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. 2019 Jul 5;14(7):e0219292. doi: 10.1371/journal.pone.0219292

Table 2. Detection of different rabies positive and negative field samples using RT-RPA and qRT-PCR.

Laboratory number Country Host RT-RPA qRT-PCR
Result Time Result Copy nrh Cp Timeg
99/14a Lesotho Canine Pos 5 Pos 1,90E7 14,8 46,8
60/14a Lesotho Bovine Pos 5 Pos 2,27E6 18,2 50,5
45a/14a Lesotho Bovine Pos 4 Pos 2,92E7 14,2 46,0
45b/14a Lesotho Bovine Pos 3,7 Pos 6,69E7 12,9 44,6
08/14a Lesotho Bovine Pos 3,7 Pos 9,13E7 12,4 44,1
195/14a Lesotho Bovine Pos 3,7 Pos 6,63E7 12,9 44,6
190/12a Lesotho Caprine Pos 4 Pos 3,62E7 13,8 45,7
21/15a Lesotho Bovine Pos 15,3 Pos 4,00E4 24,6 57,5
24/15a Lesotho Canine Pos 5,3 Pos 4,86E5 20,6 53,2
17/15a Lesotho Canine Pos 5,7 Pos 5,06E5 20,6 53,1
22/16a Lesotho Bovine Pos 5,3 Pos 8,83E5 19,7 52,1
298/93b Mozambique Canine Pos 5 Pos 4,00E5 20,9 53,5
186/99b Mozambique Canine Pos 5,3 Pos 3,90E5 21,9 54,6
572/99b Mozambique Canine Pos 4,7 Pos 8,50E5 19,8 52,2
633/00b Mozambique Canine Pos 5,3 Pos 9,04E5 19,7 52,1
315/04b Mozambique Canine Pos 5,3 Pos 3,19E5 21,3 53,9
232/05b Mozambique Canine Pos 8,7 Pos 1,24E4 26,4 59,5
558/05b Mozambique Canine Pos 5,3 Pos 6,13E5 20,3 52,8
659/05b Mozambique Canine Pos 4,3 Pos 9,38E5 19,6 52,0
687/05b Mozambique Canine Pos 4 Pos 5,59E5 20,4 52,9
131/12b Mozambique Feline Pos 5,3 Pos 1,06E6 19,4 51,8
482/12b Mozambique Canine Pos 4,7 Pos 1,36E6 19,0 51,4
1018/12b Mozambique Bovine Pos 4,3 Pos 1,26E6 19,1 51,5
233/13b Mozambique Canine Pos 5 Pos 1,35E6 19,0 51,4
191K09c Namibia Kudu Pos 3,7 Pos 4,03E7 13,7 45,5
212K09c Namibia Kudu Pos 4 Pos 2,45E7 14,4 46,4
234K09c Namibia Kudu Pos 5,3 Pos 1,42E7 15,3 47,3
240K09c Namibia Kudu Pos 1 Pos 8,08E5 19,8 52,3
151J09c Namibia Jackal Pos 5 Pos 3,47E7 13,9 45,8
179J09c Namibia Jackal Pos 4 Pos 8,58E7 12,5 44,2
192J09c Namibia Jackal Pos 3 Pos 1,78E8 11,3 42,9
193J09c Namibia Jackal Pos 4 Pos 3,64E6 17,5 49,7
197J09c Namibia Jackal Pos 8 Pos 4,34E5 20,8 53,4
204J09c Namibia Jackal Pos 5,7 Pos 1,39E6 19,0 51,3
236J09c Namibia Jackal Pos 4 Pos 1,42E7 15,3 47,3
NIG49d Nigeria Canine Pos 18,3 Pos 7,90E8 8,9 40,3
NIG50d Nigeria Canine Pos 4,3 Pos 4,92E8 9,7 41,2
NIG65d Nigeria Canine Pos 2 Pos 2,66E8 10,7 42,2
NIG95d Nigeria Canine Pos 1 Pos 1,11E8 12,0 43,7
NIG140d Nigeria Canine Pos 3,3 Pos 1,77E8 11,3 42,9
NIG142d Nigeria Canine Pos 3,3 Pos 6,52E8 9,3 40,7
