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. 2014 Jun 18;34(25):8432–8448. doi: 10.1523/JNEUROSCI.1105-14.2014

Table 1.

List of PCR primers

Target Forward primer Reverse primer Product (in bp)
Primers for genotyping
    Raptor 5′-ATGGTAGCAGGCACACTCTTCATG-3′ 5′-GGGAGATGTGACCTTAACCAGCTTC-3′ WT : 141
Flox : 228
    Rictor 5′-TTATTAACTGTGTGTGGGTTG-3′ 5′-CGTCTTAGTGTTGCTGTCTAG-3′ WT : 197
Flox : 295
    TSC1 5′-GTCACGACCGTAGGAGAAGC-3′ 5′-GAATCAACCCCACAGAGCAT-3′ WT : 193
Flox : 230
    Cre 5′-ACCAGGTTCGTTCACTCATGG-3′ 5′-AGGCTAAGTGCCTTCTCTACA-3′ KI : 200
    CNPcre 5′-GATGGGGCTTACTCTTGC-3′ 5′-CATAGCCTGAAGAACGAGA-3′ KI : 900
Primers for RT-PCR
    GAPDH 5′-CGTCCCGTAGACAAAATGGT-3′ 5′-TTGATGGCAACAATCTCCAC-3′
    PLP 5′-GTTCCAGAGGCCAACATCAAGCTC-3′ 5′-AGCCATACAACAGTCAGGGCATAG-3′
    MOG 5′-TGCACCGAAGACTGGCAGGAC-3′ 5′-AAGGACCTGCTGGGCTCTCCT-3′
    MAG 5′-TGCCTTCAACCTGTCTGTG-3′ 5′-CGGGTTGGATTTTACCACAC-3′
    MBP 5′-GGCCTCAGAGGACAGTGATG-3′ 5′-TCTGCTGTGTGCTTGGAGTC-3′
    MRF 5′-GTATGACGCTAACTACAAGGAGCTGCC-3′ 5′-CGGTCACCTGGAAGTGGTTCTTCTTC-3′
    HMGCR 5′-CACAATAACTTCCCAGGGGT-3 5′-GGCCTCCATTGAGATCCG-3′
    SCAP 5′-CTGCTACCCGCTGCTGAA-3′ 5′-AGAATTCCACAGGTCCCGTTC-3′
    IDI1 5′-TCAACTTCATGTTCACCCCA-3′ 5′-GAGTTGGGAATACCCTTGGA-3′
    SCD1 5′-CAGCCGAGCCTTGTAAGTTC-3′ 5′-GCTCTACACCTGCCTCTTCG-3′
    S1P 5′-GGTGCTGGAGTGCGGGGTTC-3′ 5′-ACCCCAGGAAGTCTCCGGGC-3′
    S2P 5′-TCACCAGTCCAGCAGCTAAGGA-3′ 5′-GCCTCTGGGTCCAATGGCAGG-3′
    Lipin-1 5′-GCTTTTGGGAACCGTGC-3′ 5′-ACCACTTCGCAGAGCCGCAC-3′
    PGC-1α 5′-ACACACCGCAATTCTCCCTT-3′ 5′-TTTGGCCCTTTCAGACTCCC-3′
    PPARγ 5′-ATTGAGTGCCGAGTCTGTGG-3′ 5′-GCAAGGCACTTCTGAAACCG-3′
    Sox10 5′-CATGTCAGATGGGAACCCAGAGCACC-3′ 5′-TTGCCGAAGTCGATGTGGGGCTTC-3′
    YY1 5′-AAGACCCTGGAGGGCGAGTT-3 5′-TCCAGGAGGGAGTTTCTTGCCT-3′
    Olig2 5′-CGCAGCGAGCACCTCAAATC-3′ 5′-TCATCGGGTTCTGGGGACGA-3′
    Srebp2 5′-CCC ACT CAG AAC ACC AAG CA-3′ 5′-AGTAGCTCGCTCTCGTTGGC-3′
    Srebp1c 5′-GCCATGGATTGCACATTTGA-3′ 5′-TGGTTGTTGATGAGCTGGAGC-3′
    Srebp1a 5′-GAACAGACACTGGCCGAGATG T-3′ 5′-GGTTGTTGATGAGCTGGAGCA T-3′
    FASN 5′-CAGCAGAGTCTACAGCTACCT-3′ 5′-ACCACCAGAGACCGTTATGC-3′
    Rxr α 5′-GTTGGAGAGTTGAGGGACGA-3′ 5′-GGGCATGAGTTAGTCGCAGA-3′
    Rxr β 5′-GTCCACAGGCATCTCCTCAG-3′ 5′-ACTGGCATGAAAAGGGAGG-3′
    Rxr γ 5′-CAAGGCTACTGAAGGGCTCA-3′ 5′-GCAGCCAACATGTATGGAAA-3′
    Rar α 5′-GGGAGGGCTGGGTACTATCT-3′ 5′-AGCACCAGCTTCCAGTCAGT-3′
    Rar β 5′-CTCTGTGCATTCCTGCTTTG-3′ 5′-AAGTGCTTTGAAGTGGGCAT-3′
    Rar γ 5′-CGAGCTGGTGCTCTGTGTC-3 5′-ACCATTTGAGATGCTGAGCC-3′
    Lxr α 5′-GCCCTGCACGCCTACGT-3′ 5′-TAGCATCCGTGGGAACATCA-3′
    Lxr β 5′-GCTGATGATCCAGCAGTTAG-3′ 5′-CGGAGAAAGATCGTTTGTTG-3′
    Insig2a 5′-CCCTCAATGAATGTACTGAAGGATT-3′ 5′-TGTGAAGTGAAGCAGACCAATGT-3′
    Insig2 5′-TGGGTACCACCATGCTGCGG-3′ 5′-TACCCACGAACACCGCCACG-3′
    Insig1 5′-TCGTTGGCATCAACCACGCCA-3′ 5′-GGCCGCTTCGGGAACGATCA-3′