229 | 233 | 241 | 167 | 175 | 178 | 180 | 181 | 295 | |
TaAOX1a-2AL.sv1 | |||||||||||
TaAOX1a-2AL.sv2 | |||||||||||
TaAOX1a-2BL | |||||||||||
TaAOX1a-2DL.sv1 | |||||||||||
TaAOX1a-2DL.sv2 | |||||||||||
TaAOX1a-like-2DL | |||||||||||
regTaAOX-4BL.sv1 | |||||||||||
regTaAOX-4BL.sv2 | |||||||||||
regTaAOX-4BL.sv3 | |||||||||||
regTaAOX-4BL.sv4 | |||||||||||
put.regTaAOX-3B | |||||||||||
put.regTaAOX-6BL | |||||||||||
TaAOX1c-6AL | |||||||||||
TaAOX1c-6BL.sv1 | |||||||||||
TaAOX1c-6BL.sv2 | |||||||||||
TaAOX1c-6BL.sv3 | |||||||||||
TaAOX1c-6DL | |||||||||||
regTaAOX-3B | |||||||||||
put.TaAOX1e-3DS | |||||||||||
TaAOX1d-2AL.2.sv1 | |||||||||||
TaAOX1d-2AL.2.sv2 | |||||||||||
TaAOX1d-2AL.1 | |||||||||||
TaAOX1d-2DL | |||||||||||
put.TaAOX1d-like-4AS | |||||||||||
TuAOX1a* | |||||||||||
TuAOX1c* | |||||||||||
TuAOX1d.1* | |||||||||||
TuAOX1d.2* | |||||||||||
AetAOX1a* | |||||||||||
AetAOX1e* | |||||||||||
AetAOX1d* | |||||||||||
AetAOX1d-like* | |||||||||||
ne.TaAOX1d-2BL.1 | |||||||||||
ne.TaAOX1d-2BL.2 | |||||||||||
ne.TaAOX1d-2DL | |||||||||||
ne.AesAOX1d* |
Residues used are from Costa et al. 2014. Blue indicates presence of Type 1 residues. Red indicates a Type 2 residue. Green indicates residues for monocot Type 1(d). Yellow indicates Type 1(a-c/e). Purple represents amino acid residues that did not match either classification. Black represents residues that were absent.
*Denotes diploid wheat AOX proteins.