Table 5.
7 mg_DCL | 7 mg_DCL | 7 mg_GAL-MSFA | 7 mg_GAL-MSFA | DC | DC | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
I_Day_0 | I_Week_4 | II_Day_0 | II_Week_4 | V_Day_0 | V_Week_4 | ||||
Bacteroidetes | Bacteroidaceae | Bacteroides | Other | 1,08 | 0,21 | 0,15 | 0,04 | 0,12 | 0,04 |
Bacteroidetes | Bacteroidaceae | Bacteroides | uniformis | 1,71 | 0,41 | 0,24 | 0,03 | 0,21 | 0,07 |
Bacteroidetes | Bacteroidaceae | Bacteroides | 7,54 | 1,84 | 8,60 | 2,57 | 1,64 | 0,57 | |
Bacteroidetes | Bacteroidaceae | Bacteroides | eggerthii | 1,43 | 0,17 | 0,01 | 0,00 | 0,30 | 0,00 |
Bacteroidetes | Prevotellaceae | Prevotella | copri | 2,05 | 22,30 | 13,55 | 12,19 | 0,28 | 2,72 |
Bacteroidetes | [Odoribacteraceae] | Butyricimonas | 0,11 | 0,01 | 0,08 | 0,03 | 0,06 | 0,01 | |
Bacteroidetes | Porphyromonadaceae | Parabacteroides | distasonis | 0,46 | 0,07 | 0,36 | 0,09 | 0,13 | 0,05 |
Bacteroidetes | Porphyromonadaceae | Parabacteroides | 0,48 | 0,05 | 0,33 | 0,10 | 0,26 | 0,32 | |
TM7 | 0,02 | 0,00 | 0,01 | 0,00 | 0,00 | 0,01 | |||
Bacteroidetes | S24-7 | 0,00 | 0,00 | 0,72 | 1,71 | 1,55 | 1,56 | ||
Bacteroidetes | [Paraprevotellaceae] | Paraprevotella | 0,58 | 0,05 | 0,11 | 0,05 | 0,04 | 0,00 | |
Bacteroidetes | Bacteroidaceae | Bacteroides | ovatus | 0,08 | 0,03 | 0,08 | 0,04 | 0,09 | 0,00 |
Bacteroidetes | Bacteroidaceae | Bacteroides | caccae | 0,09 | 0,01 | 0,09 | 0,01 | 0,04 | 0,01 |
Bacteroidetes | [Barnesiellaceae] | 0,22 | 0,06 | 0,70 | 0,07 | 0,03 | 0,01 | ||
Bacteroidetes | Prevotellaceae | Prevotella | stercorea | 0,02 | 0,00 | 1,25 | 0,52 | 0,09 | 0,13 |
Bacteroidetes | Prevotellaceae | Prevotella | 0,42 | 0,00 | 0,27 | 0,19 | 0,08 | 0,64 | |
Bacteroidetes | Rikenellaceae | 1,12 | 0,58 | 2,18 | 0,57 | 0,38 | 0,08 | ||
| |||||||||
Actinobacteria | Coriobacteriaceae | Collinsella | aerofaciens | 0,47 | 0,70 | 0,95 | 0,57 | 0,24 | 0,57 |
Actinobacteria | Coriobacteriaceae | Slackia | 0,02 | 0,06 | 0,09 | 0,09 | 0,07 | 0,15 | |
Actinobacteria | Bifidobacteriaceae | Bifidobacterium | adolescentis | 0,06 | 0,62 | 0,33 | 1,09 | 1,13 | 0,58 |
Actinobacteria | Bifidobacteriaceae | Bifidobacterium | longum | 0,37 | 0,83 | 0,09 | 0,11 | 0,23 | 0,08 |
Actinobacteria | Bifidobacteriaceae | Bifidobacterium | 0,66 | 0,42 | 0,16 | 0,54 | 1,29 | 0,41 | |
Actinobacteria | Coriobacteriaceae | 0,20 | 0,52 | 0,83 | 0,41 | 1,36 | 1,50 | ||
Actinobacteria | Coriobacteriaceae | Adlercreutzia | 0,03 | 0,03 | 0,02 | 0,01 | 0,03 | 0,05 | |
Actinobacteria | Coriobacteriaceae | Atopobium | 0,01 | 0,01 | 0,01 | 0,01 | 0,01 | 0,02 | |
Actinobacteria | Actinomycetaceae | Actinomyces | 0,03 | 0,04 | 0,02 | 0,01 | 0,02 | 0,04 | |
| |||||||||
Firmicutes | Ruminococcaceae | Ruminococcus | 1,52 | 1,01 | 1,86 | 2,11 | 1,45 | 1,92 | |
Firmicutes | Clostridiaceae | Clostridium | 0,50 | 0,29 | 0,32 | 0,45 | 0,61 | 0,75 | |
Firmicutes | Lachnospiraceae | Shuttleworthia | 0,10 | 0,12 | 0,12 | 0,10 | 0,07 | 0,09 | |
Firmicutes | 7,10 | 7,06 | 6,98 | 6,65 | 5,43 | 5,16 | |||
Firmicutes | Lachnospiraceae | Coprococcus | 2,19 | 2,06 | 1,78 | 2,06 | 1,66 | 1,76 | |
Firmicutes | Ruminococcaceae | Other | 0,83 | 1,10 | 5,54 | 3,82 | 0,87 | 0,54 | |
