Table 2.
Occupancy rates of interactions between α4 and core β-sheet, the average distance between interacting atoms and the corresponding distance in the crystal structures.
| Interactions between α4 and core β-sheet: occupancy rate (average distance) (distance in crystal structures) | |||
|---|---|---|---|
| Interacting residues | Apo state | ATP-binding state | ADP-binding state |
| Val247–Ala243 | 90.97% (7.45 Å) (4.23 Å) | 100% (4.69 Å) (4.42 Å) | 21.04% (11.78 Å) (13.26 Å) |
| Leu248–Val238 | 99.67% (6.56 Å) (5.82 Å) | 100% (5.34 Å) (8.71 Å) | 76.92% (8.17 Å) (13.79 Å) |
| Leu248–Lys252 | 100% (5.05 Å) (4.59 Å) | 100% (5.26 Å) (10.44 Å) | 31.50% (10.64 Å) (7.20 Å) |
| Asp249–Lys252 | 90.37% (6.29 Å) (6.25 Å) | 100% (4.47 Å) (6.38 Å) | 4.70% (12.46 Å) (8.44 Å) |
| Asp249–Asn253 | 78.09% (3.40 Å) (5.49 Å) | 31.93% (4.60 Å) (4.52 Å) | 0% (13.04 Å) (12.11 Å) |
| Glu250–Tyr138 | 99.81% (2.71 Å) (4.49 Å) | 99.53% (2.76 Å) (4.08 Å) | 0% (16.48 Å) (20.64 Å) |
| Glu250–Arg203 | 100% (3.79 Å) (4.71 Å) | 99.55% (6.74 Å) (5.20 Å) | 0.29% (14.17 Å) (15.35 Å) |
| Ala251–Val238 | 100% (4.95 Å) (4.67 Å) | 100% (5.26 Å) (6.85 Å) | 63.17% (7.77 Å) (10.78 Å) |
| Ala251–Ala243 | 7.61% (10.01Å) (4.66 Å) | 100% (5.19 Å) (8.56 Å) | 0.32% (18.40 Å) (12.00 Å) |
| Ala251–Glu236 | 100% (4.10 Å) (4.55 Å) | 100% (4.88 Å) (4.04 Å) | 0% (10.39 Å) (15.34 Å) |
| Ile254–Leu139 | 99.23% (7.51 Å) (8.97 Å) | 97.35% (7.30 Å (8.56 Å) | 0% (14.15 Å) (16.43 Å) |
| Ile254–Ala233 | 100% (4.57 Å) (3.95 Å) | 100% (4.23 Å) (3.97 Å) | 26.27% (8.54 Å) (11.93 Å) |
| Ile254–Ala233 | 100% (4.22 Å) (4.13 Å) | 100% (4.00 Å) (3.66 Å) | 3.09% (10.18 Å) (9.19 Å) |
| Asn255–Glu236 | 99.55% (2.93 Å) (2.74 Å) | 81.70% (3.58 Å) (3.26 Å) | 0% (8.07 Å) (9.33 Å) |
| Asn255–Glu236 | 71.85% (2.71 Å) (2.03 Å) | 76.59% (2.76 Å) (2.09 Å) | 0% (8.51 Å) (9.40 Å) |
| Lys256–Asp140 | 63.31% (7.58 Å) (6.85 Å) | 97.81% (5.16 Å) (8.74 Å) | 62.28% (7.51 Å) (3.94 Å) |
| Ser257–His205 | 96.62% (2.08 Å) (3.10 Å) | 66.55% (2.73 Å) (2.80 Å) | 14.78% (4.00 Å) (4.45 Å) |
| Lys256–Asp279 | 74.13% (6.99 Å) (10.01 Å) | 7.77% (9.96 Å) (9.69 Å) | 77.31% (5.86 Å) (8.80 Å) |
| Leu258–Leu232 | 100% (6.13 Å) (5.94 Å) | 100% (5.45 Å) (6.00 Å) | 100% (5.89 Å) (5.68 Å) |
| Leu258–Ala233 | 100% (6.01 Å) (6.73 Å) | 100% (6.65 Å) (6.28 Å) | 100% (5.89 Å) (5.22 Å) |
| Leu258–Met282 | 99.58% (6.28 Å) (6.24 Å) | 85.48% (7.47 Å) (9.56 Å) | 99.24% (6.86 Å) (6.65 Å) |
| Ala260–Thr283 | 100% (5.05 Å) (4.54 Å) | 99.99% (5.72 Å) (4.05 Å) | 100% (4.15 Å) (4.28 Å) |
| Ala260–Ser280 | 100% (3.88 Å) (3.44 Å) | 100% (4.17 Å) (3.73 Å) | 100% (3.83 Å) (3.40 Å) |
| Leu261–Met282 | 100% (4.87 Å) (4.20 Å) | 99.98% (5.88 Å) (7.95 Å) | 100% (5.02 Å) (6.84 Å) |
| Leu261–Leu286 | 100% (7.90 Å) (7.70 Å) | 100% (7.23 Å) (6.65 Å) | 100% (6.86 Å) (8.03 Å) |
| Leu261–Phe82 | 100% (4.74 Å) (4.58 Å) | 100% (5.10 Å) (4.88 Å) | 100% (4.74 Å) (4.80 Å) |
| Leu261–Ile298 | 99.94% (6.47 Å) (6.20 Å) | 95.14% (8.05 Å) (7.24 Å) | 97.38% (7.80 Å) (5.78 Å) |
