Table 1. Molecular geometry (Å, °) of N9-substituted adenine.

N denotes the number of fragments used to determine the parameters. The recommended restraints are printed in bold.

	PDB 1d8g (N = 2)	Parkinson (N = 48)	CSD (N = 216)	QM for A	QM for AU	QM for AT
N1—C2	1.337 (7)	1.339 (9)	1.339 (7)	1.338	1.348	1.348
C2—N3	1.328 (2)	1.331 (9)	1.330 (7)	1.331	1.333	1.334
N3—C4	1.340 (1)	1.344 (6)	1.346 (6)	1.334	1.344	1.344
C4—C5	1.384 (5)	1.383 (7)	1.382 (8)	1.394	1.400	1.400
C5—C6	1.404 (5)	1.406 (9)	1.406 (8)	1.405	1.414	1.413
C6—N1	1.349 (1)	1.351 (7)	1.353 (7)	1.340	1.355	1.355
C5—N7	1.394 (7)	1.388 (6)	1.388 (7)	1.380	1.385	1.384
N7—C8	1.301 (7)	1.311 (7)	1.311 (7)	1.309	1.316	1.316
C8—N9	1.356 (12)	1.373 (8)	1.370 (8)	1.377	1.383	1.383
N9—C4	1.375 (2)	1.374 (6)	1.374 (7)	1.375	1.378	1.377
C6—N6	1.338 (5)	1.335 (8)	1.334 (7)	1.349	1.343	1.343
C6—N1—C2	119.5 (5)	118.6 (6)	118.6 (6)	118.83	119.94	120.03
N1—C2—N3	128.4 (2)	129.3 (5)	129.4 (7)	128.36	127.85	127.78
C2—N3—C4	111.3 (3)	110.6 (5)	110.5 (6)	111.59	111.58	111.49
N3—C4—C5	126.4 (2)	126.8 (7)	126.9 (6)	126.56	126.82	126.95
C4—C5—C6	117.3 (2)	117.0 (5)	117.1 (5)	116.11	116.55	116.54
C5—C6—N1	117.0 (3)	117.7 (5)	117.5 (5)	118.55	117.26	117.21
N3—C4—N9	128.14 (2)	127.4 (8)	127.2 (7)	128.18	127.89	127.79
C6—C5—N7	132.4 (7)	132.3 (7)	132.2 (6)	132.99	132.59	132.47
C5—C4—N9	105.4 (2)	105.8 (4)	105.9 (4)	105.26	105.29	105.26
C4—N9—C8	106.2 (1)	105.8 (4)	105.7 (4)	106.00	106.11	106.09
N9—C8—N7	114.3 (8)	113.8 (5)	113.9 (5)	113.70	113.54	113.57
C8—N7—C5	103.8 (13)	103.9 (5)	103.8 (4)	104.14	104.20	104.09
N7—C5—C4	110.3 (6)	110.7 (5)	110.6 (5)	110.91	110.87	110.99
N6—C6—N1	119.5 (1)	118.6 (6)	118.6 (7)	119.09	119.40	119.42
N6—C6—C5	123.5 (2)	123.7 (8)	123.9 (7)	122.36	123.34	123.37
RMSD versus 1d8g (d/a)		0.0087/0.745	0.0084/0.779	0.0114/0.839	0.0134/0.649	0.0134/0.664
RMSD versus QM for A (d/a)					0.0080/0.561	0.0078/0.604
RMSD versus QM for AU (d/a)						0.0006/0.079