Table 1.

Engineered sequences on donor DNA.

CpG position		−58 −43 • −24 −19 *
Wild type DNA sequence		ACCGTCCCTAGGTGAGCCGTCTTTCCACCAGGCCCCCGGCTCGGG--------AGGGCTGGAGCCGGG
Donor DNA	AA	ACAATCCCTAGGTGAGCAATCTTTCCACCAGCCCCCAAGCTAAGG--------AGGGCTCGAGCCGGG
	AG	ACAGTCCCTAGGTGAGCAGTCTTTCCACCAGCCCCCAGGCTAGGG--------AGGGCTCGAGCCGGG
	CA	ACCATCCCTAGGTGAGCCATCTTTCCACCAGCCCCCCAGCTCAGG--------AGGGCTCGAGCCGGG
	CT	ACCTTCCCTAGGTGAGCCTTCTTTCCACCAGCCCCCCTGCTCTGG--------AGGGCTCGAGCCGGG
	TA	ACTA TCCCTAGGTGAGCTATCTTTCCACCAGCCCCCTAGCTTAGG--------AGGGCTCGAGCCGGG
CpG position		−470     *      −359   −326  −314  −290  −228   −203  −190
Wild type DNA sequence		ACGG----- TCAATGGA------CCGA---GCGA--CCGA--CCGG---CCGT----ACGT---CCGT
Donor DNA	CC	ACCG----- TCCATGGA------CCCA---GCCA--CCCA--CCCG---CCCT----ACCT---CCCT
	GG	AGGG----- TCCATGGA------CGGA---GGGA--CGGA--CGGG---CGGT----AGGT---CGGT
	CC/GG	AGGG----- TCCATGGA------CCCA---GGGA--CCCA--CCCG---CCGT----AGGT---CCCT

^●The site is the PAM sequence for the sgRNA2/Cas9. *The sites are modified for the introduction of the restriction enzyme site as a reporter.