Table 4.

Comparison statistics of computational B-cell epitope prediction method.

Method	AUC	Accuracy	TPR	FPR	Precision	Specificity
Default software cutoff statistics
ABCpred	0,5382	0,4384	0,6516	0,5752	0,0906	0,4248
Bepipred	0,4450	0,5655	0,2860	0,3961	0,1356	0,6039
Labimq	0,5407	0,6175	0,4080	0,3266	0,2333	0,6734
TEPRF	0,5297	0,4972	0,5714	0,5121	0,1097	0,4879
Cutoffs that maximize precision
ABCpred	0,5525	0,5116	0,6275	0,5224	0,2041	0,4776
Bepipred	0,4825	0,5556	0,3976	0,4326	0,2117	0,5674
Labimq	0,5996	0,7210	0,4052	0,2059	0,3157	0,7941
TEPRF	0,5878	0,3790	0,9896	0,8140	0,2407	0,1860
Cutoffs that maximize Area Under the Curve
ABCpred	0,6542	0,6722	0,6617	0,3534	0,1255	0,6466
Bepipred	0,5499	0,6650	0,3799	0,2802	0,1443	0,7198
Labimq	0,6306	0,7876	0,4189	0,1577	0,2852	0,8423
TEPRF	0,6330	0,4912	0,8464	0,5805	0,1742	0,4195