TABLE 2.
Primer sequences of trafficking regulators and hydrolytic enzymes used for qRT-PCR
Gene | Common name | Forward primer | Reverse primer |
---|---|---|---|
Rab5a | Rab5a | 5′-GTACTACCGAGGAGCACAAG-3′ | 5′-AAGCTGTTGTCATCTGCATAG-3′ |
Rab5b | Rab5b | 5′-GACTAGCAGAAGTACAGCCAG-3′ | 5′-CAATGGTGCTTTCCTGGTATTC-3′ |
Rab11 | Rab11 | 5′-GAGCAGTAGG TGCCTTATTGG-3′ | 5′-GAACTGCCCTGAGATGACGTA-3′ |
Rab20 | Rab20 | 5′-CTGCTGCAGCGCTACATGGAGCG-3′ | 5′-CTCCGCGGCAGTACAGGGAGC-3′ |
Rab34 | Rab34 | 5′-GCAAAGTGACCCCGTGTGGCGGG-3′ | 5′-GGGCGTCCCGAAGACCACTCGG-3′ |
Lamp2 | Lysosomal membrane glycoprotein 2 | 5′-AGGGTACTTGCCTTTATGCAGAAT-3′ | 5′-GTGTCGCCTTGTCAGGTACTGC-3′ |
Lyz1 | Lysozyme 1 | 5′-CTCTCCTGACTCTGGGACTCCTC-3′ | 5′-CTGAGCTAAACACACCCAGTCAG-3′ |
Lyz2 | Lysozyme 2 | 5′-GGCCAAGGTCTACAATCGTTGTG-3′ | 5′-GCAGAGCACTGCAATTGATCCCA-3′ |
HexA | Hexosaminidase A | 5′-GCCGGCTGCAGGCTCTGGGTTTC-3′ | 5′-GCGCGGCCGAACTGACATGGTAC-3′ |
HexB | Hexosaminidase B | 5′-CCCGGGCTGCTGCTGCTGCAGG-3′ | 5′-GTGGAATTGGGACTGTGGTCGAT-3′ |
Gla | Galactosidase, α | 5′-GGCCATGAAGCTTTTGAGCAGA-3′ | 5′-AGTCAAGGTTGCACATGAAACG-3′ |
CtsD | Cathepsin D | 5′-CGTCTTGCTGCTCATTCTCGGCCT-3′ | 5′-CACTGGCTCCGTGGTCTTAGGCG-3′ |
CtsH | Cathepsin H | 5′-CTGAGAACCCTTCTTCCCAAGA-3′ | 5′-AGCAGCCAGGCCCCAGCGCACA-3′ |
CtsZ | Cathepsin Z | 5′-GGCGTCGTCGGGGTCGGTGCAG-3′ | 5′-CTGCGCCCCAGCAGAGCCAGC-3′ |