Table 1.
Phylum | Primer Sequence | |
---|---|---|
Forward | Reverse | |
Firmicutes | 5′-GGAGYATGTGGTTTAATTCGAAGCA-3′ | 5′-AGCTGACGACAACCATGCAC-3′ |
Bacteroidetes | 5′-GTTTAATTCGATGATACGCGAG-3′ | 5′-TTAASCCGACACCTCACGG-3′ |
Actinobacteria | 5′-TGTAGCGGTGGAATGCGC-3′ | 5′-AATTAAGCCACATGCTCCGCT-3′ |
δ/γ-Proteobacteria | 5′-GCTAACGCATTAAGTRYCCCG-3′ | 5′-GCCATGCRGCACCTGTCT-3′ |
16S rRNA | 5′-TCGTCGGCAGCGTCAGATGTGTATAA GAGACAGGTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3′ |
5′-GTCTCGTGGGCTCGGAGATGTGTATA AGAGACAGGGACTACHVGGGTWTCTAAT-3′ |