Table 1. Average D’ and r² estimates by distance class.

Distance_class (Kb)	Number of pairs			Average D’ (sd)			Average r2 (sd)			Average r2 corrected (sd)
	MAF0.01	MAF0.05	MAF0.1	MAF0.01	MAF0.05	MAF0.1	MAF0.01	MAF0.05	MAF0.1	MAF0.01	MAF0.05	MAF0.1
0-19	546	551	580	0.738(0.34)	0.729(0.33)	0.718(0.33)	0.227(0.3)	0.254(0.29)	0.291(0.31)	0.223(0.299)	0.250(0.29)	0.287(0.30)
20-39	11 888	12 264	12 074	0.684(0.35)	0.651(0.34)	0.630(0.34)	0.152(0.22)	0.179(0.24)	0.203(0.25)	0.147(0.226)	0.174(0.23)	0.199(0.25)
40-59	9 556	9 738	9 571	0.605(0.35)	0.567(0.34)	0.533(0.34)	0.108(0.18)	0.127(0.19))	0.142(0.2)	0.103(0.179)	0.122(0.19)	0.137(0.19)
60-99	19 319	19 759	19 398	0.540(0.36)	0.486(0.34)	0.447(0.32)	0.076(0.14)	0.087(0.14)	0.096(0.15)	0.071(0.137)	0.081(0.14)	0.091(0.15)
100-199	47 353	48 233	47 311	0.460(0.35)	0.397(0.31)	0.349(0.28)	0.046(0.09)	0.051(0.09	0.055(0.1)	0.040(0.090)	0.046(0.09)	0.050(0.09)
200-499	139 280	141 276	138 233	0.402(0.34)	0.328(0.29	0.277(0.24)	0.027(0.05)	0.028(0.05)	0.029(0.05)	0.021(0.047)	0.023(0.04)	0.024(0.04)
500-999	228 259	231 215	226 852	0.383(0.33	0.306(0.28)	0.254(0.23)	0.021(0.03)	0.022(0.03)	0.023(0.03	0.016(0.033)	0.017(0.03)	0.017(0.03)
1 000-1 999	447 448	453 482	442 903	0.374(0.33)	0.297(0.27)	0.245(0.22)	0.020(0.03)	0.021(0.03)	0.021(0.03)	0.014(0.029)	0.015(0.02)	0.015(0.02)
2 000-4 999	1 290 593	1 303 873	1 274 310	0.366(0.33)	0.289(0.27)	0.238(0.22)	0.018(0.03)	0.019(0.03)	0.020(0.03)	0.013(0.027)	0.014(0.02)	0.014(0.02)
5 000-9 999	2 010 370	2 027 558	1 982 159	0.358(0.33)	0.280(0.27)	0.229(0.21)	0.017(0.02)	0.018(0.02)	0.018(0.02)	0.011(0.025)	0.012(0.02)	0.013(0.02)
10 000-11 999	760 396	765 970	749 864	0.354(0.33)	0.275(0.26)	0.225(0.21)	0.016(0.02)	0.017(0.02)	0.017(0.02)	0.011(0.023)	0.012(0.02)	0.012(0.02)
12 000-14 999	1 100 143	1 106 024	1 081 484	0.352(0.33)	0.273(0.26)	0.223(0.21	0.016(0.02)	0.017(0.02)	0.017(0.02)	0.010(0.023)	0.011(0.02)	0.011(0.02)
15 000-16 999	708 390	711 382	695 392	0.349(0.33)	0.270(0.26)	0.221(0.21)	0.016(0.02)	0.017(0.02)	0.017(0.02)	0.010(0.022)	0.011(0.02)	0.011(0.02)
17 000-19 999	1 027 451	1 033 865	1 011 227	0.348(0.33)	0.269(0.26)	0.220(0.21)	0.016(0.02)	0.016(0.02	0.017(0.02)	0.010(0.022)	0.011(0.02)	0.011(0.02)
20 000-29 999	3 100 869	3 115 808	3 048 049	0.345(0.33)	0.265(0.26)	0.217(0.21)	0.015(0.02)	0.016(0.02)	0.016(0.02)	0.009(0.022)	0.010(0.02)	0.010(0.02)
30 000-49 999	4 710 189	4 739 668	4 629 739	0.341(0.33)	0.263(0.26)	0.214(0.2)	0.015(0.02)	0.015(0.02)	0.016(0.02)	0.009(0.021)	0.010(0.02)	0.010(0.02)
Non-syntenic SNPs	1 444 151	1 444 151	1 444 151	0.342(0.32)	0.258(0.25)	0.214(0.2)	0.0145(0.02)	0.015(0.02)	0.015(0.02)	0.008(0.020)	0.009(0.02)	0.009(0.02)