•Alveolata

••Ciliophora

•••Postodesmatophora

••••Karyorelictea

•••••Kentrophoridae(Kentrophoros) B

•••••Loxodida

••••••Cryptopharyngidae (Cryptopharynx) O C

••••••Loxodidae (Loxodes) O C

•••••Geleiidae (Geleia) O C

••••Heterotrichea

•••••Blepharismidae (Blepharisma) B

•••••Climacostomidae (Climacostomum) O

•••••Condylostomatidae (Chattonidium, Condylostoma) B

•••••Fabreidae (Fabrea) B

•••••Gruberiidae (Gruberia) B

•••••Coliphorina

••••••Folliculinidae (Folliculina) B

••••••Maristentoridae (Maristentor) O

•••••Peritromidae (Peritromus) B

•••••Spirostomidae (Anigsteinia, Spirostomum) B

•••••Stentoridae (Stentor) O or C or P

•••Intramacronucleata

••••SAL

Incertae sedis SAL: Mesodiniidae (Mesodinium) Incertae sedis SAL: Phacodinium

••••• Spirotrichea

••••••Euplotia

•••••••Euplotida

••••••••Aspidiscidae (Aspidisca) O

••••••••Certesiidae (Certesia) O

••••••••Euplotidae (Euplotes) O

••••••••Gastrocirrhidae (Gastrocirrhus) O

••••••••Uronychidae (Diophrys, Uronychia) O

•••••••Discocephalida

••••••••Discocephalidae(Discocephalus, Prodiscocephalus, Paradiscocephalus) O

••••••••Pseudoamphisiellidae (Leptoamphisiella, Pseudoamphisiella) O

••••••Perilemmaphora

•••••••Hypotrichia

••••••••Stichotrichida

•••••••••Amphisiellidae (Amphisiella, Bistichella) O

•••••••••Atractosidae (Atractos) O

•••••••••Epiclintidae (Epiclintes) O

•••••••••Gonostomatidae (Cotterillia, Gonostomum) O

•••••••••Halteriidae (Halteria, Meseres) O

•••••••••Holostichidae (Holosticha, Uncinata) O

•••••••••Kahliellidae (Deviata, Kahliella) O

••••••••• Keronidae (Kerona) O

•••••••••Oxytrichidae (Cyrtohymena, Gastrostyla, Oxytricha, Stylonychia) O

•••••••••Parabirojimidae (Parabirojimia, Tunicothrix) O

•••••••••Plagiotomidae (Plagiotoma) O

•••••••••Psammomitridae (Psammomitra) O

•••••••••Pseudoamphisiellidae (Pseudoamphisiella) O

•••••••••Psilotrichidae (Psilotricha, Urospinula) O

•••••••••Schmidingerotrichidae (Schmidingerothrix) O

•••••••••Spirofilidae (Spirofilopsis, Strongylidium) O

•••••••••Trachelostylidae (Trachelostyla) O

•••••••••Uroleptidae (Paruroleptus, Uroleptus) O

••••••••Urostylida

•••••••••Bergeriellidae (Bergeriella, Neourostylopsis) O

•••••••••Hemicycliostylidae (Hemicycliostyla, Australothrix) O

•••••••••Pseudokeronopsidae (Apoholosticha, Pseudokeronopsis) O

•••••••••Pseudourostylidae (Pseudourostyla) O

•••••••••Urostylidae (Bakuella, Diaxonella, Urostyla) O C

•••••••Oligotrichea

••••••••Oligotrichida

•••••••••Cyrtostrombidiidae (Cyrtostrombidium) O

•••••••••Pelagostrombidiidae (Pelagostrombidium) O

•••••••••Strombidiidae (Strombidium) O

•••••••••Tontoniidae (Laboea, Tontonia) O

••••••••Choreotrichida

•••••••••Strobilidiina

••••••••••Leegaardiellidae (Leegaardiella) O

••••••••••Lohmanniellidae (Lohmanniella) O

••••••••••Strobilidiidae (Strobilidium) O

••••••••••Strombidinopsidae (Strombidinopsis) O

•••••••••Tintinnina (particle size ingested is determined by the lorica diameter)

