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. 2019 May 28;10:492. doi: 10.3389/fgene.2019.00492

Table 2.

Group classification and length of encoding nucleotide residues (bp)/amino acids (aa) of WRKYs in pepper, tomato and potato.

WRKY group WRKY Name Length of encoding nucleotide residues (bp) and amino acids (aa) Average length
Solanaceae (bp/aa) Pepper (bp/aa) Tomato (bp/aa) Potato (bp/aa)
Group I CaWRKY13;CaWRKY21;CaWRKY24;CaWRKY25;
CaWRKY28;CaWRKY31;CaWRKY33;CaWRKY37;CaWRKY38;
CaWRKY45;CaWRKY47;CaWRKY51;CaWRKY53;
SlWRKY01;SlWRKY02;SlWRKY03;
SlWRKY04;SlWRKY05;SlWRKY14;
SlWRKY15;SlWRKY18;SlWRKY20;SlWRKY31;SlWRKY32;
SlWRKY33;SlWRKY34;SlWRKY36;SlWRKY44;StWRKY01;
StWRKY02;StWRKY03;StWRKY04;StWRKY05;
StWRKY38;StWRKY39;StWRKY40;StWRKY41;StWRKY42;
StWRKY43;StWRKY44;StWRKY58		 1305/434;1851/616;1464/487;1524/507;1647/548;1368/455;2610/869;1764/587;2232/743;1641/546;2112/703;1260/419;1473/490;1242/413;2220/739;1383/460;1527/508;1461/486;1248/415;2112/703;1791/596;1836/611;1608/535;1542/513;1590/529;1380/459;1206/401;1269/422;2247/748;2094/697;1527/508;1551/516;1356/451;1605/534;1227/408;1836/611;1791/596;1374/457;1650/549;1269/422;1404/467 1624.3/540.4 1711.6/569.5 1561/519.3 1610.1/535.7
Group II IIa CaWRKY15;CaWRKY27;CaWRKY40;CaWRKY55;
SlWRKY39;SlWRKY40;
SlWRKY43;SlWRKY45;SlWRKY46;StWRKY48;
StWRKY49;StWRKY50;StWRKY51;StWRKY52		 1083/360;1086/361;795/264;729/242;1053/350;1083/360;651/216;777/258;762/253;1083/360;1068/355;786/261;762/253;654/217 883.7/293.6 923.3/306.8 865.2/287.4 870.6/289.2
IIb CaWRKY09;CaWRKY11;CaWRKY16;CaWRKY26;CaWRKY34;
CaWRKY43;SlWRKY06;
SlWRKY09;SlWRKY16;SlWRKY17;SlWRKY72;
SlWRKY73;SlWRKY74;
SlWRKY76;StWRKY06;
StWRKY07;StWRKY08;StWRKY12;
StWRKY78;StWRKY79		 1368/455;1584/527;975/324;1896/631;1764/587;1497/498;1653/550;1428/475;1497/498;1896/631;1323/440;1575/524;1950/649;1179/392;1662/553;1806/601;1491/496;1242/413;1332/443;1584/527 1535.1/510.7 1514/503.7 1562.6/519.9 1519.5/505.5
IIc CaWRKY03;CaWRKY04;CaWRKY14;CaWRKY36;
CaWRKY39;CaWRKY44;CaWRKY54;CaWRKY56;
CaWRKY57;
CaWRKY58;CaWRKY59;CaWRKY61;SlWRKY12;
SlWRKY13;SlWRKY23;SlWRKY28;SlWRKY30;
SlWRKY38;SlWRKY47;
SlWRKY48;SlWRKY50;SlWRKY51;SlWRKY55;SlWRKY56;
SlWRKY57;SlWRKY61;SlWRKY71;SlWRKY75;
StWRKY15;
StWRKY16;StWRKY23;StWRKY24;StWRKY33;
StWRKY34;StWRKY35;StWRKY59;StWRKY60;StWRKY61;
StWRKY62;StWRKY63;StWRKY68;
