Table 3.

Population Differentiation

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18
1: Buffalo camp
2: Yaounde Mokolo	0.09
3: Yaounde Mvog	0.05	0.07
4: Yaounde Center	0.08	0.07	0.06
5: Yaounde Forest	0.03	0.08	0.04	0.08
6: Yaounde Village	0.02	0.08	0.04	0.07	0.01
7: Burkina Faso	0.03	0.07	0.04	0.07	0.04	0.03
8: Luanda Angola	0.20	0.19	0.17	0.19	0.20	0.19	0.18
9: Goudiry	0.15	0.16	0.13	0.15	0.14	0.13	0.13	0.15
10: Sedhiou	0.13	0.15	0.12	0.15	0.11	0.11	0.11	0.20	0.16
11: Johannesburg	0.22	0.26	0.23	0.24	0.22	0.21	0.22	0.22	0.27	0.27
12: Kahawa Sukari	0.06	0.11	0.07	0.10	0.06	0.05	0.07	0.19	0.16	0.14	0.18
13: Kaya Forest	0.28	0.30	0.27	0.28	0.28	0.27	0.26	0.23	0.29	0.31	0.22	0.25
14: Nairobi	0.18	0.20	0.19	0.20	0.18	0.17	0.17	0.17	0.22	0.23	0.07	0.15	0.20
15: Lope Forest	0.06	0.11	0.08	0.11	0.06	0.05	0.07	0.20	0.17	0.15	0.16	0.07	0.25	0.14
16: Lope Village	0.05	0.09	0.07	0.09	0.05	0.04	0.06	0.18	0.15	0.14	0.15	0.06	0.23	0.13	0.01
17: Franceville	0.08	0.13	0.10	0.12	0.09	0.08	0.09	0.19	0.19	0.17	0.13	0.08	0.23	0.12	0.05	0.04
18: Lunyo	0.07	0.11	0.08	0.11	0.06	0.06	0.07	0.21	0.17	0.15	0.23	0.08	0.29	0.20	0.10	0.08	0.11
19: Zika	0.04	0.09	0.06	0.09	0.04	0.04	0.05	0.20	0.15	0.13	0.20	0.05	0.26	0.17	0.07	0.06	0.09	0.05

Pairwise Fst values between African populations of Ae. aegypti as estimated based on the panel of ~17K SNPs, using Arlequin. All values are significant at significance level 0.05.