Table 1.

Discovery and replication analysis summary statistics for significant and suggestive genes

Gene	Discovery (UK Biobank) Beta (SE); p-value	Replication (KP) Beta (SE); p-value	Model r2	Locus	Meta p-value
MSMB	−1.63 (0.12); 2.97 × 10−41	−1.48 (0.14); 1.68 × 10−25	0.124	10q11.22	7.00 × 10−65
NCOA4	0.75 (0.06); 1.34 × 10−38	0.66 (0.06); 6.50 × 10−25	0.402	10q11.22	1.53 × 10−61
HNF1B	2.03 (0.16); 5.89 × 10−36	1.76 (0.19); 1.50 × 10−20	0.145	17q12	1.50 × 10−54
AGAP7	1.21 (0.12); 2.05 × 10−24	0.60 (0.10); 7.88 × 10−9	0.204	10q11.22	1.90 × 10−28
POU5F1B	3.64 (0.44); 8.40 × 10−17	3.42 (0.53); 1.11 × 10−10	0.033	8q24.21	6.44 × 10−26
C19orf48	2.95 (0.39); 2.46 × 10−14	2.04 (0.40); 2.50 × 10−7	0.150	19q13.33	1.34 × 10−19
KLK15	1.65 (0.23); 1.26 × 10−12	1.22 (0.27); 4.57 × 10−6	0.056	19q13.33	6.05 × 10−17
PCAT1	−1.28 (0.18); 5.01 × 10−12	−1.41 (0.21); 1.85 × 10−11	0.072	8q24.21	6.47 × 10−22
TMPRSS2	0.50 (0.08); 2.42 × 10−9	0.24 (0.08); 3.33 × 10−3	0.154	21q22.3	3.84 × 10−10
FAM57A	−0.50 (0.08); 4.23 × 10−9	−0.26 (0.10); 7.49 × 10−3	0.376	17p13.3	5.69 × 10−10
PPP1R14A	1.80 (0.31); 9.99 × 10−9	1.48 (0.37); 6.07 × 10−5	0.206	19q13.2	3.31 × 10−12
ZFP36L2	−4.06 (0.74); 4.26 × 10−8	−3.39 (0.87); 9.71 × 10−5	0.035	2p21	2.10 × 10−11
BHLHA15	1.80 (0.33); 5.18 × 10−8	0.79 (0.28); 4.24 × 10−3	0.067	7q21.3	1.34 × 10−8
GEMIN4	−2.16 (0.41); 1.39 × 10−7	−1.45 (0.48); 2.65 × 10−3	0.080	17p13.3	2.52 × 10−9
STK25	4.97 (1.02); 9.85 × 10−7	3.80 (1.01); 1.76 × 10−4	0.100	2q37.3	9.82 × 10−10
KLK1	0.36 (0.08); 7.71 × 10−6	0.31 (0.07); 6.24 × 10−6	0.143	19q13.33	2.27 × 10−10
HOXA4	−5.71 (1.31); 1.43 × 10−5	−1.89 (0.94); 0.04	0.067	7p15.2	3.13 × 10−5
VPS53	−2.30 (0.53); 1.68 × 10−5	−1.40 (0.51); 5.79 × 10−3	0.259	17p13.3	6.90 × 10−7
TIMM23	3.31 (0.79); 2.77 × 10−5	3.46 (0.93); 1.89 × 10−4	0.080	10q11.22	2.01 × 10−8