Table 1.
List of sialylated glycans present on the CFG glycan microarray, representing about 20% of the total number of glycans present.
| Sialylated glycans on CFG array | |
|---|---|
| Neu5Aca-Sp8 | Neu5Aca2-6(Galb1-3)GlcNAcb1-4Galb1-4Glcb-Sp10 |
| Neu5Aca-Sp11 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAc-Sp12 |
| Neu5Acb-Sp8 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp12 |
| Neu5Aca2-3(6S)Galb1-4GlcNAcb-Sp8 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp12 |
| Neu5Aca2-3Galb-Sp8 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(GlcNAcb1-4)(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp21 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3(6S)GalNAca-Sp8 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAc-Sp12 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3(6S)GlcNAc-Sp8 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Man-a1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp21 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3(Fuca1-4)GlcNAcb-Sp8 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4(Fuca1-6)GlcNAcb-Sp24 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3(Fuca1-4)GlcNAcb1-3Galb1-3(Fuca1-4)GlcNAcb-Sp0 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp12 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3(Fuca1-4)GlcNAcb1-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb-Sp0 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp24 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3GalNAca-Sp14 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAc-Sp12 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3GalNAca-Sp8 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-3GlcNAcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3GalNAcb1-3Gala1-4Galb1-4Glcb-Sp0 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb1-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3GalNAcb1-4(Neu5Aca2-3)Galb1-4Glcb-Sp0 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3GalNAcb1-4Galb1-4Glcb-Sp0 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp12 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3GlcNAcb-Sp0 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3GlcNAcb1-2Mana-Sp0 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp12 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3GlcNAcb1-2Mana1-6(GlcNAcb1-4)(Neu5Aca2-3Galb1-3GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAc-Sp21 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-3GalNAca-Sp14 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3GlcNAcb1-2Mana1-6(Neu5Aca2-3Galb1-3GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAc-Sp19 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-6(Galb1-3)GalNAca-Sp14 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3GlcNAcb1-3Galb1-3GlcNAcb-Sp0 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-6(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-3)GalNAca-Sp14 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb-Sp0 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-3GalNAc-Sp14 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3GlcNAcb1-3GalNAca-Sp14 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-4Mana1-6(GlcNAcb1-4)(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-4(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2)Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp21 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3GlcNAcb1-6GalNAca-Sp14 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-6(Fuca1-2Galb1-3GlcNAcb1-3)Galb1-4Glc-Sp21 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4(6S)GlcNAcb-Sp8 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-6(Fuca1-2Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb1-3)Galb1-4Glc-Sp21 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4(Fuca1-3)(6S)GlcNAcb-Sp8 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-6(Galb1-3)GalNAca-Sp14 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb-Sp0 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-6(Galb1-3GlcNAcb1-3)Galb1-4Glcb-Sp21 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb-Sp8 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-6(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2)Mana1-6(GlcNAcb1-4)(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp21 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb1-2Mana-Sp0 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-6(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2)Mana1-6(GlcNAcb1-4)(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-4(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2)Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp21 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb1-3Galb-Sp8 | Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-6GalNAca-Sp14 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb1-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb1-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb-Sp0 | Neu5Aca2-6GalNAca-Sp8 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb-Sp8 | Neu5Aca2-6GalNAcb1-4(6S)GlcNAcb-Sp8 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb1-3GalNAca-Sp14 | Neu5Aca2-6GalNAcb1-4GlcNAcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb1-6(Galb1-3)GalNAca-Sp14 | Neu5Aca2-6GlcNAcb1-4GlcNAc-Sp21 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb1-6(Neu5Aca2-3Galb1-3)GalNAc-Sp14 | Neu5Aca2-6GlcNAcb1-4GlcNAcb1-4GlcNAc-Sp21 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4(Neu5Aca2-3Galb1-3)GlcNAcb-Sp8 | Galb1-4GlcNAcb1-6(Neu5Aca2-6Galb1-3GlcNAcb1-3)Galb1-4Glc-Sp21 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4Glcb-Sp0 | Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp12 