StWRKY69;StWRKY80;StWRKY81		 684/227;720/239;483/160;957/318;501/166;663/220;924/307;564/187;702/233;414/137;513/170;672/223;711/236;705/234;963/320;1008/335;969/322;396/131;975/324;888/295;546/181;525/174;687/228;696/231;984/327;567/188;954/317;519/172;756/251;705/234;960/317;753/250;957/318;960/319;1005/334;1020/339;696/231;753/250;498/165;309/102;687/228;981/326;519/172;426/141 724.4/240.4 649.8/215.6 755.8/250.9 749.1/248.6
IId CaWRKY08;CaWRKY22;CaWRKY23;
CaWRKY30;CaWRKY60;SlWRKY07;
SlWRKY08;SlWRKY10;SlWRKY11;SlWRKY21;SlWRKY24;
StWRKY09;StWRKY10;
StWRKY11;StWRKY13;StWRKY14;StWRKY18;StWRKY19		 558/185;1020/339;1053/350;801/266;993/330;1056/351;981/326;1017/338;987/328;1047/348;996/331;1065/354;975/324;1005/334;1005/334;939/312;1041/346;1068/355 978.2/325.1 885/294 1014/337 1014/337
IIe CaWRKY02;CaWRKY07;CaWRKY10;CaWRKY35;
CaWRKY41;CaWRKY48;
SlWRKY22;SlWRKY25;
SlWRKY29;SlWRKY35;SlWRKY37;SlWRKY77;SlWRKY78;
SlWRKY79;StWRKY20;StWRKY36;
StWRKY46;StWRKY47;StWRKY70;StWRKY71;
StWRKY72;		 972/323;1089/362;912/303;804/267;1122/373;1149/382;1068/355;936/311;912/303;1146/381;723/240;768/255;828/275;927/308;1059/352;933/310;1242/413;735/244;900/299;771/256;627/208 934.4/310.5 1008/335 913.5/303.5 895.3/297.4
IIf CaWRKY17;SlWRKY26;StWRKY17;StWRKY22;StWRKY73 786/261;660/219;780/259;702/233;522/173 690/229 786/261 660/219 668/221.7
IIg CaWRKY19;SlWRKY62;SlWRKY63;SlWRKY64;
SlWRKY65;SlWRKY66;SlWRKY67;
SlWRKY68;SlWRKY69;StWRKY25;
StWRKY26;StWRKY27;StWRKY28;StWRKY29;StWRKY30		 1011/336;837/278;969/322;969/322;717/238;966/321;762/253;1080/359;1101/366;993/330;993/330;750/249;936/311;750/249;996/331 922/306.3 1011/336 925.1/307.4 903/300
Group III CaWRKY05;CaWRKY06;CaWRKY18;CaWRKY20;CaWRKY29;
CaWRKY32;CaWRKY42;CaWRKY49;CaWRKY50;
SlWRKY19;SlWRKY41;SlWRKY42;SlWRKY52;SlWRKY53;
SlWRKY54;
SlWRKY58;SlWRKY59;SlWRKY60;
SlWRKY80;SlWRKY81;StWRKY37;StWRKY53;StWRKY54;
StWRKY55;StWRKY56;StWRKY57;StWRKY64;StWRKY65;
StWRKY66;StWRKY67;StWRKY74;StWRKY75;StWRKY76;
StWRKY77;		 744/247;762/253;1098/365;900/299;684/227;594/197;990/329;648/215;699/232;732/243;1011/336;873/29;1062/353;1083/360;1020/339;984/327;735/244;588/195;822/273;876/291;873/290;1071/356;1041/346;891/294;906/301;996/331;1083/360;1020/339;918/305;1044/347;834/277;882/293;657/218;672/223 876.3/291.0 791/262.7 889.6/295.5 920.6/305.7
NG CaWRKY01;CaWRKY12;CaWRKY46;CaWRKY52;
SlWRKY27;SlWRKY49;SlWRKY70;StWRKY21;
StWRKY31;StWRKY32;StWRKY45		 573/190;912/303;861/286;1017/338;537/178;873/290;873/290;717/238;645/214;501/166;486/161 726.8/232.2 840.8/254.3 761.3/252.7 587.3/194.8