••••••••••Ascampbelliellidae (Ascampbelliella) O

••••••••••Cyttarocylididae (Cyttarocylis) O

••••••••••Dictyocystidae (Dictyocysta) O

••••••••••Epiplocylididae (Epiplocylis) O

••••••••••Eutintinnidae (Dartintinnus, Eutintinnus) O

••••••••••Favellidae (Favella) O

••••••••••Nolaclusiliidae (Nolaclusilis) O

••••••••••Petalotrichidae (Petalotricha) O

••••••••••Ptychocylididae (Cymatocylis, Ptychocylis) O

••••••••••Rhabdonellidae (Metacylis, Rhabdonella, Schmidingerella O

••••••••••Stenosemellidae (Stenosemella) O

••••••••••Tintinnidae (Amphorellopsis, Salpingacantha, Salpingella, Tintinnus) O

••••••••••Tintinnidiidae (Tintinnidium) O

••••••••••Undellidae (Undella) O

••••••••••Xystonellidae (Dadayiella, Parafavella, Xystonella) O

•••••• Licnophoridae (Licnophora, Prolicnophora) O

••••••Kiitrichidae (Caryotricha, Kiitricha) O

•••••Lamellicorticata

••••••Armophorea

Incertae sedis Armophorea: Mylestomatidae (Mylestoma) O

•••••••Metopida anaerobic‐aerotolerant

••••••••Metopidae (Metopus) O

••••••••Apometopidae (Cirranter, Urostomides) O

••••••••Tropidoatractidae (Palmarella, Tropidoatractus) O

•••••••Clevelandellida anaerobic, gut *

••••••••Clevelandellidae (Clevelandella) O

••••••••Inferostomatidae (Inferostoma) O

••••••••Neonyctotheridae (Neonyctotherus) O

••••••••Nyctotheridae (Nyctotherus) O

••••••••Sicuophoridae (Sicuophora) O

•••••••Caenomorphidae (Caenomorha) O

•••••••Odontostomatida

••••••••Discomorphellidae (Discomorphella) B

••••••••Epalxellidae (Epalxella, Saprodinium) B

•••••• Litostomatea

•••••••Rhynchostomatia

••••••••Dileptida

•••••••••Dileptidae (Apodileptus, Dileptus, Pseudomonilicaryon) P

•••••••••Dimacrocaryonidae (Dimacrocaryon, Monomacrocaryon, Rimaleptus) P

••••••••Tracheliidae (Trachelius) O P

•••••••Haptoria

••••••••Lacrymariidae (Lacrymaria) P

••••••••Haptorida

•••••••••Enchelyodonidae (Enchelyodon, Fuscheria) P

•••••••••Homalozoonidae (Homalozoon) P

•••••••••Pleuroplitidae (Pleuroplites) P

••••••••Didiniidae (Didinium, Monodinium) P

••••••••Pleurostomatida

•••••••••Amphileptidae (Amphileptus) P

•••••••••Litonotidae (Litonotus) P

•••••••••Kentrophyllidae (Kentrophyllum, Epiphyllum) P

••••••••Spathidiida

•••••••••Acropisthiidae (Acropisthium, Chaenea) P

•••••••••Actinobolinidae (Actinobolina) P

•••••••••Apertospathulidae (Apertospathula) P

•••••••••Enchelyidae (Enchelys) P

•••••••••Pseudoholophryidae (Pseudoholophrya) P

•••••••••Spathidiidae (Spathidium) P

•••••••••Trachelophyllidae (Trachelophyllum) P

•••••••Helicoprorodontidae (Helicoprorodon) P

•••••••Trichostomatia (anaerobic endosymbiont in vertebrates)

••••••••Vestibuliferida (anaerobic endosymbiont in fish)

•••••••••Balantidiidae (Balantidium, some X, Neobalantidium) B

•••••••••Buetschliidae (Buetschlia) B

•••••••••Paraisotrichidae (Paraisotrichia) B

•••••••••Protocaviellidae (Protocaviella) B

•••••••••Protohalliidae (Protohallia) B

•••••••••Pycnotrichidae (Pycnothrix, perhaps Buxtonella) B

•••••••Isoendo

••••••••Isotrichidae (Dasytricha, Isotricha) (anaerobic gut * in ungulate ruminants) B

••••••••Entodiniomorphida

•••••••••Blepharocorythina (anaerobic gut * in mammals)

••••••••••Blepharocorythidae (Blepharocorys) B

••••••••••Parentodiniidae (Parentodinium) B

••••••••••Pseudoentodiniidae (Pseudoentodinium) B

•••••••••Entodiniomorphina

••••••••••Cycloposthiidae (Cycloposthium) B

••••••••••Gilchristidae (Gilchristia) B

••••••••••Ophryoscolecidae (Entodinium, Ophryoscolex, Polyplastron) B

••••••••••Polydiniellidae (Polydiniella) B

••••••••••Rhinozetidae (Rhinozeta) B

••••••••••Spirodiniidae (Spirodinium) B

••••••••••Telamodiniidae (Telamodinium) B

••••••••••Troglodytellidae (Troglodytella) B

••••••••Macropodiniida (anaerobic gut * in fore‐stomach of marsupial macropodids and vombatids)

