Table 2.

Estimates of $h_g^2$ from the GRE approach, LDSC (in-sample), S-LDSC (baseline-LD/in-sample), and SumHer (in-sample) for 22 complex traits and diseases in the UK Biobank (N = 290K unrelated British individuals, M = 460K typed SNPs).

Trait	GRE	S.E.	LDSC	S.E.	S-LDSC	S.E.	SumHer	S.E.
Smoking Status	0.122	3.90E-03	0.178	7.70E-03	0.110	8.50E-03	0.132	4.30E-03
Height	0.602	4.70E-03	0.730	2.70E-02	0.555	3.10E-02	0.634	2.70E-02
BMI	0.285	4.20E-03	0.436	1.20E-02	0.289	1.70E-02	0.315	9.00E-03
WHR	0.173	4.00E-03	0.256	1.20E-02	0.184	1.60E-02	0.198	9.40E-03
Systolic Blood Pressure	0.159	4.20E-03	0.243	9.00E-03	0.134	9.70E-03	0.177	5.70E-03
Diastolic Blood Pressure	0.154	4.20E-03	0.233	8.60E-03	0.130	9.70E-03	0.170	6.40E-03
Eczema	0.116	4.20E-03	0.165	1.10E-02	0.107	1.20E-02	0.130	8.80E-03
Asthma	0.116	4.90E-03	0.163	1.20E-02	0.116	1.70E-02	0.131	1.20E-02
Hypertension	0.162	4.00E-03	0.244	9.40E-03	0.142	1.10E-02	0.180	6.10E-03
High Cholesterol	0.082	5.10E-03	0.127	1.30E-02	0.138	5.80E-02	0.088	8.30E-03
Diabetes (Any)	0.070	3.70E-03	0.093	5.90E-03	0.062	8.70E-03	0.074	5.00E-03
Type 2 Diabetes	0.071	3.80E-03	0.090	6.10E-03	0.057	8.80E-03	0.071	4.00E-03
Hypothyroidism	0.088	5.20E-03	0.142	1.30E-02	0.078	1.20E-02	0.110	1.70E-02
Thyroid Disorders	0.084	5.20E-03	0.141	1.30E-02	0.080	1.20E-02	0.110	2.00E-02
Endocrinopathies	0.069	5.10E-03	0.084	7.00E-03	0.058	9.90E-03	0.068	5.00E-03
Cardiovascular Diseases	0.143	5.30E-03	0.228	1.10E-02	0.140	1.40E-02	0.164	6.00E-03
Respiratory and ENT Diseases	0.086	5.20E-03	0.120	1.20E-02	0.079	1.40E-02	0.090	9.50E-03
Psoriasis	0.019	5.00E-03	0.071	3.10E-02	0.035	1.20E-02	0.059	4.20E-02
Dermatologic Disorders	0.023	5.00E-03	0.049	1.40E-02	0.034	9.90E-03	0.031	1.10E-02
Rheumatoid Arthritis	0.008	5.00E-03	0.041	2.10E-02	0.010	7.90E-03	0.021	1.20E-02
Autoimmune Disorders (Broad)	0.063	5.10E-03	0.105	1.20E-02	0.050	9.50E-03	0.079	1.70E-02
Autoimmune Disorders (Certain)	0.015	5.00E-03	0.052	2.60E-02	0.005	7.60E-03	0.047	3.40E-02