Table 1.
Primers used in this study.
| Species | Target | Primer Name | Sequence | PCR Condition | Length | References |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ticks | 16S rDNA | 16S+1 16S-1 |
CCGGTCTGAACTCAGATCAAG CTGCTCAATGATTTTTTAAATTGCTGTGG |
95 °C 5 min, 35 × (95 °C 30 s, 57 °C 30 s, 72 °C 40 s), 72 °C 10 min | 460 bp | [17] |
| cox1 | LCO1490 HCO2198 |
GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA |
95 °C 5 min, 35 × (95 °C 30 s, 57 °C 30 s, 72 °C 40 s), 72 °C 10 min | 650 bp | [18] | |
| Ehrlichia minasensis | dsb | dsb-330 dsb-728 |
GATGATGTCTGAAGATATGAAACAAAT CTGCTCGTCTATTTTACTTCTTAAAGT |
94 °C 5 min, 35 × (94 °C 30 s, 50.5 °C 60 s, 72 °C 60 s), 72 °C 10 min | 400 bp | [19] |
| 16S rRNA | Ehr-16S-D Ehr-16S-R |
GGTACCYACAGAAGAAGTCC TAGCACTCATCGTTTACAGC |
94 °C 5 min, 35 × (94 °C 30 s, 54 °C 60 s, 72 °C 60 s), 72 °C 10 min | 345 bp | [9] | |
| groEL | Ehr-groel-F Ehr-groel-R |
GTTGAAAARACTGATGGTATGCA ACACGRTCTTTACGYTCYTTAAC |
94 °C 5 min, 35 × (94 °C 30 s, 55 °C 60 s, 72 °C 60 s), 72 °C 10 min | 590 bp | [9] | |
| trp36 | TRP36-F2 TRP36-R1 |
TTTAAAACAAAATTAACACACTA AAGATTAACTTAATACTCAATATTACT |
94 °C 5 min, 35 × (94 °C 30 s, 46 °C 60 s, 72 °C 60 s), 72 °C 10 min | 800–1000 bp | [17] |