Skip to main content
. 2018 Dec 14;9:2941. doi: 10.3389/fmicb.2018.02941

Table 2.

Oligonucleotides for construction of strains and diagnostic PCR.

FSprrec CGATATTTATCGTTAAGGACTTCAAGGGAAAACAAACAAC GTGTAGGCTGGAGCTGCTTC
Rsprrec TCTCATCAGGTAAGCCAAGGGAGGTGCTGCCTGATGAAGA CATATGAATATCCTCCTTAG
Fspr(c) GAA TTG TCT CAA GCT GTG CAG G
Rspr(c) ATT CGG CAA AAC GGG TTC AG
FYebArec TGCGAGCTGCCTGAAAGGAGATTAACGAGGAAGTGAATAC GTGTAGGCTGGAGCTGCTTC
RYebArec AGC CGG CAC ACA TCG CGT ACC GGC TCT GTC AGC GCA TTT G CATATGAATATCCTCCTTAG
FYebA(c) TTA GCC AAC CAG TAT GCG AGC
RYebA(c) GTA GCG ACG TCT GCG TCT C
FYdhOrec GTAGATTAGAATTATCAGGTTTTGTAAATCATACGCAGGC GTGTAGGCTGGAGCTGCTTC
RYdhOrec AAG AAG AAG TTA TCC TGT CGT TAA ACG ACA GGA TAA AAT A CATATGAATATCCTCCTTAG
FYdhO(c)2 CTG AAG CCT GTC ATT GTA ACG G
RYdhO(c)2 CGA TCT CTT CCA GCG ATT TGC
FTsprec ATGTCTTTGATTGTACGCGCAGAACACCTGGTGTTCTGAA GTGTAGGCTGGAGCTGCTTC
RTsprec TTA AAA AAA AAC AGG CAC AAT TTT TTG TGC CTG TTT AGC GCATATGAATATCCTCCTTAG
FTsp(c) TCA CCA AAG ATG GTG TCC GT
RTsp(c) TAT CCT GAC GAC TTC TGC GC
FRfaCrec GCAGCGGGTTCTGGAAGAGCTTCATTCGCTGTTGTCGGAA GTGTAGGCTGGAGCTGCTTC
RRfaCrec TCT TTT CTC CAC AAT AGG TTT GGG ATG AGA CAG AGT CTC T CATATGAATATCCTCCTTAG
FRfaC(c) AAG TGC GTA AAG GTG ATA CGG
RRfaC(c) CGC TTT ATT CCA GAT CGG CTT
FRfaPrec GATTTATACAGCTTACCGGAGAAGGCCGCGGATATTATTA GTGTAGGCTGGAGCTGCTTC
RRfaPrec CTC ACT CAT AAA TTA CTC ACT GAG TGC ATA ATT ATT ATA A CATATGAATATCCTCCTTAG
FRfaP(c) ACA CAG CCT TCC TTA CGC AA
RRfaP(c) GCC AGC AGG TGT GGC AAT ATA
FRfaGrec GACGGAAAAAATGCTGCCGCATGAGGCACGCACCATAGAT GTGTAGGCTGGAGCTGCTTC
RRfaGrec ATC TTT ACC GCG CCA TAG TGT GGT TAA CGG CGC TTT CAG CCATATGAATATCCTCCTTAG
FRfaG(c) TAC CTT TCC GTT ATT CCG GCT G
RRfaG(c) GTC TCC AGC TCT CTG AAC AC
FMepArec ATCGGGCACAGAATGCGGATGTAAAGACAGAGATTCCACG GTGTAGGCTGGAGCTGCTTC
RMepArec AGC AGC GGG GAG ACC ATA AAC AGA TCA TAA AAA TTG TCC A CATATGAATATCCTCCTTAG
FMepA(c) AGT GCC GAT CGC AGA AG
RMepA(c) AAA TCC TGC CAG TAC GGC
FNlpCrec CAGGTAATTTCGACGCTAAATTAATACCAAAATAAAAACA GTGTAGGCTGGAGCTGCTTC
RNlpCrec ATG TTA AAA ATA GAC TAT AAA ATT TAT ATC GTC TGC GAG GCATATGAATATCCTCCTTAG
FNlpC(c) CGT CGA GGG GCA TCC AAT
RNlpC(c) AGT TCA ACC GGC GAT ATG TT
FPbpGrec AGCTCAGGCGGTGTGCGTTACGACGCGCGTGAATCATTAT GTGTAGGCTGGAGCTGCTTC
RPbpGrec TGA AGC CCG GCG GCG CGA TGC CTG CCG GGC CTG CGG CGA C CATATGAATATCCTCCTTAG
FPbpG(c) TTC TGT AGC GGC AAC GCT
RPbpG(c) GCG GAA ATT CTG GCA GGA A
FsprSacI2 CATGAGCTCAGGAGGA CAA CAT GGT CAA ATC TCA ACC G
RsprHindIII CATGAAGCTT TTA ACT GCG GCT CAG AAC TC
FSprC68S (Primer for making C70S) GCAGCACTAAGAAAGGCGTCGACTCTTCC AGC TTT GTA CAG CGC ACC TTC
RSprC68S (Primer for making C70S) GAA GGT GCG CTG TAC AAA GCT GGA AGA GTC GAC GCC TTT CTT AGT GCT GC
pBAD30Forward TTA GCG GAT CCT ACC TGA CG
FTspEcoRI CATGAATTCAGGAGGA TGT TCT GAA ACG GAG GCC A
RTspHindIII CATGAAGCTT TTA CTT ATT GGC TGC CGC CT
FProQrec CTGTTCATGCCTGCTGCTTGTTGGCTACGTCCGTTGTAAT GTGTAGGCTGGAGCTGCTTC
RProQrec AAG CCT AAA AAA AGT GTT CAT GCC AGG CCT GGC CTC CGT TCATATGAATATCCTCCTTAG
FProQ(c) GTC GCA GGA TAA TCA ACG GA
RProQ(c) CGT AAT ATC TTC CAC GGC GAA G
FHtpXrec CATACGATGTGGGTAATCGCATAGTGCGCTTTGTTAAATT GTGTAGGCTGGAGCTGCTTC
RHtpXrec GCG TCA TTC GAC GCG CTT TTC ATA CTT GCC AGT GGG CTT ACATATGAATATCCTCCTTAG
FHtpX(c) TTT CTC GTG ACT TAC CGC CT
RHtpX(c) CGG TAG TGA GCG GTT TAC GTA
ΔnlpI-mutant Rouf SF, 2011, J. Bac