Table 1.
Entire panel of analyzed isolates and serotyping results using different approaches: phenotypic serotyping and biochemical tests, xMAP® Salmonella Serotyping Assay (SSA), WGS (data analysis with SeqSero tool) and WGS (data analysis with Salmonella TypeFinder tool).
| ID | Origin | Isolation year | Phenotypic serotyping/biochemical tests | xMAP SSA | WGS (Seq Sero) | WGS (Salmonella TypeFinder) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 12/54912 | WB | 2012 | S. enterica subsp. enterica (Gr. C1 - 6,7: -: 1,5) | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/100302 | WB | 2012 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/164369 | WB | 2012 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/118163 | WB | 2012 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/95668 | WB | 2012 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/167530 | WB | 2012 | S. enterica subsp. enterica (-: -: 1,5) | -:c:1,5 | -:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/150332 | WB | 2012 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/171410 | WB | 2012 | S. enterica subsp. enterica (-: c: 1,5) | -:c:1,5 | -:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/87099 | WB | 2012 | S. enterica subsp. enterica (Gr. C1 - 6,7: -: 1,5) | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/90074 | WB | 2012 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/90639 | WB | 2012 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/164644 | WB | 2012 | S. enterica subsp. enterica (-: -: 1,5) | -:c:1,5 | -:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/78468 | WB | 2012 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/163644 | WB | 2012 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/127550 | WB | 2012 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/90090 | WB | 2012 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 12/159467 | WB | 2012 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 13/821 | WB | 2013 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 13/76379 | WB | 2013 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 13/9861 | WB | 2013 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 13/104977 | WB | 2013 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 13/66045 | WB | 2013 | S. enterica subsp. enterica (-: -: 1,5) | -:c:1,5 | -:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 14/9953 | WB | 2014 | S. enterica subsp. enterica (-: -: 1,5) | -:c:1,5 | -:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 14/28309 | WB | 2014 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 14/70644 | WB | 2014 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 14/82778 | WB | 2014 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 14/82812 | WB | 2014 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 14/98709 | WB | 2014 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 14/147295 | WB | 2014 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
| 15/37298 | WB | 2015 | S. Choleraesuis var. Kunzendorf | C1:c:1,5 | 6,7:c:1,5 | S.Choleraesuis var. Kunzendorf |
Information about origin (WB = wild boar) and year of isolation are reported.