Table 1.
Characterization of the selected 26 EST-SSRs from four Amentotaxus species.
| A. argotaenia | A. formosana | A. yunnanensis | A. poilanei | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Locus | A | Ho | He | PIC | HWE p-value | A | Ho | He | PIC | HWE p-value | A | Ho | He | PIC | HWE p-value | A | Ho | He | PIC | HWE p-value |
| Amen03 | 2.000 | 0.000 | 0.153 | 0.141 | 0.001 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 3.000 | 0.182 | 0.517 | 0.422 | 0.057 | 2.000 | 0.286 | 0.245 | 0.215 | 0.659 |
| Amen04 | 2.000 | 0.167 | 0.500 | 0.375 | 0.021 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 3.000 | 0.417 | 0.344 | 0.307 | 0.842 | 2.000 | 0.429 | 0.337 | 0.280 | 0.471 |
| Amen07 | 2.000 | 0.250 | 0.219 | 0.195 | 0.621 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 2.000 | 0.167 | 0.153 | 0.141 | 0.753 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - |
| Amen10 | 2.000 | 0.167 | 0.375 | 0.305 | 0.054 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 2.000 | 0.100 | 0.375 | 0.305 | 0.020 | 2.000 | 0.833 | 0.486 | 0.368 | 0.080 |
| Amen13 | 2.000 | 0.909 | 0.496 | 0.373 | 0.006 | 4.000 | 0.667 | 0.543 | 0.480 | 0.003 | 4.000 | 0.917 | 0.740 | 0.692 | 0.000 | 2.000 | 1.000 | 0.500 | 0.375 | 0.008 |
| Amen15 | 3.000 | 0.500 | 0.406 | 0.371 | 0.721 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 2.000 | 0.500 | 0.375 | 0.305 | 0.248 | 3.000 | 0.286 | 0.255 | 0.240 | 0.978 |
| Amen18 | 2.000 | 0.083 | 0.080 | 0.077 | 0.880 | 2.000 | 0.167 | 0.375 | 0.305 | 0.174 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 2.000 | 0.143 | 0.133 | 0.124 | 0.839 |
| Amen19 | 3.000 | 0.333 | 0.500 | 0.449 | 0.000 | 2.000 | 0.000 | 0.219 | 0.195 | 0.005 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - |
| Amen20 | 2.000 | 0.417 | 0.413 | 0.328 | 0.977 | 2.000 | 0.000 | 0.153 | 0.141 | 0.001 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 3.000 | 0.000 | 0.571 | 0.501 | 0.003 |
| Amen24 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - |
| Amen25 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - |
| Amen26 | 2.000 | 0.333 | 0.278 | 0.239 | 0.488 | 2.000 | 0.083 | 0.080 | 0.077 | 0.880 | 3.000 | 0.583 | 0.434 | 0.369 | 0.565 | 3.000 | 0.857 | 0.541 | 0.453 | 0.268 |
| Amen27 | 2.000 | 0.000 | 0.500 | 0.375 | 0.001 | 2.000 | 0.000 | 0.278 | 0.239 | 0.001 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 3.000 | 0.286 | 0.653 | 0.580 | 0.066 |
| Amen30 | 4.000 | 0.750 | 0.670 | 0.606 | 0.562 | 2.000 | 0.000 | 0.494 | 0.372 | 0.003 | 4.000 | 0.500 | 0.618 | 0.562 | 0.174 | 3.000 | 0.429 | 0.449 | 0.406 | 0.497 |
