Table 2:

Comparative performance measures. Boldface numbers represent column-wise superior performance achievement on a particular dataset.

	PE Positive/Negative				PE Acute/Chronic
	P	R	F1	AUC	P	R	F1	AUC
Stanford test set
PEFinder	0.87	0.90	0.89	N/A	0.91	0.91	0.91	N/A
SVM	0.96	0.96	0.95	0.85	0.93	0.97	0.95	0.93
Adaboost	0.98	0.98	0.98	0.95	0.97	0.97	0.97	0.92
CNN	0.92	0.97	0.95	0.99	0.91	0.91	0.91	0.99
HNN	0.94	0.96	0.95	0.98	0.92	0.97	0.94	0.95
A-HNN	0.99	0.96	0.97	0.98	0.97	0.96	0.97	0.99
DPA-HNN	0.99	0.99	0.99	0.99	0.99	0.97	0.98	0.99
UPMC dataset
PEFinder	0.87	0.96	0.91	N/A	0.91	0.95	0.93	N/A
SVM	0.71	0.70	0.58	0.83	0.49	0.70	0.57	0.86
Adaboost	0.83	0.84	0.83	0.90	0.84	0.83	0.82	0.91
CNN	0.76	0.95	0.85	0.97	0.82	0.92	0.87	0.97
HNN	0.82	0.74	0.77	0.90	0.88	0.73	0.75	0.88
A-HNN	0.82	0.74	0.77	0.90	0.88	0.72	0.75	0.88
DPA-HNN	0.87	0.87	0.87	0.95	0.91	0.90	0.90	0.94
Duke test set
PEFinder	0.84	0.99	0.90	N/A	0.86	0.99	0.92	N/A
SVM	0.95	0.98	0.96	0.94	0.96	0.98	0.97	0.95
Adaboost	0.97	0.96	0.97	0.85	0.97	0.97	0.97	0.77
CNN	0.98	0.97	0.97	0.90	0.98	0.98	0.98	0.91
HNN	0.93	0.79	0.85	0.92	0.95	0.74	0.81	0.91
A-HNN	0.90	0.83	0.86	0.91	0.89	0.79	0.83	0.88
DPA-HNN	0.94	0.81	0.86	0.94	0.90	0.95	0.92	0.99
Colorado Childrens test set
PEFinder	0.69	0.79	0.73	N/A	0.66	0.87	0.72	N/A
SVM	0.98	0.99	0.99	0.91	0.99	0.99	0.99	0.94
Adaboost	0.99	0.98	0.99	0.97	0.99	0.99	0.99	0.98
CNN	0.99	0.95	0.96	0.97	0.99	0.98	0.98	0.99
HNN	0.99	0.99	0.99	0.99	0.56	0.74	0.60	0.81
A-HNN	0.87	0.80	0.83	0.98	0.60	0.87	0.66	0.77
DPA-HNN	0.80	0.80	0.80	0.93	0.71	0.87	0.77	0.98