Table 3.

Genes upregulated in the TG Nav1.8-TRAP dataset

Genes	Log2 fold change	p	q	Genes	Log2 fold change	p	q
0610009B22Rik	3.295	0.001	0.031	Nap1l5	2.348	0.001	0.029
1110032A03Rik	2.542	0.007	0.059	Nbea	2.525	0.001	0.028
1110065P20Rik	5.685	0.001	0.032	Nbl1	2.738	0.015	0.085
1700037C18Rik	2.913	0.010	0.072	Ndel1	3.132	0.000	0.010
2010107E04Rik	2.008	0.000	0.016	Ndufa1	2.495	0.002	0.034
2210013O21Rik	2.570	0.006	0.056	Ndufb2	3.065	0.002	0.034
2700094K13Rik	3.894	0.004	0.049	Ndufb5	2.214	0.001	0.027
9430016H08Rik	3.239	0.016	0.089	Ndufb9	2.915	0.000	0.017
Aard	7.736	0.005	0.050	Ndufs2	2.315	0.003	0.043
Acp1	2.522	0.004	0.049	Ngfr	2.166	0.011	0.075
Adam9	4.085	0.004	0.045	Nme3	11.466	0.000	0.020
Adra2c	5.673	0.001	0.025	Nrn1l	4.040	0.009	0.068
Akirin1	2.298	0.009	0.068	Nsun3	3.157	0.018	0.093
Akt1	3.554	0.006	0.058	Nt5m	3.252	0.017	0.090
Alkbh3	7.497	0.002	0.035	Nubp2	5.238	0.007	0.063
Amacr	5.927	0.013	0.082	Nudt10	4.615	0.010	0.072
Anapc13	3.962	0.015	0.087	Nudt11	3.346	0.018	0.093
Ankrd24	2.576	0.012	0.078	Nudt7	4.780	0.002	0.037
Anxa5	2.142	0.004	0.047	Nup37	4.108	0.000	0.017
Apip	7.421	0.003	0.042	Ost4	2.585	0.004	0.050
Apln	4.200	0.009	0.069	Ostf1	2.376	0.003	0.042
Arl5a	2.178	0.002	0.038	Pacsin1	2.217	0.016	0.089
Arl6	4.831	0.003	0.042	Pak1	5.331	0.006	0.056
Arl8a	2.045	0.008	0.066	Pak3	3.228	0.009	0.069
Armc1	2.080	0.016	0.089	Parp3	2.863	0.010	0.072
Arpc1b	3.965	0.000	0.020	Pcbd2	3.529	0.002	0.037
Arpc5l	2.223	0.002	0.039	Pcolce2	3.567	0.003	0.042
Asna1	3.806	0.010	0.073	Pcp4l1	3.151	0.004	0.045
Atg4c	4.484	0.001	0.028	Pcsk1n	2.681	0.010	0.072
Atox1	2.116	0.010	0.072	Pcsk7	4.142	0.005	0.050
Atp5c1	2.674	0.003	0.040	Pdcd6	2.770	0.009	0.067
Atp5d	2.552	0.006	0.058	Pde6d	5.181	0.004	0.050
Atp5g1	2.613	0.003	0.040	Pdlim2	3.067	0.001	0.027
Atp5s	6.255	0.000	0.018	Pdzd9	2.834	0.005	0.050
Atp6v0d1	3.072	0.000	0.018	Pex11b	7.187	0.000	0.003
Avpi1	2.049	0.005	0.053	Pfdn1	2.368	0.013	0.082
Banf1	2.411	0.001	0.028	Pfkm	2.196	0.011	0.074
Bbs9	4.103	0.021	0.099	Phospho2	2.332	0.013	0.082
Bloc1s1	2.178	0.015	0.085	Phpt1	2.748	0.007	0.063
Bloc1s3	4.164	0.003	0.042	Pigh	2.609	0.011	0.075
Btbd2	2.239	0.002	0.036	Pin1	3.518	0.001	0.031
C77080	3.683	0.000	0.016	Pla2g16	2.041	0.017	0.091
Cacng7	2.455	0.005	0.054	Plekhb1	3.646	0.014	0.083
Calca	2.290	0.001	0.027	Plpp1	4.280	0.017	0.091