••••••••••Amylovoracidae (Amylovorax) B

••••••••••Macropodiniidae (Macropodinium) B

••••••••••Polycostidae (Polycosta) B

••••CONTHREEP

Incertae sedis CON‐threeP: Askenasia, Cyclotrichiidae, Paraspathidium,

Pseudotrachelocercidae, Discotrichidae. B

••••• Phyllopharyngea

••••••Synhymeniida f, cyanobacteria

•••••••Nassulopsidae (Nassulopsis) f

•••••••Orthodonellidae (Orthodonella, Zosterodasys) f

•••••••Scaphidiodontidae (Chilodontopsis, Scaphidiodon) f

•••••••Synhymeniidae (Synhymenia) f

••••••Subkinetalia

•••••••Cyrtophoria

••••••••Chlamydodontida

•••••••••Chilodonellidae (Chilodonella) O C

•••••••••Chitonellidae (Chitonella) O C

•••••••••Chlamydodontidae (Chlamydodon) O C

•••••••••Gastronautidae (Gastronauta) O C

•••••••••Kryoprorodontidae (Gymnozoum) O C

•••••••••Lynchellidae (Chlamydonella, Lynchella) O C

••••••••Dysteriida

•••••••••Dysteriidae (Dysteria, Trochilia) O C

•••••••••Hartmannulidae Hartmannula) O C

•••••••••Kyaroikeidae (Kyaroikeus) O C

•••••••••Plesiotrichopidae (Plesiotrichopus) O C

•••••••••Chonotrichia

••••••••••Exogemmida ?

•••••••••••Chilodochonidae (Chilodochona)

•••••••••••Filichonidae (Filichona)

•••••••••••Helichonidae (Heliochona)

•••••••••••Lobochonidae (Lobochona)

•••••••••••Phyllochonidae (Phyllochona)

•••••••••••Spirochonidae (Spirochona)

••••••••••Cryptogemmida ?

•••••••••••Actinichonidae (Actinichona)

•••••••••••Echinichonidae (Echinichona)

•••••••••••Inversochonidae (Inversochona)

•••••••••••Isochonidae (Isochona)

•••••••••••Isochonopsidae (Isochonopsis)

•••••••••••Stylochonidae (Stylochona)

•••••••Rhynchodia

••••••••Hypocomidae (Hypocoma) S, X in marine invertebrates

••••••••Rhynchodida

•••••••••Ancistrocomidae (Ancistrocoma) C or X in marine invertebrates

•••••••••Sphenophryidae (Sphenophrya) C or X in marine invertebrates

•••••••Suctoria (P larger species can capture small invertebrates)

••••••••Exogenida

•••••••••Allantosomatidae (Allantosoma) C P

•••••••••Dentacinetidae (Dentacineta) C P

•••••••••Dendrosomididae (Dendrosomides) C P

•••••••••Ephelotidae (Ephelota) C P

•••••••••Lecanophryidae (Lecanophrya) C P

•••••••••Metacinetidae (Metacineta) C P

•••••••••Manuelophryidae (Manuelophrya) C P

•••••••••Ophryodendridae (Ophryodendron) C P

•••••••••Paracinetidae (Paracineta) C P

•••••••••Phalacrocleptidae (Phalacrocleptes)

