Table III.
Locus | Number of isolates | Specific allele copy number | Allelic diversity | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||||||
0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | ≥ 9 | |||
Type = C | ||||||||||||
INMV | ||||||||||||
X3 | 11 | 100 | 0.00 | |||||||||
3 | 11 | 100 | 0.00 | |||||||||
7 | 11 | 100 | 0.00 | |||||||||
10 | 11 | 18 | 82 | 0.32 | ||||||||
25 | 11 | 100 | 0.00 | |||||||||
32 | 11 | 100 | 0.00 | |||||||||
47 | 11 | 100 | 0.00 | |||||||||
292 | 11 | 45 | 55 | 0.54 | ||||||||
MV | ||||||||||||
MIRU 1 | 11 | 100 | 0.00 | |||||||||
MIRU 4 | 11 | 100 | 0.00 | |||||||||
259 | 11 | 100 | 0.00 | |||||||||
1067 | 11 | 91 | 9 | 0.18 | ||||||||
3527 | 11 | 100 | 0.00 | |||||||||
Type = S | ||||||||||||
INMV | ||||||||||||
X3 | 9 | 11 | 89 | 0.22 | ||||||||
3 | 9 | 11 | 78 | 11 | 0.41 | |||||||
7 | 9 | 33 | 67 | 0.50 | ||||||||
10 | 9 | 89 | 11 | 0.22 | ||||||||
25 | 9 | 11 | 89 | 0.22 | ||||||||
32 | 9 | 100 | 0.00 | |||||||||
47 | 9 | 100 | 0.00 | |||||||||
292 | 9 | 78 | 11 | 11 | 0.41 | |||||||
MV | ||||||||||||
MIRU 1 | 9 | 11 | 89 | 0.22 | ||||||||
MIRU 4 | 9 | 89 | 11 | 0.22 | ||||||||
259 | 9 | 56 | 44 | 0.55 | ||||||||
1067 | 9 | 67 | 22 | 11 | 0.55 | |||||||
3527 | 9 | 11 | 89 | 0.22 |
INMV; MV; MIRU — mycobacterial interspersed repetitive units.