| Amen35 | 2.000 | 0.000 | 0.444 | 0.346 | 0.001 | 2.000 | 0.000 | 0.165 | 0.152 | 0.001 | 3.000 | 0.250 | 0.226 | 0.212 | 0.970 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - |
| Amen38 | 2.000 | 0.091 | 0.351 | 0.290 | 0.014 | 2.000 | 0.000 | 0.298 | 0.253 | 0.001 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 3.000 | 0.429 | 0.357 | 0.325 | 0.914 |
| Amen40 | 2.000 | 0.636 | 0.434 | 0.340 | 0.122 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 3.000 | 0.250 | 0.538 | 0.432 | 0.133 | 3.000 | 0.429 | 0.500 | 0.427 | 0.808 |
| Amen41 | 3.000 | 0.667 | 0.486 | 0.424 | 0.392 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 4.000 | 0.714 | 0.541 | 0.502 | 0.904 | 2.000 | 0.857 | 0.490 | 0.370 | 0.047 |
| Amen42 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - |
| Amen43 | 4.000 | 0.500 | 0.535 | 0.498 | 0.075 | 2.000 | 0.100 | 0.255 | 0.222 | 0.055 | 3.000 | 0.545 | 0.533 | 0.432 | 0.838 | 3.000 | 0.714 | 0.602 | 0.523 | 0.214 |
| Amen44 | 2.000 | 0.167 | 0.278 | 0.239 | 0.166 | 2.000 | 0.000 | 0.486 | 0.368 | 0.001 | 4.000 | 0.667 | 0.517 | 0.482 | 0.809 | 2.000 | 0.571 | 0.408 | 0.325 | 0.290 |
| Amen46 | 2.000 | 0.083 | 0.469 | 0.359 | 0.004 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 2.000 | 0.182 | 0.165 | 0.152 | 0.740 | 2.000 | 0.429 | 0.337 | 0.280 | 0.471 |
| Amen47 | 2.000 | 0.364 | 0.397 | 0.318 | 0.782 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 4.000 | 0.200 | 0.575 | 0.526 | 0.034 | 2.000 | 0.286 | 0.245 | 0.215 | 0.659 |
| Amen48 | 2.000 | 0.000 | 0.500 | 0.375 | 0.001 | 2.000 | 0.200 | 0.180 | 0.164 | 0.725 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - | 2.000 | 0.000 | 0.490 | 0.370 | 0.008 |
| Amen50 | 3.000 | 0.000 | 0.406 | 0.371 | 0.001 | 2.000 | 0.000 | 0.375 | 0.305 | 0.046 | 3.000 | 0.000 | 0.594 | 0.511 | 0.001 | 2.000 | 0.000 | 0.375 | 0.305 | 0.046 |
| Amen52 | 2.000 | 0.000 | 0.165 | 0.152 | 0.001 | 4.000 | 0.000 | 0.678 | 0.623 | 0.000 | 2.000 | 0.000 | 0.444 | 0.346 | 0.001 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | - |
| Mean a | 2.348 ± 0.198 | 0.279 ± 0.057 | 0.394 ± 0.029 | 0.328 ± 0.087 | - | 1.783 ± 0.177 | 0.053 ± 0.030 | 0.1993 ± 0.044 | 0.1693 ± 0.145 | - | 2.478 ± 0.234 | 0.2683 ± 0.058 | 0.3343 ± 0.051 | 0.291 ± 0.184 | - | 2.174 ± 0.149 | 0.359 ± 0.067 | 0.347 ± 0.043 | 0.291 ± 0.135 | - |
| Mean b | 2.167 ± 0.090 | 0.250 ± 0.064 | 0.370 ± 0.028 | 0.317 ± 0.070 | - | 1.778 ± 0.222 | 0.053 ± 0.038 | 0.175 ± 0.051 | 0.152 ± 0.145 | - | 2.556 ± 0.258 | 0.258 ± 0.067 | 0.342 ± 0.057 | 0.300 ± 0.177 | - | 2.000 ± 0.162 | 0.348 ± 0.083 | 0.343 ± 0.051 | 0.281 ± 0.140 | - |
a for 23 polymorphic EST-SSRs; b for 18 polymorphic and neutral EST-SSRs; HWE: Hardy-Weinberg equilibrium.