•••••••••Podophryidae (Podophrya) C P

•••••••••Praethecacinetidae (Praethecacineta) C P

•••••••••Rhabdophryidae (Rhabdophrya) C P

•••••••••Severonidae (Severonis) C P

•••••••••Spelaeophryidae (Spelaeophrya) C P

•••••••••Tachyblastonidae (Tachyblaston) C P

•••••••••Thecacinetidae (Thecacineta) C P

••••••••Endogenida

•••••••••Acinetidae (Acineta) C P

•••••••••Acinetopsidae (Acinetopsis) C P

•••••••••Choanophryidae (Choanophrya) C P

•••••••••Corynophryidae (Corynophrya) C P

•••••••••Dactylostomatidae (Dactylostoma) C P

•••••••••Dendrosomatidae (Dendrosoma) C P

•••••••••Endosphaeridae (Endosphaera) C P

•••••••••Erastophryidae (Erastophrya) C P

•••••••••Pseudogemmidae (Pseudogemma) C P

•••••••••Rhynchetidae (Rhyncheta) C P

•••••••••Solenophryidae (Solenophrya) C P

•••••••••Tokophryidae (Tokophrya) C P

•••••••••Trichophryidae (Trichophrya) C P

••••••••Evaginogenida

•••••••••Cometodendridae (Cometodendron) C P

•••••••••Cyathodiniidae (Cyathodinium) C P

•••••••••Dendrocometidae (Dendrocometes) C P

•••••••••Discophryidae (Discophrya) C P

•••••••••Enchelyomorphidae (Enchelyomorpha) C P

•••••••••Heliophryidae (Heliophrya) C P

•••••••••Periacinetidae (Periacineta) C P

•••••••••Prodiscophryidae (Prodiscophrya) C P

•••••••••Rhynchophryidae (Rhynchophrya) C P

•••••••••Stylocometidae (Stylocometes) C P

•••••••••Trypanococcidae (Trypanococcus) C P

••••• Colpodea

••••••Bursariomorphida

•••••••Bryometopidae (Bryometopus, Thylakidium) P

•••••••Bursaridiidae (Bursaridium, Paracondylostoma) P

•••••••Bursariidae (Bursaria) P

••••••Colpodida (smaller species <20 µm are probably ingesting primarily bacteria)

Incertae sedis Colpodida: Bardeliellidae, Hausmanniellidae, Ilsiellidae, Marynidae, Pseudochlamydonellidae. O

•••••••Bryophryina

••••••••Bryophryidae (Bryophrya) O

••••••••Sandmanniellidae (Sandmanniella) O

•••••••Colpodina

••••••••Colpodidae (Colpoda) O

••••••••Grandoriidae (Grandoria) O

••••••••Tillinidae (Tillina) O

••••••• Grossglockneriidae (Grossglockneria, Pseudoplatyophrya) F

••••••Cyrtolophosidida

•••••••Cyrtolophosididae (Cyrtolophosis) O

•••••••Kreyellidae (Kreyella) O

••••••Platyophryida (C ingest small green algae)

•••••••Ottowphryidae (Ottowphrya, Platyophryides) C

•••••••Platyophryidae (Platyophrya) C

•••••••Sagittariidae (Sagittaria) C

•••••••Sorogenidae (Sorogena) C

•••••••Woodruffiidae (Etoschophrya, Rostrophrya, Woodruffia) C

••••• Nassophorea

••••••Colpodidiidae (Colpodidium) B

••••••Nassulida (f, cyanobacteria)

•••••••Furgasoniidae (Furgasonia, Wolfkosia) f

•••••••Nassulidae (Nassula, Obertrumia) f

••••••Microthoracida

•••••••Microthoracidae (Drepanomonas, Microthorax) f

•••••••Leptopharyngidae (Pseudomicrothorax, Leptopharynx B) f

••••• Prostomatea

•••••• Apsiktratidae (Apsikrata) O

••••••Prorodontida

•••••••Balanionidae (Balanion) C D

•••••••Cryptocaryonidae (Cryptocaryon) C D

•••••••Colepidae (Coleps, Plagiopogon) C D

•••••••Holophryidae (Holophrya) C D

•••••••Lagynidae (Lagynus) C D

•••••••Metacystidae (Metacystis, Vasicola) C D

•••••••Placidae (Placus) C D

•••••••Plagiocampidae (Plagiocampa) C D

•••••••Prorodontidae (Prorodon) C D

•••••••Urotrichidae (Urotricha) C D

••••• Plagiopylea

••••••Plagiopylida

•••••••Epalxellidae (Epalxella) B

•••••••Plagiopylidae (Plagiopyla) B

•••••••Sonderiidae (Sonderia) B

•••••••Trimyemidae (Trimyema) B

••••• Oligohymenophorea

••••••Apostomatia

•••••••Apostomatida

••••••••Colliniidae (Collinia, Metacollinia) S

••••••••Cyrtocaryidae (Cyrtocaryum) S

••••••••Foettingeriidae (Foettingeria) S

••••••••Pseudocolliniidae (Fusiforma, Pseudocollinia) S

•••••••Astomatophorida

••••••••Opalinopsidae (Opalinopsis) S

•••••••Pilisuctorida

••••••••Conidophryidae (Conidophrys) S

••••••Astomatia

•••••••Anoplophryidae 910 (Anoplophrya) S

•••••••Buetschliellidae (Buetschliella) S

•••••••Clausilocolidae (Clausilocola) S

•••••••Contophryidae (Contophyra) S

•••••••Haptophryidae (Haptophrya) S

•••••••Hoplitophryidae (Hoplitophrya) S

•••••••Intoshellinidae (Intoshellina) S

•••••••Maupasellidae (Maupasella) S

•••••••Radiophryidae (Radiophrya) S

••••••Hymenostomatia

•••••••Tetrahymenida (verify each species life cycle, macrostome stage is C)

