Table 1.

Overview of the benchmark datasets.

Species	Antibiotic	Examples	Resistant	Susceptible	k-mers
A. baumannii	Imipenem	499	325	174	42 406 238
E. faecium	Vancomycin	134	51	83	10 341 091
E. coli	Amoxicillin/Clavulanic acid	1 524	464	1 060	48 456 086
K. pneumoniae	Gentamicin	2 107	906	1 201	70 347 931
M. tuberculosis	Isoniazid	5 022	1 719	3 303	11 688 883
N. gonorrhoeae	Azithromycin	392	214	178	4 766 702
P. difficile	Moxifloxacin	462	188	274	19 753 432
P. aeruginosa	Levofloxacin	491	201	290	42 961 897
S. enterica	Chloramphenicol	347	251	96	6 864 155
S. aureus	Methicillin	1 593	707	886	13 289 281
S. haemolyticus	Ciprofloxacin	120	74	46	5 341 646
S. pneumoniae	Chloramphenicol	409	149	260	6 380 123