Table 4.
Gene interactions experimentally validated.
| Profile BM (miR down-regulated): | hsa-miR-200b-3p | hsa-miR-519a-3p, | hsa-miR-483-3p | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signalling Pathways Regulating Pluripotency Of Stem Cells (Hsa04550) | SMAD2/5 | |||||||||
| KLF4 | ||||||||||
| MAPK Signalling Pathway (Hsa04010) | CRKL | HSPA8 | ZAK | |||||||
| RASA2 | ||||||||||
| ELK4 | ||||||||||
| PAK2 | ||||||||||
| TAOK1 | ||||||||||
| JUN | ||||||||||
| RPS6KA3 | ||||||||||
| RAP1B | ||||||||||
| DUSP1 | ||||||||||
| HIF-1 Signalling Pathway (Hsa04066) | PLCG1 | |||||||||
| FLT1 | ||||||||||
| EIF4E2 | ||||||||||
| TGF-Beta Signalling Pathway (Hsa04350) | SMAD2/5 | |||||||||
| PPP2R1B | ||||||||||
| P53 Signalling Pathway (Hsa04115) | ZMAT3 | PTEN | ||||||||
| CDK2 | ||||||||||
| PMAIP1 | ||||||||||
| CCNE2 | ||||||||||
| SESN1 | ||||||||||
| SIAH1 | ||||||||||
| PI3K-Akt Signalling Pathway (Hsa04151) | PPP2R5E | PTEN | ||||||||
| YWHAG | ||||||||||
| CCNE2 | ||||||||||
| CDK2 | ||||||||||
| BRCA1 | ||||||||||
| EIF4E2 | ||||||||||
| PTK2 | ||||||||||
| ITGAV | ||||||||||
| PPP2R1B | ||||||||||
| EFNA1 | ||||||||||
| KDR | ||||||||||
| FLT1 | ||||||||||
| Profile A (miRs down-regulated): | hsa-miR-155-5p | hsa-miR-500a-5p | hsa-miR-146a-5p | hsa-miR-146b-5p | hsa-miR-204-5p | hsa-miR-423-5p | hsa-miR-135b-5p | hsa-miR-218-5p | hsa-miR-199b-5p | hsa-miR-708-5p |
| TGF-Beta Signalling Pathway (Hsa04350) | SP1 | RPS6KB1 | RBL1 | RBL1 | ||||||
| SMAD4 | ||||||||||
| Signalling Pathways Regulating Pluripotency Of Stem Cells (Hsa04550) | JARID2 | SMAD4 | FZD1 | SMARCAD1 | ||||||
| GSK3B | MEIS1 | |||||||||
| KAT6A | ||||||||||
| KRAS | ||||||||||
| Regulation Of Actin Cytoskeleton (Hsa04810) | PAK2 | ARPC5 | ARPC5 | WASF2 | PPP1CC | GIT1 | IQGAP1 | |||
| PAK7 | ITGA5 | ACTN1 | DIAPH1 | |||||||
| KRAS | ||||||||||
| FGF9 | ||||||||||
| Wnt Signalling Pathway (Hsa04310) | GSK3B | TBL1XR1 | SMAD4 | CCND2 | PRKACA | SENP2 | ||||
| CHD8 | FZD1 | |||||||||
| CSNK1A1 |
The genes target experimentally validated of the down-regulated miRs.