Incertae sedis Tetrahymenida: Trichospiridae (Trichospira) B P*

••••••••Curimostomatidae (Curimostoma) B P*

••••••••Glaucomidae (Glaucoma) B P*

••••••••Spirozonidae (Spirozona) B P*

••••••••Tetrahymenidae (Tetrahymena) B P*

••••••••Turaniellidae (Colpidium, Dexiostoma, Turaniella) B P*

•••••••Ophryoglenida

••••••••Ichthyophthiriidae (Ichthyophthirius) P* P

••••••••Ophryoglenidae (Ophryoglena) P* P

••••••Peniculia

•••••••Peniculida

••••••••Clathrostomatidae (Clathrostoma) O

••••••••Frontoniidae (Disematostoma, Frontonia) O

••••••••Lembadionidae (Lembadion) O

••••••••Maritujidae (Marituja) O

••••••••Neobursaridiidae (Neobursaridium) O

••••••••Parameciidae (Paramecium) O

••••••••Paranassulidae (Paranassula) O

••••••••Stokesiidae (Stokesia) O

•••••••Urocentridae (Urocentrum) O

••••••Peritrichia

•••••••Sessilida

••••••••Astylozoidae (Astylozoon, Hastatella) O

••••••••Ellobiophryidae (Ellobiophrya) O

••••••••Epistylididae (Epistylis) O

••••••••Lagenophryidae (Lagenophrys) O

••••••••Operculariidae (Opercularia) O

••••••••Rovinjellidae (Rovinjella) O

••••••••Scyphidiidae Kahl, 133 (Scyphidia) O

••••••••Termitophryidae (Termitophrya) O

••••••••Usconophryidae (Usconophrys) O

••••••••Vaginicolidae (Cothurnia, Pyxicola, Thuricola, Vaginicola) O

••••••••Vorticellidae (Carchesium, Vorticella) O

••••••••Zoothamniidae (Haplocaulus, Zoothamnium) O

•••••••Mobilida

••••••••Polycyclidae (Polycycla) O

••••••••Trichodinidae (Trichodina) O

••••••••Trichodinopsidae (Trichodinopsis) O

••••••••Urceolariidae (Leiotrocha, Urceolaria) O

••••••Scuticociliatia

•••••••Philasterida

••••••••Cohnilembidae (Cohnilembus) O

••••••••Cryptochilidae (Cryptochilum.) O

••••••••Entodiscidae (Entodiscus) O

••••••••Entorhipidiidae (Entorhipidium) O

••••••••Orchitophryidae (Orchitophrya) O

••••••••Paralembidae (Anophrys, Paralembus) O

••••••••Parauronematidae (Parauronema) O

••••••••Philasteridae (Kahlilembus, Philaster) O

••••••••Pseudocohnilembidae (Pseudocohnilembus) O

••••••••Schizocaryidae (Schizocaryum) O

••••••••Thigmophryidae (Thigmophrya) O

••••••••Thyrophylacidae (Thyrophylax) O

••••••••Uronematidae (Uronema) C

••••••••Urozonidae (Urozona) O

•••••••Pleuronematida

••••••••Calyptotrichidae (Calyptotricha) O

••••••••Conchophthiridae (Conchophthirus) O

••••••••Ctedoctematidae (Ctedoctema) O

•••••••• Cyclidiidae (Cristigera, Cyclidium) O

••••••••Dragescoidae (Dragescoa) O

••••••••Eurystomatellidae (Eurystomatella) O

••••••••Histiobalantiidae (Histiobalantium) O

••••••••Peniculistomatidae (Peniculistoma) O

••••••••Pleuronematidae (Pleuronema) O

••••••••Thigmocomidae (Thigmocoma) O

•••••••Thigmotrichida

••••••••Ancistridae (Ancistrum) B

••••••••Hemispeiridae (Hemispeira) B

••••••••Hysterocinetidae (Hysterocineta) B

••••••••Paraptychostomidae (Paraptychostomum) B

•••••••Loxocephalida

••••••••Cinetochilidae (Cinetochilum, Sathrophilus) B

••••••••Loxocephalidae (Cardiostomatella, Dexiotricha, Loxocephalus) B