Firmicutes | Clostridiaceae | 1,88 | 0,99 | 0,95 | 0,75 | 0,58 | 0,94 | ||
Firmicutes | Lachnospiraceae | Blautia | 1,22 | 1,61 | 0,87 | 0,68 | 1,37 | 1,49 | |
Firmicutes | Christensenellaceae | 0,51 | 0,52 | 0,23 | 0,27 | 0,36 | 1,61 | ||
Firmicutes | Other | Other | 1,55 | 1,29 | 1,31 | 0,78 | 1,06 | 1,22 | |
Firmicutes | Erysipelotrichaceae | Catenibacterium | 0,10 | 0,79 | 0,63 | 0,38 | 0,83 | 1,11 | |
Firmicutes | Lachnospiraceae | Roseburia | 0,10 | 0,05 | 0,08 | 0,14 | 0,20 | 0,25 | |
Firmicutes | Ruminococcaceae | Ruminococcus | flavefaciens | 0,22 | 0,10 | 0,07 | 0,03 | 0,00 | 0,02 |
Firmicutes | Lachnospiraceae | Blautia | 3,78 | 5,86 | 3,08 | 2,24 | 4,21 | 4,65 | |
Firmicutes | Veillonellaceae | Dialister | 1,08 | 1,00 | 0,30 | 0,82 | 3,64 | 1,25 | |
Firmicutes | Ruminococcaceae | Faecalibacterium | prausnitzii | 2,21 | 3,35 | 1,39 | 2,43 | 2,00 | 2,34 |
Firmicutes | Ruminococcaceae | Oscillospira | 1,22 | 1,24 | 1,71 | 1,44 | 2,63 | 1,02 | |
Firmicutes | Erysipelotrichaceae | 0,06 | 0,06 | 0,08 | 0,04 | 0,06 | 0,02 | ||
Firmicutes | Streptococcaceae | Streptococcus | 0,36 | 0,59 | 0,13 | 0,21 | 0,26 | 3,29 | |
Firmicutes | Lactobacillaceae | Lactobacillus | 0,02 | 0,01 | 0,00 | 0,02 | 0,02 | 0,14 | |
Firmicutes | Ruminococcaceae | 20,67 | 19,42 | 20,96 | 30,93 | 33,04 | 26,33 | ||
Firmicutes | Lachnospiraceae | [Ruminococcus] | Other | 0,01 | 0,01 | 0,01 | 0,01 | 0,01 | 0,02 |
Firmicutes | [Mogibacteriaceae] | 0,04 | 0,05 | 0,18 | 0,11 | 0,09 | 0,11 | ||
Firmicutes | Lachnospiraceae | [Ruminococcus] | gnavus | 0,06 | 0,04 | 0,04 | 0,04 | 0,05 | 0,07 |
Firmicutes | Erysipelotrichaceae | Bulleidia | p-1630-c5 | 0,01 | 0,00 | 0,59 | 0,09 | 0,08 | 0,07 |
Firmicutes | Lachnospiraceae | Anaerostipes | 0,04 | 0,04 | 0,04 | 0,02 | 0,05 | 0,09 | |
Firmicutes | Lachnospiraceae | Dorea | 3,64 | 2,31 | 1,87 | 2,81 | 1,61 | 3,00 | |
Firmicutes | Veillonellaceae | Veillonella | dispar | 0,04 | 0,05 | 0,01 | 0,03 | 0,16 | 0,27 |
Firmicutes | Veillonellaceae | Phascolarctobacterium | 0,22 | 0,12 | 0,39 | 0,17 | 0,08 | 0,01 | |
Firmicutes | Lachnospiraceae | [Ruminococcus] | 0,27 | 0,17 | 0,20 | 0,30 | 0,24 | 0,41 | |
Firmicutes | Clostridiaceae | Other | Other | 0,06 | 0,03 | 0,03 | 0,01 | 0,01 | 0,01 |
Firmicutes | Lachnospiraceae | Coprococcus | Other | 0,53 | 0,37 | 0,13 | 0,22 | 0,21 | 0,25 |
Firmicutes | Lachnospiraceae | Lachnospira | 0,73 | 0,36 | 0,25 | 0,11 | 0,44 | 0,84 | |
Firmicutes | Lachnospiraceae | Other | Other | 7,50 | 5,93 | 4,84 | 5,90 | 6,08 | 10,35 |
Firmicutes | Erysipelotrichaceae | [Eubacterium] | biforme | 0,14 | 0,13 | 0,53 | 0,27 | 0,09 | 0,32 |
Firmicutes | Lachnospiraceae | 11,09 | 9,48 | 7,01 | 8,05 | 6,73 | 9,18 | ||
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Proteobacteria | Enterobacteriaceae | 0,35 | 0,08 | 0,67 | 0,74 | 2,51 | 0,65 | ||
Proteobacteria | Alcaligenaceae | Sutterella | 0,07 | 0,04 | 0,04 | 0,06 | 0,03 | 0,19 | |
Proteobacteria | Desulfovibrionaceae | Bilophila | 0,01 | 0,01 | 0,02 | 0,01 | 0,02 | 0,01 | |
| |||||||||
Tenericutes | 0,14 | 0,16 | 0,18 | 0,12 | 0,40 | 1,44 | |||
| |||||||||
Verrucomicrobia | Verrucomicrobiaceae | Akkermansia | muciniphila | 2,02 | 2,68 | 0,17 | 0,12 | 5,41 | 4,58 |