Table 3. List of Type III effectors conserved according to the phylogenetic origin.
| Phylotype I and III | Phylotype IIA and IIB | Phylotype IV | “stringency 2” | |
|---|---|---|---|---|
| # strains | 36–38 | 24–25 | 20–21 | 80–84 |
| RipA2 | 38 | (21) | 21 | 80 |
| RipA3 | 36 | 21 | ||
| RipA5 | 21 | |||
| RipB | 37 | 25 | 21 | 83 |
| RipC1 | 25 | |||
| RipD | 20 | |||
| RipE1 | 24 | |||
| RipE2 | 24 | |||
| RipF1 | 25 | 20 | ||
| RipF2 | 24 | |||
| RipG2 | 36 | |||
| RipG4 | 38 | 24 | ||
| RipG5 | 38 | (23) | 21 | 82 |
| RipG6 | 37 | (23) | 21 | 81 |
| RipG7 | 37 | 24 | ||
| RipH1 | 20 | |||
| RipH2 | 36 | 25 | 21 | 82 |
| RipH3 | 36 | |||
| RipH4 | 20 | |||
| RipI | 25 | |||
| RipL | 38 | |||
| RipM | 21 | |||
| RipN | 20 | |||
| RipO1 | 24 | |||
| RipQ | 38 | |||
| RipR | 38 | 24 | 20 | 82 |
| RipS2 | 36 | |||
| RipS4 | 38 | |||
| RipS5 | 21 | |||
| RipS6 | 37 | |||
| RipU | 38 | 25 | (18) | 81 |
| RipV1 | 38 | 25 | (19) | 82 |
| RipV2 | 20 | |||
| RipW | 37 | 25 | 21 | 83 |
| RipX | 21 | |||
| RipY | 20 | |||
| RipZ | 38 | 21 | ||
| RipAB | 37 | 24 | 21 | 82 |
| RipAC | 25 | |||
| RipAD | 25 | |||
| RipAE | 24 | |||
| RipAF1 | 36 | |||
| RipAI | 36 | 25 | 21 | 82 |
| RipAJ | 38 | 25 | 21 | 84 |
| RipAK | 36 | |||
| RipAM | 38 | (23) | 21 | 82 |
| RipAN | (35) | 25 | 21 | 81 |
| RipAO | 36 | 25 | 21 | 82 |
| RipAP | 36 | 25 | ||
| RipAQ | 21 | |||
| RipAS | 36 | |||
| RipAU | 20 | |||
| RipAV | 36 | |||
| RipAY | (35) | 25 | 20 | 80 |
| RipAZ1 | 36 | 20 | ||
| RipBF | 20 | |||
| T3E_Hyp1 | 20 | |||
| Total Core T3Es | 31 | 25 | 32 | 16 |
Note:
The # strains, indicate the total number of strains analyzed and the 5% tolerance. The numbers in each cell indicate how many strains actually harbor the cognate effector. Gray scale according to conservation between columns.