Table 2.

Oligonucleotides used in this study.

Oligonucleotides	Nucleotide sequences (5’ to 3’)a	Restriction recognition site
RBS GroF	TCTTCAAAAAGGTTTGTTAATGACGC	None
RBS GroR	AGCACATTTTTAGGGATAAGTCAAGC	None
RBS hrc F	CGATTTTTCTTTAAAGTTTAGTCTGTATCAC	None
Phrc F	ATATGGATCCTACGTCAAGCAAGCGATAACTTTAC	None
HBS CbpF	AATTCCTTTTAATTGCACTGAAACGGG	None
HBS CbpR	GGTATAAACTCTTGCTCATGAATCACC	None
HBS speAF	CCACGAAGCCCTTGTTTTTGC	None
HBS speAR	CGCTAAATTCCGTAGGGTGC	None
Mut1 F	GATCCAAAATAGTTTTATTAGAATACTATCATAAATCAGGTACCTTAGTCAATCAAGTTTATTGATAATGTTTAGTGGTAATTGAGATTTG	None
Mut1 R	GTTTTATCAAAATAATCTTATGATAGTATTTAGTCCATGGAATCAGTTAGTTCAAATAACTATTACAAATCACCATTAACTCTAAACTTAA	EcoRI
Mut2 F	AGTCGACAGTTTATTGATAATGTTTAG	SalI
Mut2 R	CTAACACTAAAGATTTATGATAGTATTC	None
MUTD2R	CTAAGGTACCTGATTTATGATAGTATTC	KpnI
Mut3 F	GATCCAAAATAGTTTTATTAGAATACTATCATAAATCTTTAGTGGAGCTCAATCAAGTTTATTGATAATGTTTAGTGGTAATTGAGATTTG	None
Mut3 R	GTTTTATCAAAATAATCTTATGATAGTATTTAGAAATCACCTCGAGTTAGTTCAAATAACTATTACAAATCACCATTAACTCTAAACTTAA	None
Mut4 F	GATCCAAAATAGTTTTATTAGAATACAGGTACCAATCTTTAGTGTTAGTCAATCAAGTTTATTGATAATGTTTAGTGGTAATTGAGATTTG	None
Mut4 R	GTTTTATCAAAATAATCTTATGTCCATGGTTAGAAATCACAATCAGTTAGTTCAAATAACTATTACAAATCACCATTAACTCTAAACTTAA	None
Mut5 F	GATCCAAAATAGTTTTATTAGAATACTATCATAAATCTTTAGTGTTAGTCAATCAAGTTTTAGTCGACTGTTTAGTGGTAATTGAGATTTG	None
Mut5 R	GTTTTATCAAAATAATCTTATGATAGTATTTAGAAATCACAATCAGTTAGTTCAAAATCAGCTGACAAATCACCATTAACTCTAAACTTAA	None
LuxF	ATATGGATCCCAGGCTTGGAGGATACGTATGAC	BamHI
LuxR	ATATGGATCCGGCATTCGGTAATATATGCGC	BamHI
LuxRTF	ATCATCCGATAACGCGCTCTT	None
LuxRTR	ACCGCCCAATTAATCGCATC	None
cbpEco	ATATGAATTCAATTCCTTTTAATTGCACTGAAACGGG	EcoRI
cbpBam	ATATGGATCCGGTATAAACTCTTGCTCATGAATCACC	BamHI
cbpRTRev	TTTAGCTAGGCAATACCACCCGGA	None
hspRC	ATATATCTCGAGTTTTTTAAATAAAATCAGTTCATA	XhoI
cys-F	CGTTTTAGGGACTTTGGGAGG	None
vacA-R	GCTGGTTTTATGCTCTAAACTGG	None
ppk RT-F	CGCGCCTTTCTAAATTTCTGGGCA	None
ppk RT-R	CCCAAGTCAAAGGCTTGAGCGAAA	None

^aNucleotides added to reconstitute the indicated restriction recognition sites are underlined.