Calm2	2.036	0.014	0.085	Pole3	3.127	0.020	0.097
Camk2g	2.396	0.003	0.044	Polr2d	6.787	0.000	0.004
Cbln1	6.228	0.004	0.047	Polr2j	6.438	0.001	0.027
Ccdc88a	2.029	0.007	0.059	Polr2l	2.072	0.011	0.076
Cdc123	2.146	0.020	0.098	Polr2m	2.330	0.005	0.050
Cdk2ap1	4.137	0.003	0.040	Pomgnt1	3.461	0.020	0.099
Cdkn1b	2.713	0.001	0.024	Ppm1j	2.163	0.009	0.067
Cdr2l	2.794	0.007	0.061	Ppp2r5c	2.205	0.014	0.084
Cebpzos	3.122	0.004	0.049	Praf2	2.266	0.019	0.096
Cela1	4.351	0.004	0.049	Prkcd	2.054	0.003	0.040
Cenpq	4.971	0.002	0.037	Prkcdbp	6.444	0.002	0.035
Cfap69	3.913	0.012	0.077	Prkrir	2.325	0.008	0.064
Cfl1	2.008	0.001	0.032	Prorsd1	5.144	0.008	0.065
Chchd1	3.792	0.000	0.017	Psma1	2.561	0.017	0.091
Chchd10	3.927	0.011	0.074	Psmb11	2.717	0.000	0.021
Chchd4	2.146	0.003	0.040	Psmc3ip	6.150	0.007	0.061
Chd3os	2.704	0.003	0.040	Qars	2.763	0.012	0.079
Chmp6	2.299	0.021	0.099	Rab10	2.106	0.010	0.071
Chodl	5.030	0.016	0.089	Rab15	3.719	0.013	0.080
Chp1	4.425	0.000	0.017	Rab1a	4.034	0.008	0.064
Clmp	2.253	0.019	0.094	Rab28	2.269	0.001	0.032
Cnih2	4.508	0.007	0.061	Rab33a	3.270	0.015	0.085
Cnrip1	2.211	0.008	0.066	Rab35	2.067	0.012	0.078
Commd1	3.042	0.003	0.045	Rab4b	2.707	0.008	0.065
Commd4	2.980	0.019	0.094	Rad54l	5.057	0.001	0.026
Coq3	3.088	0.011	0.075	Rad9b	2.382	0.012	0.079
Cox6b1	2.708	0.000	0.023	Rho	4.096	0.003	0.040
Cox7a2	2.299	0.006	0.056	Rhog	4.929	0.012	0.078
Cox7b	4.295	0.000	0.017	Rnase4	2.128	0.018	0.092
Cox7c	2.255	0.001	0.028	Rnf114	3.644	0.013	0.082
Cox8a	2.576	0.000	0.021	Rnf215	4.125	0.006	0.058
Crlf2	3.905	0.011	0.075	Rnf7	2.072	0.013	0.081
Crtc2	5.091	0.001	0.023	Romo1	2.456	0.000	0.021
Crtc3	3.703	0.018	0.092	Rpl10	3.076	0.013	0.080
Ctxn3	2.686	0.000	0.023	Rpl28	2.167	0.019	0.095
Cyb5a	2.330	0.012	0.079	Rpl29	5.333	0.021	0.099
Cyc1	3.989	0.013	0.080	Rpl35	3.039	0.003	0.040
Cystm1	3.446	0.002	0.038	Rpl37	2.967	0.003	0.042
Dad1	4.088	0.006	0.056	Rpl39	3.241	0.001	0.027
Dalrd3	7.942	0.002	0.036	Rps23	2.219	0.020	0.097
Dda1	2.393	0.017	0.091	Rps29	2.912	0.002	0.037
Dlg2	4.233	0.010	0.072	Rpusd1	3.617	0.008	0.064
Dnajc12	3.352	0.016	0.088	Rraga	2.131	0.000	0.023
Dnal4	4.100	0.012	0.076	Rtn4r	2.805	0.001	0.028
Dpep2	4.510	0.001	0.026	Rxrg	4.463	0.004	0.049
Dpm3	3.461	0.019	0.095	Sac3d1	4.162	0.009	0.070
Dzank1	3.857	0.011	0.074	Sap18	3.653	0.019	0.095
Edf1	2.907	0.000	0.002	Sdhb	4.145	0.013	0.082
