Table 1.
Primers used in this study.
Designation | Forward | Reverse |
---|---|---|
[RT-PCR/qRT-PCR] | ||
Tesra PCR | 5′-CGTGCCTGTTTCTTTCCATT-3′ | 5′-CAGCCACCATGTTCTGTGAC-3′ |
Tesra 2890bp | 5′-CGTGCCTGTTTCTTTCCATT-3′ | 5′-GTTGCATCTCCACCCATCA-3′ |
Tesra full length | 5′-AGAGGTGTGAGGCTGGTGGG-3′ | 5′-TGAACATATTAAATGAGCTC-3′ |
Gapdh | 5′-CATGACCACAGTCCATGCCATC-3′ | 5′-TAGCCCAAGATGCCCTTCAGTG-3′ |
[5′RACE and 3′RACE] | ||
GSP1 | 5′-CAGCCACCATGTTCTGTGAC-3′ | |
GSP2 | 5′-GGCAACCTGGAAAGGAAAAT-3′ | |
GSP3 | 5′-AATGGAAAGAAACAGGCACG-3′ | |
GSP4 | 5′-CCTGAAGCTCACCCCTAGTA-3′ | |
GSP5 | 5′-TTGATGGGTGGAGATGCAAC-3′ | |
[RT-PCR/qRT-PCR with extracellular RNA] | ||
Tesra exosome | 5′-ACCAGGGCCAGGAATTTATC-3′ | 5′-TGTTCCCAGTGTTGGCTGTA-3′ |
lncRNA-HSVIII exosome | 5′-TTGTCATTGGGGCAGAAATA-3′ | 5′-CACCACAAAAACAAAGGGTG-3′ |
[ChIRP-qPCR] | ||
Rec8 promoter | 5′-CCTTGGCGAAGTCCTTGTTA-3′ | 5′-AATAGTCGCCAGCCAATCAC-3′ |
B2m promoter | 5′-GGCCAGGGGTTTAACTTCTC-3′ | 5′-CCCTTGGGGTTTCTGCTTAT-3′ |
Prss42/Tessp-2 promoter | 5′-GGTGCCTCTTTGGAGACCTA-3′ | 5′-GACCCCTTACTTCCTGTGGA-3′ |
Prss44/Tessp-4 promoter | 5′-CTTCTGCTGTCTGGGAGTCA-3′ | 5′-AACGGGTGGTTTCATTTAGC-3′ |
Prss43/Tessp-3 promoter | 5′-CTGCAGGTGACTCCACACTT-3′ | 5′-TTCCTCCTTCTGTCCCTCAG-3′ |
intergenic Prss42/Tessp2-Prss44/Tessp-4 | 5′-CAGAGTCGCCTTCAAAATCC-3′ | 5′-TAGCCCAAATCAGCACCTTC-3′ |
intergenic Prss44/Tessp4-Prss43/Tessp-3 | 5′-GAGGTACAGGCACAAGCACA-3′ | 5′-TAGCTGTGGCAGGCTTAGGT-3′ |
Prss45/TESPL promoter | 5′-AGCACTAGGGGTGCTGTCAT-3′ | 5′-TGGACCCACTCTCGTCCTTA-3′ |
Prss46 promoter | 5′-TCAGTGGAGACTGGCATGAA-3′ | 5′-CCTGTGACCTTGTCCCTTGT-3′ |
Prss50/Tsp50 promoter | 5′-GCAGAGGAGGGTAGGGGTAT-3′ | 5′-TATGCCTCGCCTCAGCTAAT-3′ |