Table 2.

Brainstem volumes in healthy controls (HC), patients with frontotemporal dementia (FTD), patients with amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and primary lateral sclerosis (PLS). Estimated marginal means and standard error are adjusted for age, gender, education and total intracranial volume (TIV) (Covariates appearing in the model are evaluated at the following values: Age = 59.59, Gender = 1.43, Edu = 13.63, TIV = 1435355.28) Pairwise post hoc comparisons are Bonferroni corrected. Significant intergroup differences are flagged with asterisks ‘*’. Statistical trends are flagged with superscript ‘t’. ALS_T1: ALS patients first time point, ALS_T2: ALS patients second time point, FTD: patients with frontotemporal dementia, HC: healthy controls, PLS: patients with primary lateral sclerosis.

Structure	Study group	Estimated marginal means(adjusted for age, gender, education and TIV)	Standard error	ANCOVA Sig. (p)	Post-hoc comparisons (Bonferroni-corrected)
Medulla				<0.001	ALS T1 vs HCp = .061t ALS T1 vs PLSp = .002* ALS T2 vs HCp < .001* ALS T2 vs PLSp= = .057 t FTD vs PLSp = .001* HC vs PLSp < .001*
	HC	4808.641	4714.924
	ALS T1	4623.070	47.012
	ALS T2	4530.937	47.023
	FTD	4747.986	86.610
	PLS	4268.433	81.904
Pons				<0.001	ALS T1 vs PLSp = .003* ALS T2 vs HCp = .017* ALS T2 vs PLSp = .014* HC vs PLSp < .001*
	HC	15410.591	159.537
	ALS T1	14829.294	157.394
	ALS T2	14699.411	157.433
	FTD	14670.462	289.969
	PLS	13682.707	274.212
Midbrain				0.004	ALS T1 vs PLSp = .073 t HC vs PLSp = .02*
	HC	6173.757	49.524
	ALS T1	6071.860	48.859
	ALS T2	6002.527	48.871
	FTD	5994.261	90.014
	PLS	5807.431	85.122
Whole Brainstem				< 0.001	ALS T1 vs PLSp < .001* ALS T2 vs PLSp = .002* FTD vs PLSp = .058 t HC vs PLSp < .001*
	HC	22694.377	202.067
	ALS T1	22326.919	199.353
	ALS T2	22038.915	199.402
	FTD	21956.655	367.272
	PLS	20556.064	347.314