NIG176d Nigeria Canine Pos 8 Pos 1,62E8 11,5 43,1
NIG185d Nigeria Canine Pos 3,7 Pos 5,97E8 9,4 40,8
NIG249d Nigeria Canine Pos 9 Pos 2,53E8 10,7 42,3
NIG251d Nigeria Canine Pos 8,3 Pos 5,83E8 9,4 40,9
71/14e Zimbabwe Canine Pos 4,7 Pos 1,21E7 15,6 47,6
168/14e Zimbabwe Feline Pos 15,3 Pos 2,67E3 28,9 62,2
307/15e Zimbabwe Canine Pos 13 Pos 6,28E6 16,6 48,7
406/15e Zimbabwe Canine Pos 4,7 Pos 4,27E7 13,6 45,4
424/15e Zimbabwe Canine Pos 4 Pos 2,23E7 14,6 46,5
427/15e Zimbabwe Canine Pos 14,7 Pos 9,51E7 12,3 44,0
464/15e Zimbabwe Canine Pos 4 Pos 3,70E7 13,8 45,6
515/15e Zimbabwe Canine Pos 5 Pos 1,18E7 15,6 47,6
245/16e Zimbabwe Bovine Pos 7,7 Pos 4,59E5 20,7 53,3
12/526f South Africa Caprine Pos 3,7 Pos 6,21E7 13,0 44,7
12/621f South Africa Jackal Pos 4,7 Pos 1,63E6 18,7 51,1
12/616f South Africa Jackal Pos 4,7 Pos 2,38E6 18,1 50,4
12/730f South Africa Canine Pos 3,3 Pos 8,42E7 12,5 44,2
12/849f South Africa Bovine Pos 17,3 Pos 2,08E3 29,3 62,6
15/17f South Africa Canine Pos 4,3 Pos 1,59E7 15,1 47,1
15/142f South Africa Mongoose Pos 4,3 Pos 1,26E7 15,5 47,5
15/170f South Africa Mongoose Pos 1 Pos 1,12E8 12,0 43,7
15/173f South Africa Mongoose Pos 8 Pos 2,24E8 10,9 42,5
15/181f South Africa Duiker Pos 5 Pos 4,87E6 17,0 49,2
15/182f South Africa Lynx Pos 5 Pos 2,67E7 14,3 46,2
15/295f South Africa Bovine Pos 3,7 Pos 5,11E7 13,3 45,1
15/479f South Africa Bovine Pos 5 Pos 1,17E6 19,2 51,6
15/495f South Africa Canine Pos 3,7 Pos 3,97E7 13,7 45,5
15/305f South Africa Bovine Pos 3,7 Pos 1,55E7 15,2 47,1
15/538f South Africa Bovine Pos 4,3 Pos 3,61E7 13,8 45,7
15/543f South Africa Canine Pos 5,7 Pos 5,06E5 20,6 53,1
15/553f South Africa Otter Pos 5 Pos 1,33E7 15,4 47,4
15/563f South Africa Canine Pos 3,7 Pos 1,50E6 18,9 51,2
15/595f South Africa Jackal Pos 3,7 Pos 5,02E6 13,3 45,1
15/634f South Africa Mongoose Pos 4 Pos 3,36E7 13,9 45,8
15/636f South Africa Bovine Pos 4 Pos 4,20E6 17,2 49,4
15/643f South Africa Canine Pos 4,7 Pos 4,19E6 17,2 49,4
15/644f South Africa Bovine Pos 4 Pos 8,50E8 12,5 44,2
16/010f South Africa Jackal Pos 4,7 Pos 3,76E6 17,4 49,6
16/051f South Africa Canine Pos 8 Pos 3,09E5 21,4 53,9
16/069f South Africa Jackal Pos 5,7 Pos 2,03E6 18,4 50,7
16/094f South Africa Mongoose Pos 4,3 Pos 3,29E6 17,6 49,8
16/102f South Africa Jackal Pos 4,7 Pos 8,27E6 16,2 48,2
17/298f South Africa Mongoose Pos 3,3 Pos 1,84E8 11,3 42,9
17/330f South Africa Mongoose Pos 4,7 Pos 4,44E6 17,1 49,3
