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. 2019 Jun 13;20(12):2881. doi: 10.3390/ijms20122881

Table 1.

RSCU values of TTSuV1 and TTSuVk2 and of the hosts, Sus scrofa and Sus scrofa domestica.

AA Codon TTSuV1 TTSuV2 Sus scrofa Sus scrofa domestica
F UUU 1.1 1.2 0.79 0.59
UUC 0.9 0.8 1.21 1.41
L UUA 0.93 1.73 0.32 0.3
UUG 0.32 0.21 0.67 0.49
CUU 0.79 0.57 1.35 1.41
CUC 0.99 1.51 1.35 1.41
CUA 1.74 1.68 0.33 0.28
CUG 1.22 0.29 2.68 2.92
I AUU 0.84 0.54 0.91 1.22
AUC 0.6 0.49 1.67 1.45
AUA 1.56 1.97 0.42 0.34
V GUU 0.55 0.65 0.57 0.34
GUC 0.6 0.6 1.07 1.45
GUA 1.81 2.24 0.34 0.17
GUG 1.04 0.51 2.03 2.04
S UCU 0.96 0.71 0.99 1.1
UCC 0.83 0.6 1.5 1
UCA 1.28 1.51 0.73 2.45
UCG 0.59 0.15 0.39 0.55
AGU 1.61 1.02 0.77 0.25
AGC 0.73 2 1.62 0.66
P CCU 0.6 1.57 1.05 0.84
CCC 0.86 0.42 1.46 1.59
CCA 1.9 0.64 0.94 0.91
CCG 0.65 0.71 0.56 0.66
T ACU 0.69 2.33 0.83 0.77
ACC 0.65 0.31 1.68 1.2
ACA 2.08 1.14 0.92 1.62
ACG 0.58 0.48 0.57 0.41
A GCU 0.76 2.16 0.96 0.7
GCC 1.07 0.22 1.8 1.03
GCA 1.6 1.03 0.74 1.92
GCG 0.57 0.98 0.5 0.36
Y UAU 0.57 1.14 0.73 0.69
UAC 1.43 0.86 1.27 1.31
H CAU 0.56 0.72 0.7 0.6
CAC 1.44 1.28 1.3 1.4
Q CAA 0.81 1.5 0.44 0.29
CAG 1.19 0.5 1.56 1.71
N AAU 0.77 0.93 0.79 0.82
AAC 1.23 1.07 1.21 1.18
K AAA 1.38 1.6 0.76 0.91
AAG 0.62 0.4 1.24 1.09
D GAU 0.6 0.75 0.8 0.81
GAC 1.4 1.25 1.2 1.19
E GAA 1.22 1.39 0.72 1.24
GAG 0.78 0.61 1.28 0.76
C UGU 0.88 1.3 0.79 0.81
UGC 1.12 0.7 1.21 1.19
R CGU 0.48 0.15 0.44 0.4
CGC 0.88 0.95 1.31 1.09
CGA 0.82 0.64 0.6 0.27
CGG 0.3 0.52 1.29 0.77
AGA 2.8 2.95 1.12 2.75
AGG 0.71 0.79 1.23 0.71
G GGU 0.62 0.32 0.57 0.31
GGC 0.55 0.5 1.46 0.84
GGA 2.21 2.74 0.91 1.78
GGG 0.61 0.44 1.05 1.07

Note: The most abundant synonymous codons encoding the same amino acid are represented in bold.