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. 2018 Nov 4;56(1):548–558. doi: 10.1080/13880209.2018.1499780

Table 3.

Species-specific nucleotide variation in the ITS region based on consensus sequences of different Uncaria species.

Species Position
    1 1 1 1 1 2 2 2 4 4 4 4 4 4 4 4 4 5 5 5 5 5 5 5 6 6 6 6 6
7 7 1 1 1 3 5 0 4 4 2 4 4 6 7 7 8 9 9 4 5 5 6 8 8 9 0 1 2 2 4
5 9 6 7 8 6 2 9 2 7 7 5 7 5 8 9 3 2 3 6 0 8 5 0 6 9 2 1 0 2 1
U. rhynchophylloides T G A C T T A T G G G G C T C C A C G C G T T C G T T T C
U. rhynchophylla . . . T C . G . . K . . . . . . . Y . . . . C . . . . . .
U. sinensis . . . . C . G . . A . . T . . . . . T . . . C . . . . . .
U. homomalla . . . . C . G . . . . . . . T . . . . . . . C . T . . . .
U. hirsuta . T . . C . G . A . . . . C . . . . . . . . C . . . . . .
U. sessilifructus . . C . C . G . . . T . . . . . M . . . C W . C A . . . . A
U. macrophylla C . . . C . G C . . . S . . . . . . . . . C C . . . . . .
U. laevigata . . R . C . G . . . . . . . . . G . . A . . C . . . . . .
U. lancifolia . . . . Y . G . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . .
U. lanosa . . . . C C G . . . . . . . . . . . . . . . C . . T C A .
U. scandens . . . . C . G . . . . . . . . T . . . . . . C . K . . . .
U. yunnanensis . . . . C C G . . . . . . . . . . . . . . . C . . T Y C A .

Degenerate nucleotides: R: A/G, Y: C/T, M: A/C, K: G/T, S: G/C, W: A/T. Nucleotide numbering starts from 5′-TTTCCG.