Table 4.
GenBank strain name | Classification | Phylogenetic analyses | Whole-genome sequence analyses | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Current | Proposed | 16S | MLSA | ANI | TNA | POCP | |
KF708 | C. basilensis | Cupriavidus sp. | C. basilensis | C. basilensis | + | + | Cupriavidus |
A5-1 | C. necator | Cupriavidus sp. | C. necator | C. necator | + | + | Cupriavidus |
NH9 | C. necator | C. necator | + | + | + | + | Cupriavidus |
UM1 | C. pauculus | Cupriavidus sp. | + | + | + | + | Cupriavidus |
GA3-3 | Cupriavidus sp. | C. necator | N. T. | + | + | + | Cupriavidus |
HMR-1 | Cupriavidus sp. | C. metallidurans | + | + | + | + | Cupriavidus |
HPC(L) | Cupriavidus sp. | C. gilardii | + | + | + | + | Cupriavidus |
SHE | Cupriavidus sp. | C. metallidurans | + | + | + | + | Cupriavidus |
SK-4 | Cupriavidus sp. | C. necator | + | + | + | + | Cupriavidus |
UYPR2.512 | Cupriavidus sp. | C. necator | N. T. | + | + | + | Cupriavidus |
DTP0602 | R. pickettii | Cupriavidus sp. | C. necator | C. necator | + | + | Cupriavidus |
FDAARGOS_410 | R. pickettii | R. mannitolilytica | + | + | + | + | Ralstonia |
CQPS-1 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
EP1 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
P781 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
UW757 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
CaRs-Mep | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
CFBP3059 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
KACC10709 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
KACC 10722 | R. solanacearum | R. syzygii | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
OE1-1 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
RSCM | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
SEPPX05 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
YC40-M | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
58_RSOL | R. solanacearum | R. insidiosa | + | + | + | + | Ralstonia |
PSS4 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
PSS190 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
PSS216 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
PSS1308 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
RD15 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
Rs-T02 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
UTT-25 | R. solanacearum | R. pseudosolanacearum | + | + | + | R. solanacearum | Ralstonia |
25mfcol4.1 | Ralstonia sp. | Cupriavidus sp. | + | + | + | + | Cupriavidus |
5_2_56FAA | Ralstonia sp. | R. pickettii | + | + | + | + | Ralstonia |
A12 | Ralstonia sp. | R. insidiosa | + | R. pickettii | Ralstonia sp. | + | Ralstonia |
AU12-08 | Ralstonia sp. | R. insidiosa | + | + | + | + | Ralstonia |
MD27 | Ralstonia sp. | R. insidiosa | + | + | Ralstonia sp. | + | Ralstonia |
NFACC01 | Ralstonia sp. | R. pickettii | + | + | + | + | Ralstonia |
NT80 | Ralstonia sp. | R. insidiosa | + | + | + | + | Ralstonia |
UNC404CL21Col | Ralstonia sp. | R. pickettii | + | + | + | + | Ralstonia |
UNCCL144 | Ralstonia sp. | R. pickettii | + | + | + | + | Ralstonia |
PBA | Ralstonia sp. | Other | + | Cupriavidus sp. | + | Cupriavidus sp. | + |
The symbol “+” indicates same taxonomy as “Proposed.” N. T., Not tested.