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. Author manuscript; available in PMC: 2019 Jan 23.
Published in final edited form as: J Affect Disord. 2018 Jul 17;242:234–243. doi: 10.1016/j.jad.2018.07.046

Table 2.

The 37 pleiotropic genes identified by the metaCCA and VEGAS2 analysis.

Locus Gene MetaCCA adjusted p-value VEGAS adjusted p-value
ADHD MD BP ASD SCZ
1 SRPK2 0 0.37 0.40 0.05 0.06 1.0E-06
2 DPYD 8.5E-292 0.58 0.19 0.75 0.35 1.0E-06
3 MAD1L1 4.0E-120 0.66 0.92 2.1E-04 0.03 1.0E-06
4 F0XP1 3.1E-107 0.37 0.02 0.46 0.01 1.0E-06
5 CACNA1C 1.0E-65 0.37 0.20 1.0E-06 0.41 1.0E-06
6 RGS7 2.7E-74 0.05 0.53 0.30 0.50 1.0E-06
7 IMMP2L 9.5E-63 0.35 0.08 0.21 0.81 1.0E-06
8 SLC8A3 9.6E-33 0.14 0.38 0.96 0.06 1.0E-06
9 CEMIP 1.4E-39 0.60 0.15 1.5E-03 0.14 1.0E-06
10 CACNB2 4.0E-47 0.07 0.02 6.1E-03 0.46 1.0E-06
11 SCAPER 5.2E-28 0.31 0.54 0.11 0.33 1.0E-06
12 ANKRD44 4.6E-24 0.52 0.44 0.03 0.51 1.0E-06
13 ISC20 1.5E-17 1.9E-03 0.36 0.01 0.06 1.0E-06
14 TMEM120B 4.8E-13 0.12 0.21 0.44 0.15 1.0E-06
15 ZSWIM6 1.2E-15 0.04 0.24 0.04 0.05 1.0E-06
16 TRANK1 1.1E-12 0.62 0.56 0.01 0.08 1.0E-06
17 ALPI 4.2E-11 0.43 0.03 0.03 0.13 1.0E-06
18 EFHD1 2.2E-11 0.56 0.02 0.01 0.03 1.0E-06
19 RCOR1 3.9E-08 0.06 0.14 0.03 0.77 1.0E-06
20 OPN3 1.8E-07 0.28 0.68 0.02 0.75 1.0E-06
21 ITIH4 8.8E-10 0.02 0.06 1.4E-04 0.10 1.0E-06
22 LINC01004 1.3E-09 0.65 0.81 0.01 0.10 1.0E-06
23 BTN2A1 8.1E-11 0.85 0.34 0.01 0.91 1.0E-06
24 GPX6 3.1E-09 0.19 0.10 0.04 0.39 1.0E-06
25 ABHD17C 2.0E-07 0.43 0.21 1.9E-03 0.12 1.0E-06
26 ETF1 5.4E-09 0.09 0.06 2.3E-03 0.20 1.0E-06
27 ARFGEF2 3.1E-07 0.30 0.31 0.02 0.84 1.0E-06
28 CREB3L1 3.2E-07 0.15 0.76 0.47 6.3E-04 1.0E-06
29 KMO 2.5E-09 0.43 0.83 0.04 0.55 1.0E-06
30 SNAP91 1.4E-07 0.33 0.35 2.8E-03 1.00 1.0E-06
31 HIST1H3D 1.2E-07 0.35 0.25 0.42 0.24 1.0E-06
32 C3orf49 1.7E-06 0.54 0.15 0.06 0.73 1.0E-06
33 C2 1.6E-07 0.83 0.11 0.01 0.63 1.0E-06
34 ZSCAN23 2.3E-06 0.36 0.08 0.03 0.23 1.0E-06
35 ZNF391 3.0E-06 0.49 0.02 0.03 0.70 1.0E-06
36 STAB1 3.5E-06 0.12 0.01 4.5E-03 0.07 1.0E-06
37 HFE 2.4E-06 0.43 0.11 0.07 0.49 1.0E-06