Table 2.
Statistical shift in core genome.
Factor | Organism | Non-core mean | Core mean | p-value |
---|---|---|---|---|
Expression | L. acidophilus | 1.97 | 2.782 | <0.0001 |
L. amylovorus | 1.961 | 2.812 | <0.0001 | |
L. bulgaricus | 2.022 | 2.803 | <0.0001 | |
L. crispatus | 1.732 | 2.774 | <0.0001 | |
L. gasseri | 1.929 | 2.846 | <0.0001 | |
L. helveticus | 2.117 | 2.758 | <0.0001 | |
GC content | L. acidophilus | 34.21% | 36.94% | <0.0001 |
L. amylovorus | 38.46% | 40.08% | <0.0001 | |
L. bulgaricus | 50.65% | 51.77% | <0.0001 | |
L. crispatus | 36.84% | 39.10% | <0.0001 | |
L. gasseri | 34.81% | 36.30% | <0.0001 | |
L. helveticus | 36.21% | 38.40% | <0.0001 | |
CAI | L. acidophilus | 0.795 | 0.78 | <0.0001 |
L. amylovorus | 0.739 | 0.788 | <0.0001 | |
L. bulgaricus | 0.793 | 0.831 | <0.0001 | |
L. crispatus | 0.768 | 0.782 | <0.0001 | |
L. gasseri | 0.808 | 0.808 | 0.5534 | |
L. helveticus | 0.799 | 0.805 | 0.0005 | |
Length | L. acidophilus | 930 | 1017 | 0.0102 |
L. amylovorus | 862 | 1019 | <0.0001 | |
L. bulgaricus | 867 | 1007 | <0.0001 | |
L. crispatus | 878 | 1019 | <0.0001 | |
L. gasseri | 937 | 1018 | 0.0166 | |
L. helveticus | 820 | 1003 | <0.0001 |