Table 2. Primers and conditions for Trypanosoma cruzi molecular typing.

Target	Primers	Sequence	Concentration	Termocycling
				D	A	E	C
SL-IR I and II	TCC TC2 TC1	CCCCCCTCCCAGGCCACACTG CCTGCAGGCACACGTGTGTG TCCGCCACCTCCTTCGGGCC	2 µM 2 µM 2 µM	94°C/1’ 94°C/30’’ 94°C/1’ 94°C/1’	67°C/1’ 65°C/1’ 63°C/1’ 61°C/1’	72°C/1’ 72°C/1’ 72°C/1’ 72°C/1’	5 5 5 30
24Sa-rDNA     First round     Second round	D76 D75 D76 D71	GGTTCTCTGTTGCCCCTTTT GCAGATCTTGGTTGGCGTAG GGTTCTCTGTTGCCCCTTTT AAGGTGCGTCGACAGTGTGG	0,5 µM 0,5 µM 0,5 µM 0,5 µM	94°C/1’ 94°C/1’ 94°C/1’ 94°C/1’	60°C/1’ 57°C/1’ 55°C/1’ 58°C/1’	72°C/1’ 72°C/1’ 72°C/1’ 72°C/1’	5 5 5 35
A10     First round     Second round	Pr1 P6 Pr1 Pr3	CCGCTAAGCAGTTCTGTCCATA GTGATCGCAGGAAACGTGA CCGCTAAGCAGTTCTGTCCATA CGTGGCATGGGGTAATAAAGCA	0,5 µM 0,5 µM 0,5 µM 0,5 µM	94°C/1’ 94°C/1’ 94°C/1’ 94°C/1’ 94°C/1’	60°C/1’ 57°C/1’ 55°C/1’ 58°C/1’ 65°C/1’	72°C/1’ 72°C/1’ 72°C/1’ 72°C/1’ 72°C/1’	5 5 5 35 35

D: denaturation, A: annealing, E: extension, C: cycles.