Skip to main content
. 2019 Jul 24;14(7):e0220031. doi: 10.1371/journal.pone.0220031

Table 1. Diatraea saccharalis genomic diversity estimates based on 1,331 SNP loci by sampling locations.

Location N A AR HO HE FIS
LaCocha_Co 10 1859 1.13 0.1 0.13 0.244
LaCruz_Su 5 1721 1.1 0.1 0.12 0.159
Jujuy_Su 7 1866 1.13 0.11 0.14 0.222
Perga_Co 2 1519 1.05 0.12 0.14 0.183
Qui_Co 4 1552 0.98 0.07 0.13 0.475
Araras_Su 2 1723 1.14 0.16 0.16 0.02
Goias_TBD 4 1856 1.1 0.12 0.17 0.324
Jabo_Su 52 2333 1.41 0.24 0.24 0.006
Morr_Co 4 1910 1.16 0.13 0.17 0.243
MS_TBD 9 2129 1.23 0.14 0.2 0.306
MT_TBD 5 1818 1.12 0.11 0.15 0.225
PAf_Su 3 1751 1.12 0.11 0.15 0.253
Parana_TBD 3 1847 1.16 0.14 0.16 0.175
Pira_Co 25 2118 1.32 0.19 0.19 -0.009
Pira_Su 22 2296 1.38 0.22 0.23 0.046
Rib_Su 4 1916 1.11 0.14 0.18 0.246
Rondo_Co 3 1634 1.03 0.11 0.16 0.347
SHG_Su 4 1916 1.15 0.15 0.19 0.236
SP_TBD 18 2264 1.21 0.13 0.23 0.423
ElNilo_Su 4 1438 1.01 0.05 0.07 0.326
ElPais_Su 2 1277 0.89 0.04 0.13 0.727
BGlade_Su 9 1384 0.95 0.03 0.08 0.629
Louis_Su 15 1526 1.03 0.06 0.09 0.33
Beaum_Su 13 1556 1.07 0.08 0.09 0.149
Wesl_Su 7 1472 1 0.06 0.09 0.361

N = Number of individuals, A = Number of alleles, AR = Allelic Richness, HO = Observed heterozygosity, HE = Expected heterozygosity, FIS = Inbreeding coefficient