Table 4.
Pvs25 amino acid variation in present study and among worldwide isolates
| Geographical regions | SS | EGF-1 | EGF-2 | EGF-3 | EGF4 | Refs | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | ||
| 0 | 3 | 3 | 7 | 8 | 9 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 7 | 7 | ||
| 2 | 5 | 8 | 9 | 7 | 7 | 0 | 1 | 2 | 7 | 8 | 9 | 0 | 4 | ||
| Sal-1 strain | N | L | M | C | Q | E | I | Q | S | C | A | K | C | E | |
| Present study | · | · | · | R | · | Q | T | · | · | · | · | · | · | · | |
| India | · | · | · | · | · | E/Q | T | Q/K | · | C/W | A/G | · | · | E/K | [33] |
| Iran | · | · | · | · | Q/K | E/Q | T | · | · | · | · | · | · | · | [18] |
| China | · | · | · | · | · | E/Q | T | · | · | · | · | · | · | · | [36] |
| China | · | L/M | · | · | · | E/Q | T | Q/K | · | · | · | · | · | · | [37] |
| Bangladesh | · | . | · | · | · | E/Q | T | Q/K | · | · | · | · | · | · | [24] |
| South Korea | N/D | · | · | · | · | E/Q | T | . | · | · | · | · | · | · | [25] |
| Thailand | · | · | · | · | · | E/Q | T | Q/K | · | · | · | · | · | · | [26] |
| Indonesia | · | · | · | · | · | Q | T | · | · | · | · | · | · | · | [27] |
| Mexico | · | · | · | · | Q/K | · | I/T | · | · | · | · | · | · | · | [28] |
SS secretary signal sequence; EGF EGF-like domain
· Indicates identical amino acid residues compared to the Salvador I strain