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4Glcb-Sp8 | Mana1-6(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAc-Sp12 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb-Sp0 | Neu5Acb2-6GalNAca-Sp8 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb-Sp8 | Neu5Acb2-6(Galb1-3)GalNAca-Sp8 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana-Sp0 | Neu5Acb2-6Galb1-4GlcNAcb-Sp8 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(GlcNAcb1-4)(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp21 | Neu5Aca2-8Neu5Aca-Sp8 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4(Fuca1-6)GlcNAcb-Sp24 | Neu5Aca2-8Neu5Acb-Sp17 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp12 | Neu5Aca2-8Neu5Aca2-8Neu5Aca-Sp8 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb-Sp8 | Neu5Aca2-8Neu5Aca2-8Neu5Acb-Sp8 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-3GlcNAcb-Sp0 | Neu5Aca2-8Neu5Aca2-3Galb1-4Glcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb-Sp0 | Neu5Aca2-8Neu5Gca2-3Galb1-4GlcNAc-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb-Sp0 | Neu5Aca2-8Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAc-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp12 | Neu5Aca2-8Neu5Aca2-8Neu5Aca2-3Galb1-4Glcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb-Sp0 | Neu5Aca2-8Neu5Aca2-3Galb1-3GalNAcb1-4(Neu5Aca2-3)Galb1-4Glc-Sp21 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp12 | Neu5Aca2-8Neu5Aca2-3Galb1-3GalNAcb1-4(Neu5Aca2-8Neu5Aca2-3)Galb1-4Glcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-3GalNAca-Sp14 | GalNAcb1-4(Neu5Aca2-8Neu5Aca2-3)Galb1-4Glcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-6(Galb1-3)GalNAca-Sp14 | GalNAcb1-4(Neu5Aca2-8Neu5Aca2-8Neu5Aca2-8Neu5Aca2-3)Galb1-4Glcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-6(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAcb1-3)GalNAca-Sp14 | GalNAcb1-4(Neu5Aca2-8Neu5Aca2-8Neu5Aca2-3)Galb1-4Glcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3GalNAc-Sp14 | Galb1-3GalNAcb1-4(Neu5Aca2-8Neu5Aca2-8Neu5Aca2-3)Galb1-4Glcb-Sp21 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-4Mana1-6(GlcNAcb1-4)(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-4(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-2)Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp21 | Neu5Gca-Sp8 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-6(Galb1-3)GalNAca-Sp14 | Neu5Gca2-3Galb1-3(Fuca1-4)GlcNAcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-6(Neu5Aca2-3Galb1-3)GalNAca-Sp14 | Neu5Gca2-3Galb1-3GlcNAcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-6(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-2)Mana1-6(GlcNAcb1-4)(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp21 | Neu5Gca2-3Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-6(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-2)Mana1-6(GlcNAcb1-4)(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-4(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-2)Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp21 | Neu5Gca2-3Galb1-4GlcNAcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-6(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3)GalNAca-Sp14 | Neu5Gca2-3Galb1-4Glcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-6GalNAca-Sp14 | Neu5Gca2-6GalNAca-Sp0 |
| Neu5Aca2-3GalNAca-Sp8 | Neu5Gca2-6Galb1-4GlcNAcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3GalNAcb1-4GlcNAcb-Sp0 | Neu5Gcb2-6Galb1-4GlcNAc-Sp8 |
| GalNAcb1-4(Neu5Aca2-3)Galb1-4GlcNAcb-Sp0 | Neu5Gca2-8Neu5Gca2-3Galb1-4GlcNAc-Sp0 |
| GalNAcb1-4(Neu5Aca2-3)Galb1-4GlcNAcb-Sp8 | Neu5Gca2-8Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAc-Sp0 |
| GalNAcb1-4(Neu5Aca2-3)Galb1-4GlcNAcb1-3GalNAca-Sp14 | Neu5Gca2-8Neu5Gca2-3Galb1-4GlcNAcb1-3Galb1-4GlcNAc-Sp0 |
| GlcNAcb1-6(Neu5Aca2-3Galb1-3)GalNAca-Sp14 | Neu5Gca2-8Neu5Gca2-6Galb1-4GlcNAc-Sp0 |
| Fuca1-2Galb1-3GalNAcb1-4(Neu5Aca2-3)Galb1-4Glcb-Sp0 | Neu5,9Ac2a-Sp8 |
| Fuca1-2Galb1-3GalNAcb1-4(Neu5Aca2-3)Galb1-4Glcb-Sp9 | Neu5,9Ac2a2-6Galb1-4GlcNAcb-Sp8 |
| GalNAcb1-4(Neu5Aca2-3)Galb1-4Glcb-Sp0 | Neu5,9Ac2a2-3Galb1-4GlcNAcb-Sp0 |
| Galb1-3GalNAcb1-4(Neu5Aca2-3)Galb1-4Glcb-Sp0 | Neu5,9Ac2a2-3Galb1-3GlcNAcb-Sp0 |
| Neu5Aca2-3Galb1-3GalNAcb1-4(Neu5Aca2-8Neu5Aca2-3)Galb1-4Glcb-Sp0 | |
| Neu5Aca2-6(Neu5Aca2-3)GalNAca-Sp8 | |
| Neu5Aca2-6(Neu5Aca2-3Galb1-3)GalNAca-Sp14 | |
| Neu5Aca2-6(Neu5Aca2-3Galb1-3)GalNAca-Sp8 | Linker structures |
| Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp12 | Sp0 : -CH2CH2NH2 |
| Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-6(Neu5Aca2-3Galb1-4GlcNAcb1-2Mana1-3)Manb1-4GlcNAcb1-4GlcNAcb-Sp12 | Sp8 : -CH2CH2CH2NH2 |
| Galb1-4(Fuca1-3)GlcNAcb1-6(Neu5Aca2-6(Neu5Aca2-3Galb1-3)GlcNAcb1-3)Galb1-4Glc-Sp21 | Sp9 : -CH2CH2CH2CH2CH2NH2 |
| Neu5Aca2-6Galb1-4 GlcNAcb1-6(Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-3)GalNAca-Sp14 | Sp10 : -NHCOCH2NH |
| Neu5Aca2-6Galb-Sp8 | Sp11 : -OCH2C6H4-p-NHCOCH2NH |
| Neu5Aca2-6Galb1-4(6S)GlcNAcb-Sp8 | Sp12 : Asparagine |
| Neu5Aca2-6Galb1-4Glcb-Sp0 | Sp14 : Threonine |
| Neu5Aca2-6Galb1-4Glcb-Sp8 | Sp17 : -OCH2C6H4NH2 |
| Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb-Sp0 | Sp19 : EN or NK |
| Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb-Sp8 | Sp21 : -N(CH3)-O-(CH2)2-NH2 |
| Neu5Aca2-6Galb1-4GlcNAcb1-2Man-Sp0 | Sp24 : KVANKT |
| Neu5Aca2-6(Galb1-3)GalNAca-Sp14 | |
| Neu5Aca2-6(Galb1-3)GalNAca-Sp8 | |
See the CFG website for more information. Spacer (linker) structures are provided in the table; a- or b- in the structure and prior to the Sp designation indicates the alpha or beta linkage; (6S) indicates sulfate groups and linkage. Yellow highlight indicates the structures that specifically contain Gc sialic acid as opposed to Ac or a derivative.