| Leu261–Ala322 | 91.16% (7.93 Å) (7.54 Å) | 65.62% (8.87Å) (8.22 Å) | 22.08% (9.50 Å) (9.96 Å) |
| Leu261–Leu232 | 100% (6.12 Å) (6.09 Å) | 100% (6.99 Å) (6.34 Å) | 100% (6.03 Å) (6.24 Å) |
| Leu261–Leu290 | 100% (7.34 Å) (7.14 Å) | 100% (6.69 Å) (6.63 Å) | 100% (7.36 Å) (6.65 Å) |
| Leu261–Phe318 | 100% (5.07 Å) (4.82 Å) | 99.84% (4.80 Å) (4.09 Å) | 91.69% (6.98 Å) (4.12 Å) |
| Leu261–Val230 | 100% (8.15 Å) (7.84 Å) | 80.87% (9.64 Å) (9.57 Å) | 100% (8.01 Å) (8.24 Å) |
| Asn263–Arg321 | 99.35% (4.18 Å) (3.93 Å) | 0% (10.02 Å) (7.65 Å) | 78.13% (5.43 Å) (5.93 Å) |
| Asn263–Asp279 | 79.78% (6.04 Å) (4.03 Å) | 99.95% (3.69 Å) (5.29 Å) | 62.39% (6.63 Å) (5.11 Å) |
| Val264–Ile9 | 90.46% (8.36 Å) (8.93 Å) | 0.26% (10.31 Å) (9.38 Å) | 27.53% (9.35 Å) (7.49 Å) |
| Val264–Val275 | 100% (5.81 Å) (5.88 Å) | 100% (6.68 Å) (5.69 Å) | 100% (5.78 Å) (5.61 Å) |
| Val264–Leu290 | 100% (6.19 Å) (6.08 Å) | 100% (6.47 Å) (5.90 Å) | 100% (6.37 Å) (5.42 Å) |
| Val264–Leu286 | 98.32% (9.25 Å) (9.02 Å) | 88.08% (9.13 Å) (8.38 Å) | 99.86% (8.59 Å) (9.19 Å) |
| Val264:CB-Pro276 | 100% (5.25 Å) (5.09 Å) | 96.77% (7.92 Å) (5.38 Å) | 100% (5.29 Å) (4.83 Å) |
| Ile265–Ile9 | 99.86% (4.82 Å) (7.29 Å) | 96.03% (6.53 Å) (4.95 Å) | 77.77% (6.47 Å) (5.40 Å) |
| Ile265–Phe318 | 54.19% (7.64 Å) (5.34 Å) | 99.91% (4.24 Å) (4.57 Å) | 80.88% (6.45 Å) (3.54 Å) |
| Ile265–Val11 | 62.44% (8.83 Å) (8.35 Å) | 2.77% (9.88 Å) (8.90 Å) | 48.86% (8.95 Å) (7.09 Å) |
| Ile265–Ala322 | 99.93% (6.16 Å) (4.42 Å) | 100% (4.92 Å) (4.30 Å) | 99.91% (5.99 Å) (6.28 Å) |
| Ile265–Ile298 | 100% (4.27 Å) (3.70 Å) | 100% (5.48 Å) (4.64 Å) | 100% (4.27 Å) (3.49 Å) |
| Ile265–Leu290 | 99.79% (5.46 Å) (6.79 Å) | 100% (4.81 Å) (4.50 Å) | 99.97% (6.38 Å) (6.76 Å) |
| Ile265–Phe82 | 100% (5.07 Å) (5.62 Å) | 97.65% (6.92 Å) (5.24 Å) | 99.73% (5.46 Å) (6.43 Å) |
| Ile265–Leu232 | 21.11% (9.41 Å) (8.27 Å) | 3.82% (10.44 Å) (10.50 Å) | 57.98% (8.85 Å) (8.77 Å) |
| Ile265–Leu286 | 59.63% (8.94 Å) (9.57 Å) | 68.90% (8.75 Å) (8.47 Å) | 42.25% (9.21 Å) (10.52 Å) |
| Ser266–Arg321 | 99.91% (3.85 Å) (3.85 Å) | 84.82% (5.30 Å) (3.52 Å) | 99.04% (4.01 Å) (4.03 Å) |
| Ala267–Val275 | 100% (4.40 Å) (4.24 Å) | 100% (4.70 Å) (4.12 Å) | 100% (4.41 Å) (4.57 Å) |
| Ala267–Pro276 | 100% (4.33 Å) (3.68 Å) | 99.83% (6.16 Å) (3.84 Å) | 100% (4.21 Å) (3.59 Å) |
| Leu268–Val275 | 100% (5.21 Å) (4.80 Å) | 100% (5.03 Å) (4.48 Å) | 100% (5.07 Å) (4.74 Å) |
| Leu268–Leu290 | 100% (6.24 Å) (5.84 Å) | 100% (6.66 Å) (6.44 Å) | 100% (6.08 Å) (5.96 Å) |
| Leu268–Ile9 | 99.98% (4.83 Å) (5.06 Å) | 99.55% (7.65 Å) (7.02 Å) | 100% (5.13 Å) (4.89 Å) |
| Leu268–Pro276 | 66.18% (8.96 Å) (7.21 Å) | 1.90% (9.72 Å) (7.07 Å) | 76.95% (8.77 Å) (6.96 Å) |
| Leu268–Ala294 | 19.79% (10.30 Å) (9.27 Å) | 0% (12.33 Å) (12.28 Å) | 67.70% (8.89 Å) (9.32 Å) |
| Ala269–Ile9 | 99.01% (5.42 Å) (4.14 Å) | 0.05% (9.44 Å) (8.81 Å) | 100% (4.79 Å) (6.18 Å) |
| Ala269–Ala322 | 78.96% (7.15 Å) (6.72 Å) | 95.61% (7.38 Å) (6.93 Å) | 100% (5.47 Å) (5.02 Å) |