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. 2011 Sep 7;31(36):12802–12815. doi: 10.1523/JNEUROSCI.0898-11.2011

Table 1.

Primers used for RT-PCR and qPCR experiments

Gene Forward primer/reverse primer Length of product (bp) Tm (°C)a Cycles
Pitx3 RT-PCR (NM_019247) 5′-GAGCACAGTGACTCGGAGAAGG-3′/5′-AAGGCGAACGGGAAGGTC-3′ 413 60 28
BDNF RT-PCR (NM_012513) 5′-AGCGTGAATGGGCCCAGGGCA-3′/5′-TGTGACCGTCCCACCGGACA-3′ 369 60 28
GAPDH RT-PCR (NM_017008) 5′-CCATGTTTGTGATGGGTGTGAACCA-3′/5′-GCCAGTGGATGCAGGGATGATGTTC-3′ 251 58 22
Pitx3 qPCR (NM_019247) 5′-GAGTTTGGGCTGCTTGGTGAGGC-3′/5′-CCATGTTCTGGAAGCGGAGGGTGT-3′ 92 60 35
BDNF qPCR (NM_012513) 5′-GATGCCGCAAACATGTCTATGA-3′/5′-TAATACTGTCACACACGCTCAGCTC-3 82 60 35
Beta-actin qPCR (NM_031144) 5′-CCCGAGGCTCTCTTCCAGCC-3′/5′-TAGAGGTCTTTACGGATGTCAACGT-3′ 110 60 35

aTm, Melting temperature.