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. 2018 Aug 12;2018:3248285. doi: 10.1155/2018/3248285

Table 2.

Primers used in the panel along with their structures.

Primer set Primer name Sequence 5'-3'
1 ebola_f GCAATGTTCAAACACTTTGTGARGC
ebola_r CTTAACACCATAGCAACGGTTR

2 marburg_f TGGACGATAGGAAATCGAGCAC
marburg_r TGAACTATRTTGCCTGAGTAGTGWG

3 cueva_f GTGCCAGAACAGTTTGAACTCA
cueva_r CCGAATTCTCTGGGTAACACAA

4 mammarena_f CAATMCTTGAYATGGGWCARGG
mammarena_r WGATTTRAACTCTGCAACAAAYCTR

5 lyssa_f CTKGAYTATGARAARTGGAACA
lyssa_r TATGTCGGRCAYARAACCTGRT

6 ledante_f AAYAATACATGGCCCACWCC
ledante_r ARTATTCTCTMARMKCCCARGACAT

7 alphacorona_f GGYACHACHTCWGGTGATGS
alphacorona_r GYTTACGYARRTAACCAWAAWABTC

8 betacorona_f GTGCWAAGAATAGAGCYCGCAC
betacorona_r RTCACAYTTWGGRTAATCCCAACCC

9 gammacorona_f CCACATCTGCTAATGTTGCR
gammacorona_r CAGAAATRTCWGCTACAAGACCYTG

10 orbi_f1 TACCGCARGATMGWATGATGAT
orbi_f2 TATGTTCCWCARGATCGRATGATG
orbi_r TGCGCTCCAWAVCCATTCCA

11 orthoreo_f GTYTCGGCGCCYCAYACDYT
orthoreo_r GCAGTRTGCTCAGTDGARGT

12 seadorna_f CCRCATGAYGTHATGGCYCC
seadorna_r TCACCWGACTTAACWCCWGM

13 henipa_f GGTCAGARACWYTGGTGGAYGA
henipa_r ARTAYGGATCACTRGCCCARTC

14 phlebo_f GATTYAATCTSTKSARRGCY
phlebo_r YTATYWGYTCCAYCCAGTYYTC

15 hanta_f GCWGATGCAACWAARTGGTC
hanta_r YARRTTYCCYTGYARCCART

16 nairo_f CCTTCTTTTSHGGYATGATGCA
nairo_r GAAGTTAACACTGNCGAWGTWGCATG

17 orthobunya_f CWGAWGARATGATWWSTGARCCWGG
orthobunya_r GCACTCCATTTWGACATRTCWG

18 thogoto_f ATCAARGAYMRRCTGAARAANA
thogoto_r TCGATSYGMGGCTTTATDGM

19 cardio_f MRGGYATGGAYCCMATGGAV
cardio_r AAGTTRGARTARTCYACATCRTAGA

20 parecho_f GGRATYAACCCATAYAARGAYTGGC
parecho_r GAYCCTGATGGCATACCRCC

21 flavi_f CTSCTKTGTGACATMGGDGA
flavi_r TACATCTCRTGYGTGGARTTBC

22 alpha_f ACWCTGTTTGTSAACACWGTVRTYA
alpha_r CTYTTYARRGGGTCTGCSACHC