Table 1.
Gene | mutation | Tumors from mice that were used for exome sequencing | Tumors from other mice | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Spontaneous | GBE | MEG | Spontaneous | GBE | MEG | ||||||||
Sanger (n=3) |
Exome-Seq, FF (n=3) |
Exome-Seq, PE (n=3) |
Sanger (n=4) |
Exome-Seq, FF (n=4) |
Exome-Seq, PE (n=4) |
Sanger (n=3) |
Exome-Seq, FF (n=3) |
Exome-Seq, PE (n=3) |
Sanger (n=10) |
Sanger (n=10) |
Sanger (n=7) |
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Ctnnb1 | Q28L | 1 | |||||||||||
D32N | 1 | 1 | 1 | ||||||||||
D32H | 1 | ||||||||||||
D32Y | 1 | 1 | |||||||||||
G34R | 1 | ||||||||||||
T41A | 1 | 1 | |||||||||||
T41L | 2 | ||||||||||||
T42P | 1 | ||||||||||||
S45F | 1 | ||||||||||||
Δ5-13 | 1 | ||||||||||||
Δ5-26 | 1 | ||||||||||||
Hras | Q61L | 1 | 1 | 1 | |||||||||
Q61K | 2 | 2 | 2 | 6 | 2 | ||||||||
Q61R | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
Abbreviations: GBE, ginkgo biloba extract; MEG, methyleugenol; FF, exome sequencing for fresh frozen tissue; PE, exome sequencing for formalin-fixed paraffin-embedded tissue