Eef1a1	2.126	0.016	0.088	Sdhd	2.350	0.008	0.066
Efcc1	5.725	0.001	0.032	Sec13	5.366	0.002	0.037
Eif4a3	2.748	0.008	0.066	Sec23ip	2.817	0.014	0.083
Emb	2.251	0.000	0.017	Sep15	2.455	0.009	0.068
Enox1	3.300	0.017	0.090	Sepp1	2.412	0.013	0.081
Epm2a	2.756	0.003	0.041	Serp2	3.709	0.004	0.046
Esyt1	4.806	0.004	0.045	Serping1	4.031	0.007	0.060
Exd2	5.752	0.000	0.016	Sh2d3c	3.339	0.019	0.095
Exosc6	4.476	0.005	0.053	Sh3bgrl	2.659	0.004	0.049
Fabp7	3.901	0.001	0.024	Sh3bgrl3	2.229	0.001	0.032
Fam105a	3.610	0.013	0.082	Shd	8.734	0.007	0.061
Fam188a	2.065	0.011	0.075	Shisa5	2.629	0.011	0.074
Fam58b	3.355	0.002	0.036	Sirt2	3.344	0.020	0.098
Fam89a	3.170	0.010	0.072	Sirt3	3.145	0.017	0.090
Far2	3.913	0.006	0.056	Sla2	2.598	0.002	0.037
Farp1	6.925	0.000	0.016	Slc22a17	3.985	0.018	0.092
Fbxl16	2.675	0.007	0.060	Slc24a2	2.209	0.001	0.028
Fbxo2	3.859	0.007	0.063	Slc25a3	3.404	0.006	0.058
Fbxo27	8.071	0.000	0.023	Slc25a43	2.557	0.019	0.095
Fgf9	4.057	0.007	0.063	Slc35d2	6.734	0.000	0.018
Fgfr2	6.744	0.003	0.043	Slc3a2	3.247	0.001	0.025
Fhl1	2.487	0.001	0.024	Slc45a4	2.344	0.009	0.068
Fkbp2	2.064	0.008	0.065	Slc46a3	5.451	0.003	0.040
Fsd1	2.330	0.010	0.072	Slc6a15	3.041	0.014	0.084
Fth1	3.259	0.001	0.023	Slco2b1	5.287	0.004	0.047
Fxyd6	2.042	0.006	0.056	Slitrk1	3.031	0.018	0.094
Gabrg1	3.806	0.000	0.018	Smdt1	2.724	0.000	0.019
Galnt18	2.412	0.013	0.080	Smim12	2.038	0.000	0.021
Gatad1	2.512	0.004	0.047	Smim8	2.292	0.003	0.042
Gipc1	3.901	0.018	0.093	Snapc5	2.360	0.016	0.088
Glb1l2	4.152	0.008	0.066	Snn	3.703	0.015	0.085
Gm15440	5.964	0.012	0.079	Snrpb	2.974	0.002	0.037
Gm5113	6.649	0.001	0.032	Snrpn	3.974	0.002	0.037
Gmnn	4.878	0.001	0.026	Snx3	2.491	0.002	0.037
Gng5	4.458	0.000	0.018	Spcs1	2.441	0.021	0.099
Gng8	4.700	0.006	0.057	Spon1	3.949	0.021	0.099
Golga1	3.883	0.016	0.089	Srp14	2.998	0.000	0.021
Gpr35	3.338	0.017	0.091	Ssr4	3.347	0.011	0.075
Gramd1b	2.251	0.000	0.020	Stau2	2.158	0.008	0.066
Grpel2	3.678	0.018	0.092	Strada	5.449	0.008	0.064
Gtf2i	3.014	0.011	0.075	Stx2	3.170	0.000	0.017
H2-T23	4.183	0.010	0.070	Suclg1	2.738	0.010	0.073
H2afz	2.207	0.003	0.042	Supt4a	3.527	0.001	0.032
Hist3h2ba	2.569	0.016	0.089	Tagln3	3.422	0.004	0.047
Hsbp1	2.142	0.016	0.089	Tbc1d14	2.192	0.009	0.070
Idh3b	3.457	0.001	0.025	Tfb1m	3.745	0.013	0.082
Ift122	3.334	0.011	0.074	Thoc7	2.488	0.008	0.066
