Table 4. Functional annotations of Phytophthora cactorum RxLR candidates.

Orthogroup assignment shows conservation of these genes throughout Phytophthora spp. Numbers of genes in each orthogroup are shown for P. cactorum (Pcac), P. parasitica (Ppar), P. infestans (Pinf), P. capsici (Pcap) and P. sojae (Psoj).

RxLR gene ID	Orthogroup	Orthogroup contents	Notable annotations
g553.t1	OG0004128	Pcac(1):Pinf(1):Ppar(1):Pcap(1):Psoj(1)	Leucine-rich repeat domain (IPR032675)
g1729.t1	OG0004656	Pcac(1):Pinf(1):Ppar(1):Pcap(1):Psoj(1)	Conserved regions 1–4 of stealth proteins (PF17101, PF11380, PF17102 & PF17103)
g2445.t1	OG0004967	Pcac(1):Pinf(1):Ppar(1):Pcap(1):Psoj(1)	Ryanodine receptor domain (IPR003032)
g2934.t1	OG0001997	Pcac(2):Pinf(3):Ppar(2):Pcap(0):Psoj(0)	CAZY:GT44
g4805.t1	OG0005907	Pcac(1):Pinf(1):Ppar(1):Pcap(1):Psoj(1)	Concanavalin A-like lectin/glucanase domain (IPR013320)
g5243.t1	OG0011620	Pcac(1):Pinf(0):Ppar(1):Pcap(1):Psoj(1)	SMP-30/Gluconolaconase/LRE-like region (PF08450)
g7310.t1	OG0011769	Pcac(1):Pinf(1):Ppar(1):Pcap(0):Psoj(1)	RanBP2-type Zinc finger domain (IPR001876)
g8318.t1	OG0000314	Pcac(6):Pinf(5):Ppar(5):Pcap(5):Psoj(4)	NUDIX hydrolase domains (IPR000086)
g10092.t1	OG0000314	Pcac(6):Pinf(5):Ppar(5):Pcap(5):Psoj(4)	NUDIX hydrolase domains (IPR000086)
g12307.t1	OG0000363	Pcac(5):Pinf(3):Ppar(7):Pcap(3):Psoj(5)	Intradiol ring-cleavage dioxygenase domain (IPR000627)
g13307.t1	OG0000351	Pcac(5):Pinf(3):Ppar(10):Pcap(2):Psoj(3)	CAZY:GT54
g13922.t1	OG0000571	Pcac(3):Pinf(6):Ppar(3):Pcap(4):Psoj(1)	CAZY:CE2
g14748.t1	OG0016955	Pcac(1):Pinf(0):Ppar(0):Pcap(0):Psoj(0)	Cytochrome P450 domain (IPR001128)
g16698.t1	OG0000532	Pcac(3):Pinf(5):Ppar(5):Pcap(3):Psoj(2)	CAZY:GT44
g19791.t1	OG0012635	Pcac(1):Pinf(1):Ppar(1):Pcap(0):Psoj(1)	Lipid-binding start domain (IPR023393)
g23189.t1	OG0018641	Pcac(1):Pinf(0):Ppar(0):Pcap(0):Psoj(0)	CAZY:GT2, GT41