17/336f South Africa Mongoose Pos 3,3 Pos 6,99E8 9,1 40,5
15/304d South Africa Jackal Pos 4 Pos 8,48E5 19,8 52,2
15/467d South Africa Canine Pos 14,3 Pos 6,69E6 16,5 48,6
15/474d South Africa Canine Pos 14,3 Pos 7,23E6 16,4 48,5
15/519d South Africa Bovine Pos 14 Pos 9,19E6 16,6 48,7
16/239d South Africa Bovine Pos 4,7 Pos 4,50E7 13,5 45,3
16/247d South Africa Canine Pos 3,7 Pos 8,37E7 12,5 44,2
16/256d South Africa Caprine Pos 3,3 Pos 1,30E8 11,8 43,5
16/260d South Africa Ovine Pos 4 Pos 9,62E7 12,3 44,0
16/286d South Africa Bovine Pos 4 Pos 4,26E7 13,6 45,4
16/318d South Africa Canine Pos 5,3 Pos 2,49E7 14,4 46,3
16/343d South Africa Bovine Pos 4,3 Pos 4,46E7 13,5 45,3
14/406d South Africa Caprine Pos 5 Pos 1,37E8 11,7 43,4
14/424d South Africa Canine Pos 4 Pos 2,80E8 10,6 42,1
15/130d South Africa Bovine Pos 4,3 Pos 1,84E7 14,9 46,9
15/205d South Africa Canine Pos 5 Pos 1,51E7 15,2 47,2
13/339f South Africa Canine Pos 1 Pos 1,88E8 11,2 42,8
13/310f South Africa Canine Pos 1 Pos 3,87E5 21,0 53,6
13/107f South Africa Canine Pos 3 Pos 5,25E8 9,6 41,0
13/522f South Africa Canine Pos 1 Pos 9,03E7 12,4 44,1
13/256f South Africa Canine Pos 1,3 Pos 4,18E8 10,0 41,4
13/355f South Africa Canine Pos 3,7 Pos 2,76E8 10,6 42,2
13/104f South Africa Canine Pos 1 Pos 3,14E8 10,4 41,9
13/79f South Africa Canine Pos 1 Pos 2,33E8 10,9 42,4
RK002 South Africa Jackal Neg Neg
RK010 South Africa Fox Neg Neg
RK018 South Africa Civet Neg Neg
RK023 South Africa Canine Neg Neg

a Obtained from the Central Veterinary Laboratory, Maseru, Lesotho; samples positive with the FAT [30] and DRIT [8]

b Obtained from the Central Veterinary Laboratory, Maputo, Mozambique; samples positive with the FAT [30] and DRIT [8]

c Obtained from the Central Veterinary Laboratory, Windhoek, Namibia; samples positive with the FAT [30] and DRIT [8]

d Obtained from the Agricultural Research Council-Onderstepoort Veterinary Research, Gauteng Province, South Africa; samples positive with the FAT [30] and DRIT [8]

e Obtained from the Central Veterinary Laboratory, Harare, Zimbabwe; samples positive with the FAT [30] and DRIT [8]

f Obtained from Allerton Provincial Veterinary Laboratory, KwaZulu-Natal Province, South Africa; samples positive with the FAT [30] and DRIT [8]

g For better comparability between assays, qRT-PCR crossing point values were converted into estimated detection time

h RNA copies/μl eluate