Ift20	2.144	0.021	0.099	Tifab	5.602	0.004	0.045
Ift43	6.053	0.018	0.094	Timm8b	4.092	0.007	0.061
Igsf21	4.754	0.014	0.084	Tjap1	3.096	0.021	0.099
Il1rl2	8.506	0.000	0.016	Tmem106b	2.653	0.011	0.076
Imp3	2.343	0.001	0.032	Tmem199	4.071	0.014	0.084
Inpp5j	4.481	0.008	0.064	Tmem216	8.212	0.001	0.026
Isca2	2.096	0.011	0.074	Tmem230	2.058	0.006	0.058
Iscu	3.142	0.006	0.058	Tmem258	5.441	0.000	0.017
Kcnip1	5.122	0.001	0.032	Tmem53	3.911	0.009	0.069
Kcnip4	2.177	0.002	0.038	Tmem62	4.157	0.014	0.083
Kctd8	2.176	0.006	0.055	Tnfrsf1a	5.108	0.008	0.065
Klf8	4.565	0.004	0.047	Tnfsfm13	5.814	0.015	0.085
Lamtor5	2.577	0.005	0.055	Tomm7	2.169	0.000	0.017
Lcmt1	2.326	0.006	0.056	Tpd52l1	4.373	0.009	0.068
Lgals3bp	6.428	0.008	0.064	Tpgs2	3.087	0.004	0.049
Limk1	2.887	0.002	0.034	Tppp3	2.673	0.000	0.015
Lipa	2.672	0.005	0.054	Trappc1	3.056	0.019	0.095
Lix1	2.853	0.002	0.035	Trdmt1	5.930	0.000	0.021
Lrrc8a	2.077	0.000	0.018	Triap1	2.123	0.008	0.064
Ltbr	3.603	0.007	0.063	Trim12a	2.989	0.011	0.075
Lxn	2.922	0.001	0.026	Trim9	3.505	0.014	0.084
Lyrm2	4.541	0.000	0.023	Trnp1	2.255	0.003	0.040
Lyrm5	2.559	0.019	0.095	Tspan17	5.060	0.008	0.066
M6pr	2.171	0.007	0.062	Tspan3	2.352	0.003	0.040
Manbal	2.620	0.009	0.069	Tspan7	2.270	0.001	0.027
Map1lc3b	2.978	0.001	0.028	Tub	6.954	0.000	0.016
Mapkap1	2.645	0.010	0.070	Tubb4b	2.426	0.002	0.037
Mapkapk5	2.476	0.004	0.045	Tyro3	5.176	0.000	0.023
Mast2	4.666	0.004	0.049	Ubald1	3.325	0.003	0.040
Mbd2	3.693	0.012	0.078	Ubl5	2.981	0.006	0.058
Mblac2	3.198	0.007	0.063	Ulk1	2.369	0.009	0.067
Mboat7	4.459	0.005	0.055	Uqcrb	3.669	0.001	0.025
Mgst3	5.093	0.004	0.046	Uqcrfs1	2.994	0.005	0.052
Mid2	6.101	0.001	0.028	Usmg5	3.313	0.001	0.027
Minpp1	4.786	0.004	0.047	Vkorc1l1	3.000	0.010	0.072
Mipol1	3.394	0.015	0.086	Vta1	2.955	0.012	0.076
Mlf2	2.377	0.000	0.018	Vwc2l	3.597	0.010	0.071
Mob3b	3.803	0.020	0.099	Wbp1	4.041	0.019	0.095
Mrpl18	2.783	0.000	0.023	Wbp2	2.195	0.000	0.002
Mrpl27	2.877	0.013	0.081	Wdr59	3.560	0.004	0.049
Mrps14	4.314	0.004	0.049	Wfs1	4.090	0.009	0.067
Mrps36	4.605	0.006	0.058	Wisp1	5.770	0.008	0.064
Msra	3.657	0.013	0.082	Ypel3	2.511	0.003	0.042
mt-Nd2	2.268	0.007	0.063	Ywhaq	2.191	0.001	0.026
Mxd3	2.495	0.007	0.060	Zdhhc6	4.565	0.008	0.064
Mzt1	2.130	0.000	0.021	Zfp932	3.625	0.020	0.097
Naa38	4.005	0.018	0.093	Zfp944	6.108	0.006	0.056