Appendix 1—table 7. Population specific estimates for GRS.

Allele frequencies were collected from gnomAD (version 2.0.1). GRS weights were taken from UKBB summary statistics. The estimate for population specific GRS follows from weighting the allele frequencies with log-odds. The final values were scaled with a factor two to make them comparable with SNP dosage-based GRS. See Appendix-figure 6 for an explanation of the population acronyms.

rs-code	Chr	Pos	A	B	AF_AFR	AF_AMR	AF_ASJ	AF_EAS	AF_FIN	AF_NFE	AF_OTH
rs58415480	6	152562271	C	G	0.228	0.066	0.090	0.000	0.237	0.161	0.158
rs78378222	17	7571752	T	G	0.002	0.004	0.000	0.000	0.020	0.018	0.015
rs10835889	11	32370380	G	A	0.384	0.091	0.202	0.052	0.069	0.150	0.124
rs141379009	11	108149207	T	G	0.005	0.014	0.023	0.000	0.007	0.022	0.015
rs7027685	9	802228	A	T	0.535	0.602	0.357	0.738	0.556	0.413	0.462
rs2235529	1	22450487	C	T	0.029	0.313	0.046	0.484	0.164	0.158	0.171
rs72709458	5	1283755	C	T	0.139	0.137	0.183	0.134	0.221	0.188	0.180
rs2207548	11	32368744	C	A	0.553	0.228	0.393	0.179	0.321	0.411	0.378
rs2736100	5	1286516	C	A	0.550	0.597	0.477	0.606	0.507	0.504	0.539
rs507139	11	225196	G	A	0.028	0.058	0.079	0.007	0.094	0.072	0.084
rs62323680	4	54546192	G	A	0.020	0.032	0.099	0.002	0.045	0.070	0.060
rs2853676	5	1288547	T	C	0.765	0.801	0.613	0.856	0.783	0.739	0.763
rs10975820	9	684160	G	A	0.669	0.397	0.212	0.586	0.257	0.171	0.255
rs10936600	3	169514585	A	T	0.094	0.406	0.195	0.539	0.274	0.249	0.267
rs6928363	6	152546094	G	A	0.692	0.693	0.541	0.851	0.575	0.508	0.568
rs7986407	13	41179798	A	G	0.446	0.459	0.277	0.739	0.384	0.311	0.367
rs144444583	6	152684585	T	C	0.050	0.045	0.044	0.006	0.230	0.139	0.155
rs143835293	3	197623337	A	G	0.000	0.004	0.003	0.000	0.015	0.002	0.006
rs12832777	12	46831129	T	C	0.918	0.740	0.762	0.902	0.651	0.675	0.669
rs7120483	11	32406983	G	C	0.242	0.087	0.152	0.025	0.074	0.112	0.098
rs4988023	11	108168995	A	C	0.022	0.044	0.142	0.006	0.236	0.146	0.149
rs733381	22	40669648	A	G	0.095	0.471	0.169	0.247	0.258	0.216	0.239
rs66998222	16	51481596	G	A	0.033	0.138	0.265	0.001	0.166	0.213	0.167
rs6904757	6	152593102	A	G	0.443	0.579	0.401	0.625	0.379	0.392	0.401
rs2202282	4	70634441	C	T	0.230	0.549	0.420	0.726	0.437	0.491	0.466
rs10929757	2	11702661	A	C	0.116	0.505	0.556	0.517	0.674	0.591	0.556
rs9669403	12	46798900	G	A	0.615	0.476	0.406	0.266	0.396	0.382	0.369
rs11031783	11	32459923	C	A	0.262	0.364	0.288	0.748	0.197	0.204	0.241
rs114680331	9	815682	T	C	0.065	0.178	0.067	0.128	0.190	0.115	0.133
rs117245733	13	40723944	G	A	0.001	0.004	0.003	0.000	0.030	0.024	0.027
rs2553772	11	35085453	T	G	0.342	0.656	0.600	0.769	0.524	0.544	0.569
rs2456181	5	176450837	C	G	0.796	0.355	0.533	0.481	0.500	0.511	0.505
rs4742448	9	826585	C	G	0.838	0.629	0.473	0.785	0.548	0.471	0.503
rs2277163	9	827224	A	G	0.959	0.858	0.964	0.825	0.966	0.948	0.954
rs4870084	6	152543949	C	T	0.100	0.421	0.175	0.188	0.234	0.211	0.238
rs1265164	10	105674854	A	G	0.469	0.891	0.825	0.985	0.890	0.863	0.873
rs75510204	6	152592680	T	G	0.002	0.002	0.000	0.000	0.015	0.011	0.011
rs11246003	11	213723	T	G	0.060	0.047	0.033	0.149	0.022	0.035	0.038
rs138821078	9	674217	C	G	0.002	0.004	0.000	0.000	0.017	0.025	0.014
rs59021565	11	107999907	C	G	0.038	0.112	0.119	0.049	0.050	0.086	0.054
rs2092315	1	22507684	C	T	0.132	0.323	0.242	0.504	0.200	0.243	0.210
rs12223381	11	108354102	C	T	0.413	0.606	0.477	0.444	0.390	0.414	0.457
rs11674184	2	11721535	T	G	0.259	0.476	0.334	0.414	0.403	0.384	0.389
rs5930554	X	131312089	T	C	0.752	0.174	0.296	0.104	0.320	0.319	0.311
rs5937008	X	70093038	C	T	0.145	0.383	0.414	0.563	0.486	0.520	0.485
rs5933158	X	131578034	A	G	0.710	0.588	0.500	0.686	0.650	0.605	0.741
rs5936989	X	70022420	T	A	0.742	0.888	0.767	0.994	0.677	0.778	0.810
rs5975338	X	131626317	A	G	0.409	0.103	0.099	0.091	0.161	0.145	0.151
rs7059898	X	70149078	C	A	0.143	0.167	0.355	0.001	0.340	0.342	0.276
rs7888560	X	131171122	A	G	0.142	0.090	0.199	0.000	0.244	0.217	0.201
rs67751869	4	54568834	T	C	0.085	0.030	0.099	0.022	0.053	0.062	0.067
rs6901631	6	152567047	T	C	0.256	0.249	0.182	0.122	0.102	0.120	0.127
rs10415391	19	22652436	C	T	0.202	0.074	0.110	0.225	0.130	0.107	0.144
rs1735537	3	128122820	T	C	0.523	0.385	0.262	0.425	0.249	0.251	0.288
rs62132801	19	49267882	A	T	0.013	0.070	0.053	0.009	0.112	0.103	0.092
rs17631680	2	67090367	T	C	0.018	0.061	0.050	0.001	0.100	0.102	0.082
rs11790408	9	876418	G	T	0.110	0.307	0.387	0.246	0.355	0.380	0.353
					AFR	AMR	ASJ	EAS	FIN	NFE	OTH
GRS					4.718	4.059	4.068	4.196	4.168	4.091	4.116