Table 2.
Genes in the top three most frequently occurring 2-hit combinations.
| Gene | Cancer Type | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BLCA | BRCA | CESC | COAD | GBM | HNSC | KIRP | LGG | LIHC | LUAD | LUSC | OV | PRAD | SARC | STAD | THCA | UCEC | |
| Confirmed Cancer Genes - in COSMIC | |||||||||||||||||
| APC46 | 1 | ||||||||||||||||
| CTNND247 | 2 | 2 | 2 | ||||||||||||||
| IDH148 | 1 | ||||||||||||||||
| KRAS49 | 3 | ||||||||||||||||
| MUC1250 | 1 | 2,3 | 1,3 | 1 | |||||||||||||
| MUC651 | 1 | 1,3 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1,2 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | 2 | |
| PTEN52 | 3 | ||||||||||||||||
| RB153 | 3 | ||||||||||||||||
| TP5354 | 2 | 2,3 | 2 | ||||||||||||||
| Experimentally Implicated in Cancer | |||||||||||||||||
| ALOX1555 | 3 | ||||||||||||||||
| ALPP56 | 3 | 3 | 3 | ||||||||||||||
| CACNA1E57 | 3 | ||||||||||||||||
| CCDC3058 | 3 | ||||||||||||||||
| DPP659 | 3 | ||||||||||||||||
| FHOD360 | 2 | 1,3 | |||||||||||||||
| FRG1BP61 | 2 | 2 | 2 | 1,3 | 2,3 | 3 | 2 | 3 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2,3 | 1 | 2,3 | 2,3 | 1 |
| HLA-C62 | 3 | 2 | |||||||||||||||
| HLA-DRB163 | 3 | ||||||||||||||||
| HRNR64 | 3 | ||||||||||||||||
| IGHG138 | 2 | 2 | 2 | 2 | |||||||||||||
| KCNB165 | 1 | ||||||||||||||||
| NBPF166 | 3 | ||||||||||||||||
| SLC5A1167 | 3 | ||||||||||||||||
| Potentially Novel Cancer Genes | |||||||||||||||||
| CCDC43 | 3 | ||||||||||||||||
| GOLGA6L10 | 3 | ||||||||||||||||
| GOLGA6L9 | 3 | ||||||||||||||||
| LCE1A | 3 | ||||||||||||||||
| OR2T7 | 3 | 2 | |||||||||||||||
| OR8U1 | 1 | ||||||||||||||||
| PRAMF15 | 3 | ||||||||||||||||
| TUBB8P12 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 | 3 | 1 | 2 | 1 | 1 | 2 | ||
Genes are grouped by those that are confirmed cancer genes, experimentally implicated in cancer, and potentially novel cancer genes. The numbers in the table (1, 2, and/or 3) indicate which of the top three 2-hit combinations the gene belongs to.