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. 2018 Oct 11;5:74–90. doi: 10.1016/j.ibror.2018.10.001

Table 5.

Quantitative analysis of PCs in layer 5 of rat SSC.

L5_TPC:A L5_TPC:B L5_TPC:C L5_UPC t-test
(n = 60) (n = 38) (n = 33) (n = 30) TPC:A vs. TPC:B TPC:A vs. TPC:C TPC:A vs. UPC TPC:B vs. TPC:C TPC:B vs. UPC TPC:C vs. UPC
Soma Perimeter(μm) 83 ±2 85 ±2 71 ±4 68 ±3 ns < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 ns
Area(μm²) 450 ±17 471±17 317±33 326 ±29 ns < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 ns



Basal Dendrites Max horizontal extend (μm) 310 ±8 308 ±10 290 ±15 265 ±12 ns ns < 0.05 ns < 0.05 ns
Max vertical extend (μm) 252 ±8 268 ±12 247 ±12 274 ±20 ns ns ns ns ns ns
Den# 7±0.2 7±0.3 6±0.3 6±0.3 ns < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 ns
Length(μm) 3882 ±184 4299±210 2642 ±203 3034±220 ns < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 ns
Surface(μm²) 10,645 ±661 11,713 ±747 5689 ±477 7454 ±735 ns < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05
Volume(μm³) 2981 ±249 3285 ±285 1349±189 1889 ±264 ns < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 ns
Tree length (μm) 562 ±27 617 ±34 448 ±35 500 ±30 ns < 0.05 ns < 0.05 < 0.05 ns
Seg length (μm) 65 ±2 59 ±2 72 ±4 69 ±6 < 0.05 < 0.05 ns < 0.05 ns ns
Seg surface (μm²) 179 ±9 158 ±7 160 ±11 171 ±20 ns ns ns ns ns ns
Seg volume (μm³) 52 ±5 44 ±3 39 ±5 44 ±7 ns ns ns ns ns ns
Seg# 61 ±3 75 ±3 40 ±4 47 ±3 < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 ns
Tortuosity 1.28 ±0.01 1.25 ±0.01 1.28 ±0.01 1.28 ±0.01 < 0.05 ns ns ns ns ns
Max order 6±0.2 6±0.2 5±0.3 5±0.2 ns < 0.05 ns < 0.05 < 0.05 ns
Mean order 4±0.1 4±0.2 3±0.2 4±0.1 < 0.05 < 0.05 ns < 0.05 < 0.05 < 0.05
Max angles 55 ±1 57 ±1 53 ±1 57 ±2 ns ns ns ns ns ns
Planar angle 41 ±1 43 ±1 40 ±1 43 ±1 ns ns ns ns ns ns
Local angle 58 ±1 58 ±1 57 ±2 60 ±1 ns ns ns ns ns ns
Local spline angle 51 ±1 51 ±1 50 ±2 53 ±1 ns ns ns ns ns ns



Apical Dendrites Max horizontal extend (μm) 356 ±10 350 ±13 252 ±11 216 ±10 ns < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05
Max vertical extend (μm) 857 ±20 948 ±18 767 ±33 596 ±28 < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05
Length(μm) 7280±267 8512 ±290 3522 ±246 2787 ±225 < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05
Surface(μm²) 22,959±1117 26,835 ±1407 9177 ±884 7360 ±773 < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 ns
Volume(μm³) 8957±664 10,270 ±913 3151±549 2232 ±328 ns < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 ns
Seg length (μm) 69 ±2 66 ±3 77 ±3 75 ±5 ns < 0.05 ns < 0.05 ns ns
Seg surface (μm²) 219 ±11 201 ±10 202±17 204 ±20 ns ns ns ns ns ns
Seg volume (μm³) 87 ±8 73 ±5 66 ±11 63 ±9 ns ns < 0.05 ns ns ns
Seg# 111 ±6 145 ±11 52 ±6 42 ±4 < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 ns
Tortuosity 1.28 ±0.01 1.26 ±0.01 1.27 ±0.01 1.27±0.01 ns ns ns ns ns ns
Max order 21 ±1 23 ±1 15 ±1 14 ±1 ns < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 ns
Max angles 57 ±1 59 ±2 59 ±2 63 ±2 ns ns < 0.05 ns ns < 0.05
Planar angle 41 ±1 43 ±1 41 ±1 43 ±1 ns ns ns ns ns ns
Local angle 59 ±1 58 ±1 58 ±1 58 ±1 ns ns ns ns ns ns
Local spline angle 52 ±1 51 ±1 51 ±1 52 ±1 ns ns ns ns ns ns
Oblique# 12.5 ±0.5 12.8 ±0.6 10.3 ±1.0 12.2 ±0.8 ns ns ns < 0.05 ns ns



Axon Max horizontal extend (μm) 1003 ±64 1035 ±69 639±55 1104 ±78 ns < 0.05 ns < 0.05 ns < 0.05
Max vertical extend (μm) 1046 ±56 985 ±69 921 ±70 1107 ±61 ns ns ns ns ns < 0.05
Length(μm) 8704±604 9847 ±1154 5741±712 9079±923 ns < 0.05 ns < 0.05 ns < 0.05
Surface(μm²) 7680±1039 7898 ±800 3944±414 5360 ±887 ns < 0.05 ns < 0.05 < 0.05 ns
Volume(μm³) 1348 ±473 1012±108 459 ±73 453 ±118 ns ns ns < 0.05 < 0.05 ns
Seg length (μm) 107 ±4 95 ±4 106 ±6 125 ±5 < 0.05 ns < 0.05 ns < 0.05 < 0.05
Seg surface (μm²) 103 ±12 91 ±7 81 ±8 71 ±5 ns ns < 0.05 ns < 0.05 ns
Seg volume (μm³) 19 ±6 14 ±2 11 ±2 6 ±1 ns ns < 0.05 ns < 0.05 < 0.05
Seg# 84 ±6 99 ±10 54 ±6 75 ±9 ns < 0.05 ns < 0.05 ns < 0.05
Tortuosity 1.21 ±0.01 1.17 ±0.01 1.20 ±0.01 1.20±0.01 < 0.05 ns ns < 0.05 < 0.05 ns
Max order 12±0.5 12±0.5 10±0.5 12±0.7 ns < 0.05 ns < 0.05 ns < 0.05
Max angles 70 ±1 68 ±1 76 ±2 72 ±1 ns < 0.05 ns < 0.05 < 0.05 ns
Planar angle 46 ±1 45 ±1 50 ±1 47 ±1 ns < 0.05 ns < 0.05 < 0.05 ns
Local angle 60 ±1 58 ±1 61 ±1 58 ±1 ns ns ns ns ns ns
Local spline angle 54 ±1 51 ±1 54 ±1 52 ±1 < 0.05 ns ns < 0.05 ns ns
Boton density (#/100 μm) 15 ±1 16 ±1 21 ±1 21 ±1 ns < 0.05 < 0.05 < 0.05 < 0.05 ns