TABLE 2.
Host specificity of sewage-associated marker genes in nonhuman fecal samples
| Nonhuman fecal samples/performance characteristic | No. of samples collected | No. (%) of samples positive for marker gene: |
|||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| HF183 | BacV6-21 | Lachno3 | HAdV | HPyV | CPQ_056 | ||
| Birds | 30 | 0 (0) | 13 (43.3) | 2 (6.66) | 0 (0) | 1 (3.33) | 0 (0) |
| Cat | 20 | 1 (5) | 0 (0) | 1 (7.14) | 0 (0) | 0 (0) | 5 (25) |
| Cow | 30 | 0 (0) | 1 (3.33) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| Chicken | 30 | 5 (16.6) | 12 (40.0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| Deer | 30 | 0 (0) | 0 (0) | 3 (10.0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| Dog | 30 | 0 (0) | 4 (13.3) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| Emu | 20 | 4 (20) | 4 (20) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| Goat | 10 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| Horse | 30 | 0 (0) | 0 (0) | 11 (36.7) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| Kangaroo | 30 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| Koala | 15 | 2 (13.3) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| Pig | 35 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| Sheep | 30 | 0 (0) | 1 (3.33) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| Waterfowl | 20 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| True negative | 347 | 325 | 342 | 360 | 358 | 355 | |
| False positive | 12 | 35 | 17 | 0 | 1 | 5 | |
| Host specificity | 0.96 | 0.90 | 0.95 | 1.00 | 0.99 | 0.98 | |