Table S3.

Putative virulence genes detected in the genome of KP_06 strain and five other serotype K2 strains

Virulence genes	K. pneumoniae strains
	KP_06	RJF293	U25	52.145	hvKP1	NUHL24835
Chromosome
clbA	+	+	−	−	−	−
clbB	+	+	−	−	−	−
clbC	+	+	−	−	−	−
clbD	+	+	−	−	−	−
clbE	+	+	−	−	−	−
clbF	+	+	−	−	−	−
clbG	+	+	−	−	−	−
clbH	+	+	−	−	−	−
clbI	+	+	−	−	−	−
clbJ	+	+	−	−	−	−
clbK	+	+	−	−	−	−
clbL	+	+	−	−	−	−
clbM	+	+	−	−	−	−
clbN	+	+	−	−	−	−
clbO	+	+	−	−	−	−
clbP	+	+	−	−	−	−
clbQ	+	+	−	−	−	−
clbR	+	+	−	−	−	−
kfuA	−	+	−	+	+	+
kfuB	−	+	−	+	+	+
kfuC	−	+	−	+	+	+
kvgA	+	−	−	+	−	−
kvgS	+	−	+	+	−	−
mceC	+	+	+	+	−	−
mrkA	+	+	+	+	+	+
mrkB	+	+	+	+	+	+
mrkC	+	+	+	+	+	+
mrkD	+	+	+	+	+	+
mrkF	+	+	+	+	+	+
mrkH	+	+	+	+	+	+
mrkI	+	+	+	+	+	+
mrkJ	+	+	+	+	+	+
clpP	+	+	+	+	−	−
clpE	−	−	+	−	−	−
algU	+	+	+	+	+	+
ureB	+	+	+	+	+	+
ureG	+	+	+	+	+	+
rfaE	+	+	+	+	+	+
rfaD	+	+	+	+	+	+
fyuA	+	+	+	+	+	+
ybtE	+	+	+	+	+	+
ybtT	+	+	+	+	+	+
ybtU	+	+	+	+	+	+
irp1	+	+	+	+	+	+
irp2	+	+	+	+	+	+
ybtA	+	+	+	+	+	+
ybtP	+	+	+	+	+	+
ybtQ	+	+	+	+	+	+
ybtX	+	+	+	+	+	+
ybtS	+	+	+	+	+	+
mgtC	+	+	+	+	+	+
fimB	+	+	+	+	+	+
fimE	+	+	+	+	+	+
fimA	+	+	+	+	+	+
fimI	+	+	+	+	+	+
fimC	+	+	+	−	+	+
fimD	+	+	+	−	+	+
fimF	+	+	+	−	+	+
fimG	+	+	+	−	+	+
fimH	+	+	+	−	+	+
focA	+	+	+	+	+	+
foci	−	−	−	+	−	−
focC	+	+	+	−	+	+
focD	+	+	+	−	+	+
chuS	+	+	+	+	+	+
chuU	+	+	+	+	+	+
fepA	+	+	+	+	+	+
fepB	+	+	+	+	+	+
fepC	+	+	+	+	+	+
fepD	+	+	+	+	+	+
fepG	+	+	+	+	+	+
entF	+	+	+	+	+	+
entC	+	+	+	+	+	+
entE	+	+	+	+	+	+
entB	+	+	+	+	+	+
entA	+	+	+	+	+	+
Icl	+	+	+	+	+	+
ompA	+	+	+	+	+	+
sfaA	+	+	+	+	+	+
htpB	+	+	+	+	+	+
sodB	+	+	+	+	+	+
lspE	+	−	−	−	−	−
gspE	+	+	+	+	+	+
gspG	+	+	+	+	+	+
manB	+	+	+	+	+	+
yagY/ecpB	+	+	+	+	+	+
ykgK/ecpR	+	+	+	+	+	+
yagZ/ecpA	+	+	+	+	+	+
yagX/ecpC	+	+	+	+	+	+
yagW/ecpD	+	+	+	+	+	+
yagV/ecpE	+	+	+	+	+	+
acpXL	+	−	+	−	−	−
sfaD	−	−	−	+	−	−
sfaE	+	+	+	−	+	+
sfaF	+	+	+	−	+	+
shuS	+	+	+	+	+	+
shuU	+	+	+	+	+	+
kdsB	+	+	+	+	+	+
msbA	+	+	+	+	+	+
galU	+	+	+	+	+	+
rffG	+	+	+	+	+	+
lpxD	+	+	+	+	+	+
lpxB	+	+	+	+	+	+
lpxA	+	+	+	+	+	+
rfaF	+	+	+	+	+	+
lpxC	+	+	+	+	+	+
gmhA/lpcA	+	+	+	+	+	+
kdsA	+	+	+	+	+	+
pilW	+	−	+	+	−	−
luxS	+	+	+	+	+	+
pavB/pfbB	−	−	+	−	−	−
Fes	+	+	+	+	+	+
entS	+	+	+	+	+	+
IlpA	+	+	+	+	+	+
Plasmid
rmpA	+	+	+	+	−	−
rmpA2	+	+	+	+	−	−
iroN	+	+	+	+	+	+
iroD	+	+	+	+	−	−
iroC	+	+	+	+	−	−
iroB	+	+	+	+	−	−
iucA	+	+	+	+	−	−
iucB	+	+	+	+	−	−
iucC	+	+	+	+	−	−
iucD	+	+	+	+	−	−
iutA	+	+	+	+	+	+

Notes: “+” indicates the presence of the corresponding gene. “−” indicates the absence of the corresponding gene.

Abbreviations: hvKP1, hypervirulent K. pneumoniae; K. pneumoniae, Klebsiella pneumoniae.