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. 2019 Jul 2;20(3):2177–2188. doi: 10.3892/mmr.2019.10455

Table I.

Primer sequences for SNP genotyping.

Gene SNPs Primer sequence Annealing temperature (°C)
APOBEC3A rs7286317 F: 5′-ACGTTGGATGGTCAGGAGATCGAGACCATC-3′ 45.1
R: 5′-ACGTTGGATGCACGCCTGGCTAATTTTTTG-3′
rs7290153 F: 5′-ACGTTGGATGGGAAGATTCTTAATTTTGTG-3′ 45.5
R: 5′-ACGTTGGATGGATTATGCTCAATATTCTCAG-3′
APOBEC3B Rs2267398 F: 5′-ACGTTGGATGTTCTCCCTTCCTTGGTGTCG-3′ 46.1
R: 5′-ACGTTGGATGATGCGTCCCCTCTTCCAAC-3′
rs2267401 F: 5′-ACGTTGGATGTCTCTCAGCTGGGTCTGGA-3′ 52.4
R: 5′-ACGTTGGATGGGACCCAACGGAATTGCAAA-3′
rs2076109 F: 5′-ACGTTGGATGAGAGGAAGCACATTTCTGCG-3′ 49.6
R: 5′-ACGTTGGATGTGCTCCCCCTCTCAGAGCAT-3′
APOBEC3H Rs56695217 F: 5′-ACGTTGGATGCCTTGTAATTTGCCCACCTC-3′ 47.0
R: 5′-ACGTTGGATGAAGAACAAAGGCCAGATGCG-3′
Rs139292 F: 5′-ACGTTGGATGTCAGCTGGTAACACAAGAGG-3′ 58.2
R: 5′-ACGTTGGATGAGCCGAAACATTCCGCTTAC-3′
Rs139297 F: 5′-ACGTTGGATGTTGCACCAGTGGTAGTACAG-3′ 48.9
R: 5′-ACGTTGGATGGCTGGTTGACTTCATCAAGG-3′
Rs139302 F: 5′-ACGTTGGATGCAGGACAGTGCCTCACCTT-3′ 49.1
R: 5′-ACGTTGGATGCCTTCAACCCCTATAAGATG-3′
Rs139316 F: 5′-ACGTTGGATGCCAGGGAAAGTCATCTTGAG-3′ 46.7
R: 5′-ACGTTGGATGAAGAAGTTTGCAGCTTGGAC-3′

SNP, single nucleotide polymorphism; F, forward; R, reverse; APOBEC3, apolipoprotein B mRNA-editing catalytic polypeptide-like 3.

HHS Vulnerability Disclosure